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XB-GENEPAGE-
481425
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Gene Symbol: hand2
Gene Name: heart and neural crest derivatives expressed 2 Synonyms: dhand , dhand2 , xhand2 , hand2-a , hand2-b Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: basic helix-loop-helix transcription factor Protein Function  :
Essential for cardiac morphogenesis and for the development of branchial arches. Binds DNA on E-box consensus sequence 5'-CANNTG-3'.
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: |
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1/6 | Xenbase Gene ID | XB-GENE-481426 | XB-GENE-865126 | XB-GENE-6252408 | ||||||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | hand2 | hand2.L | hand2.S | ||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | scaffold_1 | chr1L | chr1S | ||||||||||||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | ||||||||||||||||||||||||||
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Entrez Gene
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| mRNA |
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| Protein
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TrEMBL
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Swiss-Prot
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Str.43435 | Xl.770 | Xl.771 | ||||||||||||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 29 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| XenMine | hand2 | hand2.L | hand2.S | ||||||||||||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||||||||||||
| First: | A constitutive mutation of ALK5 disrupts cardiac looping and morphogenesis in mice. [Dev Biol 1998] | ||||||||||||||||||||||||||||
| Most recent: |
Noggin is required for first pharyngeal arch differentiation in the frog Xenopus tropicalis. [Dev Biol 2017]
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| View All Papers 4 paper(s) referencing morpholinos | |||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| GO | 14 terms | 6 terms | 1 terms | ||||||||||||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | hand2 | ||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K18486 | K18486 | K18486 | ||||||||||||||||||||||||||
| KOG |
[K] Transcription factor HAND2/Transcription factor TAL1/TAL2/LYL1
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | Source BioScience | |||||||||||||||||||||||||||
| Morpholino | hand2 MO1 | hand2 MO1 | hand2 MO1 | ||||||||||||||||||||||||||
| ORF | hand2 ORF1 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.24376.1.S1_at [+] | Xl.770.1.S1_at | Xl.771.1.S1_at | ||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.770.1.S1_at | Xl2.771.1.S1_at | |||||||||||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
