cdx4 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

Gene Literature (73)

XB-GENEPAGE-482786

Gene Symbol:

cdx4

Gene Name:

caudal type homeobox 4

Synonyms:

mgc68909 , mgc130769 , cad3 , Xcad3 , Xtcad3 , Xcad-3 ( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

homeodomain transcription factor

Protein Function Downloaded from UniProtKB

InterPro

FAM76B , FAM76 , TOLIP CUE , CUE [+]

Interactants:

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Diseases:

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

GEO Series GEO series in which this gene has been manipulated

GSE71006.

1/7

Xenbase Gene ID

XB-GENE-482787

XB-GENE-482791

XB-GENE-17344090

Gene Symbol

cdx4

cdx4.L

cdx4.S

Chromosome

Chr8

chr8L

chr8S

Molecules

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>cdx4 9.1 
							TGCAGGCACCTGGCCACAGCATTGTTAGTCATGTGTAGCATCAAGGCACCGGCCTAACAGAGGTCATTTGTATCGCAACTCTCATATTGACCTACTGGGCACCATAGTTGCAGAAGTATTCTTAACAGGGTTGAGGATAAAGATGACCACCAAGGATCTCGCCTAGGAATGAACATCACATGTGGGAGACAGGCTATGCACAAGGACGTTACCATGTATCCACTTTCTGTAAGATCCGCCAGCAATAACCACTCAGCGCAGAATTACGCCTCTAACCAACCTTATTTCAACTATGTTACATATCATCATGTTCCACCTATGGATGAACAAGGGCAGCCCTGTGGAGTTTGGGGACCTCAGTATGGCTCACCAAGGGAGCAATGGAACTCTTATGGAGCTGGACCTTCCAACACAAATATGGCACAATCATCTGACTTATCACCTAACCAATTTGCCTATAATTCTTCTGGCTATAGCTCCCCGCATCCATCCGGCACTGGGATTTTACACTCTGTAGATTTGTCTCACACAGCTGCCAACTCACCCAGCGATCTTAGCCAGAATTCTTATGAATGGATGGGGAAAACCGTGCAATCGACTTCTACAGGTAAGAAAAATTGTACAAAGGGAATCATTGCTCAACTGATTAAAAATAGCTTAAAATCTTGACCTTTGGCATAATTATACCCAAAATGGAGCTACAAGTTGccacttgaaaaataaaaatttgcatgtGTTTTTCCACGTTATATATATTAGGCACACCCTTTAAATGTTTAGGCCACGTGGAAACACTTCTTCtcgtaaataaatatattcttcttttttccccctaaattttatttttgtttaggaAATAATTGTGCTTTTTTAAGCAACATAACCAAATTAATAATCCTGGTATTATAATGTTTATATCCCTTCTACGATTGCCCATAGAAAGCAACAGAAAACATGAGCAAAATTCCCTTGTTAAAACACTGTAGGAAAAAGACATAGTAGGCTCTTTTTACACAGAGAGATTATAAATTACTACTTGTAGCTGGCAAGAAATAGAGTTTATTGATTCCAATGTGGCAAGTACAATATTATGGCACTAGTAAGAAACAATGAAACCTATCAACAACTAGCAGCAGTCACATTTCTTTTTTGACATAAGCCAAAGCAAGTTAGGGTGCTTTTTAACATTAGATAGTGTAGCCGAGTACATTAACGGCTATCTCCTATTGTTATTagtaacattaataaaacactGCAATTCTTGTTAAAAAAGAGTTACAACAAATGTGCCTGTCTTGATCAACAGGGAACATCACTATTTCCCTGCAgaatattattacaaagaaaccaCACTGCTTTCATATtatacatacctgtatttagtattctaaataaactaagtatttaactacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgaagctgAATAGAAAAACTGACTACTATAGTATAGCTCTAGGAATGCATATTTTTGGTTATAAAATTGTCAACTGACCATTTTAGTGGAATATGGTCAAGCTGTGCATCCTGTCAAAAGGCCTGATGTATGCCCATATAAATATGTGATGAGTGCCAGTGAGGGTCTAAATGCATGGTGTGTTTCATTATTAAATAAGGGTAATGGCTCACAAGCCTTTTGGCTCAGTGAGTGTTTTTTTCTGGGGAAAACTGAGACAACACTTTAAGAATTATCCCAGATTGCTTCATAATAGAGATACTAAAAATCACTTTTCTTATTGCAACTATAGACATGCAATCTGAGGCAGTTCCTGGTGTGTTGCTTTGTTTTAAACACAGACAAAATGCTACATATTCCACTGGCCCTAAAAATTAATGTGAAGGGGTGTTTTATTTTAGTCTTTGTGTGTGGATTTAGTCAAATTTATTGTACACAGCCTGTATGTACATGTAGTTATgcgtatataattatatattaacaaTTAGGATAGGGCTTTTTAATGTTCAACAGTGAGGGTCTCTGGCTACTGCTTTAATCTCATATATTATGAAAACAAAATTGAATATGCCCCTTCTTAGTGGGTGGATGGGGCATCCTGAGATGTGACAGTGAGATGAACTACAGCTTCACTGCTTTTTAGGCTAATGGGCATAATATCTGACTGTTGGCTGTGGGCTAAACTGTTGTTTAGAAAGGTAGGACTACGTACAGCTTCCTTAATAATTTGTTATATGATTCTTTATAGGGTTAGGTTTACCTTTTTACATTAAAGCAGAAAGGCAACCAGAAGAAAATATATGTAAGTAAAATACCTAAATTCCCTCTGATGTATGTAACAGGCCACTGAGTATAAATTCCCTAACAAAATGATCAGGAATATCCCGCCTGAGCATATCAAGCTGATGTTAGACAGCAATGCCCAGCCTTGGGCATTTATggacagaaataaatatatatatatatatatatatatatatatatatacacatacaaactgGACTTTTTCATCgagaaatacaaaataatttaggaAGTGACATATTGAATAACGAATGGGAACCTCTGCTGAATAATTTGGTTATTTTGGAAGAGCAGGCAGTTTTACCAGAGAAGTCCTATGCAAGTGAAGAGTGGCATCTGTCTgttaacccattgataaatcaGTAAAACGGTGTTTAACTCCATAACCTCTTTACTATTAGTGCTTATGGAATATACTATATGCCTGCATTTTGTCATCAATGCCCATGGCTAAAGGCATATGTTGGTGACCCCAATTCCAATGAAAGAAATAGGATGTAAGCATACTGGCTGCGTTTTTGTCATGCTAATTATAAGTGTCTTTGCAAAATAGATGTGTGGTCAGGTTTTTTTCCCTAGTCAGTTCTTGGTATTAGGGCCTATCTATCCTATAGAGGTAGCAGGCTTTTTCACACCTCTTTTCCTCTGGCTTTGATATGCagctttgtctgtttttttttttacgtgtagCCTTTTCTCCCGAGGGTATACTGTTGGGAATGGTGCTGATTTtcacagcaaataaaaaaagaccttGTCCTTTTTATTGCCTTTGGAAGACTAATCTGACTTTTACGACTAAGCTCCATAATGAAGCCTTATCTTATTTTTCCAGTTAAAGGCATAGGTAGATTTAAAAAATTCACTACAGATTGTATAAAAAGTTTGGAATTACTTATTATTTCTAAAAGTTAAGCTAATAATACATAATAGGGTATTTTTAATGTATGCTTTGACTGGGCTTTTATCCATAATCAACCACTTATTGATTGCCATTCATCTTAAACTAAAAGCAATTGGCAAGGCCATAAAGTTGGGGGCTTTGCGtgagtagcagtaacctataatGCACTGGATCTGTTCCACAATGGACATTGTTCCAAAGAATATATTACAAAAGGACTGTGGGTTTCTGGAAGTGATACAAAGGAGCCTTAAGACTAAATACCAAGGGCAACTTTGGGAAGGTgccataaataaacacaaagccATTGACCTGCTGGAGGAAAACTTCCCCAGCATGAGAGTAATTGTACTATACTGAGCAGTAGGAAGTAAATCATGGTGAAGGGTTCAACAATCTGTCAGGTATGGTAATAAGAGtggcaaagcattttttttatgtgtctACAGCATAATATATGGAACATTCCATAGCCGGCACTGTAGACAGTTGTACTGCTGACCCTTTTCAACTTTTCAGTGAATGTGCTTAACACACACATATAAGCATACATCCCTACAGTATTTAATGGGGGAACTAATTGCAGTGCTTGTGGGAATGATACTGCTTGCGACAGAAAGATGCAACTTATTGCCTGAAACAGGGACCTTGCATTTTTTAATCTACttattagccaataaaaggtatcacctactctatattttctaATTTTGCAACGTTCTAGACAATTTTGCACAAAGTTGgagggaaatgctgcattgtgtacTCTAATAATATTGAGGGTACTATTTAATATATTATCTTCCTTTATGTTATTATTCTATATTATACTGGGTAGCATTAAGAACAGTAACAATCTCTTTCCACTGATTGCAGTGAGAGCACTTACTCATGGCACACTCAGTGGGAAGCTATCCTTGCTTTTTGATCACTGCTACAAAAAAAACTTTGTGGGCCACAGACAGTACTTATAAAGCACCCCATAAATGTATGGGGAACACATATATTTAAATACCCCTACAATAGAAGATATGTTTGTTTtgacaaatatttaaaatgtttaacttGTGATAATTTACATGATACCACCATAATCCACATAACCAGAGTATAATTCAAATGTCTGCAATAAAAGGAGTTTTcatcaataaaatataatattatgttGTACAATTTGCCCAATAAAATGTAAATCTATATTATAACGCATAGGAATACAGGTATGAGGACAGTAATTATGCCTTATACCATGCATACTCAATAGATTCTGATAGAAACTTGGAGACAATTGAAAAGAAATCTTGAAAAACAAAAACTCCCAGTACTTTCTCTGAGATGAAAGAGTCTGGACCGTACAGTACTTTACAGCTTCAGCTCGTTGAAGACGTTCATTGATAAGATCACCTTGTAGCTCATTGTCTTCTCCTAGCTCAGAATTAGCACCTCAATAGAATCTGGAGGGCTCATTTAAGGAatctttgttactctgtatgattCCAAGCTCACATCAAAGAGAATTAGGAAGGATCAAAAGGAGATGGAACATCTGATTAAGCAATATAAGAAAGTAGACTTGTGTTTGTTTGTTATCCTCACAGTTGTATTGTGATTTCTTTGCTTTTCTTGGACATCCTGTCTCAGCTGAGCACCATTTCACCTGCAGCCTGGACACATAGGTGCCTAACTTAGATATAAGGCCTTTTGTTTAACTGAATTCAACCTTTTACATGTATGAATATAAGAAAGTGCATACAAATGCTCAGTCatgtttaatattattaatatacagctatggga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Version 9.2

