|
XB-GENEPAGE-
12531593
|
Gene Symbol: cdh1
Gene Name: cadherin 1, type 1 Synonyms: uvo , cdhe , ecad , lcam , arc-1 , cd324 , e-cadherin , uvomorulin Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: cell adhesion Protein Function  :
Cadherins are calcium-dependent cell adhesion proteins.
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: GASTRIC CANCER, HEREDITARY DIFFUSE; HDGC |
|
| Xenbase Gene ID | XB-GENE-12531594 | XB-GENE-17338470 | XB-GENE-6464305 | ||||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | cdh1 | cdh1.L | cdh1.S | ||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | Chr04 | chr4L | chr4S | ||||||||||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 8.0 JBrowse 8.0 GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | ||||||||||||||||||||||||
|
Entrez Gene
|
Entrez Gene
|
Entrez Gene
|
|||||||||||||||||||||||||
| mRNA |
NCBI Nucleotide
|
Refseq
|
|||||||||||||||||||||||||
| Protein
|
NCBI Protein
|
TrEMBL |
Refseq
Swiss-Prot
|
||||||||||||||||||||||||
| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Genome Browser |
|
|
|
||||||||||||||||||||||||
| Links |
|
||||||||||||||||||||||||||
| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Str.16081 | Xl.7483 [+] | |||||||||||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
|
|||||||||||||||||||||||||
| Images | 18 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| XenMine | cdh1 | cdh1.L | cdh1.S | ||||||||||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||||
| human |
|
||||||||||||||||||||||||||
| mouse |
|
||||||||||||||||||||||||||
| zebrafish |
|
||||||||||||||||||||||||||
| chicken |
|
||||||||||||||||||||||||||
| fruit fly |
|
||||||||||||||||||||||||||
| worm |
|
||||||||||||||||||||||||||
| Publications | |||||||||||||||||||||||||||
| First: | Expression of cell adhesion molecule E-cadherin in Xenopus embryos begins at gastrulation and predominates in the ectoderm. [J Cell Biol 1989] | ||||||||||||||||||||||||||
| Most recent: |
Direct reprogramming of fibroblasts into renal tubular epithelial cells by defined transcription factors. [Nat Cell Biol 2016]
|
||||||||||||||||||||||||||
| View All Papers 23 paper(s) referencing morpholinos | |||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| GO | 0 term | 4 terms | 4 terms | ||||||||||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | cdh1 | ||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K05689 | ||||||||||||||||||||||||||
| KOG |
[S] FOG: Cadherin repeats
|
||||||||||||||||||||||||||
| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||||||||||
| Antibody | Cdh1 Ab1 , Cdh1 Ab3 , Cdh1 Ab2 , Cdh1 Ab4 , Cdh1 Ab5 , Cdh1 Ab6 , Cdh1 Ab7 , Cdh1 Ab8 | Cdh1 Ab1 | Cdh1 Ab1 , Cdh1 Ab3 , Cdh1 Ab2 , Cdh1 Ab4 , Cdh1 Ab5 , Cdh1 Ab6 , Cdh1 Ab7 , Cdh1 Ab8 | ||||||||||||||||||||||||
| Morpholino | cdh1 MO1 | cdh1 MO1 | cdh1 MO1 | ||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Xl.7483.1.S2_at | ||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.7483.1.S2_at | ||||||||||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