>cdx4.L 9.2 
							CATTCTTAGTCATGTCTAGGATATAGGCACCGACCCAACAGAGGTCACTTATATAGCCAGTAGAACTATTAGACACCATAGTTGAAGAAGTATTCTTAACTGGGTTGAGAGCAAAGATGACCACCAAGGATCTAGTATAGAGATGGACATCACATGTGGGAGACAGACTATGCACAAGGACGCTACCATGTATCCACTTTCTGTAAGATCCACCAGCAACAACCACACAGCGCAGAACTACGTCTCCAATCAACCTTATTTCAACTATGTGGCGTATCATCATGTTCCACCTATGGATGACCAAGGGCAGCCCTGTGGAGTTTGGGGACCTCAGTATGGATCACCGAGGGAGGAATGGAACTCTTATGGAGCTGGACCTTCTAACACAAATATGGCACAATCATCTGATTTATCACCTAACCAGTTTGCTTATAATTCCTCTGGCTATAGCTCTCCTCATCCATCTGGGACTGGGATTTTACACTCTGTAGATTTGACTCATGCAGCTGCCAACTCACCCAGCGCTCTTAATCAGAATTCTTACGAATGGATGGGGAAAACTGTGCAATCGACTTCTACAGGTAGGAAATACTTTCACCTGATTTGAGAGTTATATTTTCAGCCACAAAAGATTTAGTcttttttagcaaattttgctttttaaagcaaAACAGACAAAGTGATAATCCTATCATAAAAGACATCCTAATGCAGATAGTAACACTTTATCTTTCCTTTGTTagtttgcctgaaaaccacagaaaCCATAATAGGTCCCTTTTGTTAAAATAGGAAAGGACATATTAGGCCCATGTCATACAGAGAAATTTTAAGATACTAGTTGTAGCTGGCAAGAAATAGAGTTTATTTATGGGGGGCAAGTACAATGTTTTGGCACTTGTAGGAAACAGTACAAGCTATTGGTAGGCAGCTTGAAGATTGTCATCGATAAAACAATCTTTGTGCTTTTTGTGCACCTGTGTGTCCAGCACTATGGACAGACTATTTATATCttttgcatgagcacccaggtttttttatagttttaagatGTGCAGTCTATTCTTGTCGATTcttttatatgtgtatgtgtgaagCTGAATAGTAAAACTGGCTACTATAGTATAGCATTGGGAGTACATATTTTGGGTTCTAAAATCAATTATCCATTTGTAGAGAAATATGTCGCCAGAGGCCTGCTGCATGCCCAATGAATAAGTAATAAGTACCAATGACAGTCTAAATGCATAGTgtgtttcaatattaaataagGGTAATGGCCCACAAGGCATTGGCTTAGTGTGTGTTTTATCAGGGAGGAAACAGAGACAACATTTCAGGAACTATCTtaaattgcttcaaattaaagacATTGGGAATCGTCAACAGATTTCTGTATTTTTGGCCACATGTGGGTCTGCCATATGCCCAGTCCCATTATCTATTATAGAAAGCAATCTGAGGCAGTTCCCGGTGTGTTCCTCTATGTTTTATACACAGACAAAATACTACATTTTCCACTGGCCCTAAAAAttagtgtatgtttttttttaatattaatttttttgtctttgtgtttgGATTTGGTCTAATTTACTCACTCTGTGTGTCATTATAATTATAGGTATGTAAGTTACACATATTGTATGTActtattgttataaatatatgCTCATAGCTATCTAGTTATAACTTTAATCTCATATATAATGAATACTAAATTGAATCTGTCCCTTTCTGGTGGGTGAATGTGGCATTCTGAGATGTGACAGGGAACAACTTCACTCTAGGCCAATGGCCAAATTTCATACTATCTGAATGTTGGCCATGGGCTAAGCTGTTGATTAGAAGTAAGGTTGgactactgtatgtataactgAGGTTATAGGATTCTATGGTACGGGCCACTGATATATGTGCATCAGTAAATCGGGTTTAACCCACATAGTCTTTTCACCTTTCATGCTTATGGAACATACCTTATTCCTGCATTTTGTCATTGATGCCCTTGATTAAGAGATGTGTTGGTGACCCTAATTCCAATCAAAGACATAGGATGTTGGTGACCCTAATTCCAATCAAAGACATAGGATGCAAGCACACTGACTCCGTTTTTGTCATGCAAATTTAACGTGTCTTTGCAAAGTAGATGTGTGGTAAGGTTTTTCCCCTGGACTGTGCATGGTATTAAGGCCTATCTATCCCATGGAGGTAACAGGCTTTTTTTCACACTTCTTTTCCTCTGGCTTTGATATGcagctttgtcttttttttttttttacatatagccTTTTCTCCCGAGGTTATACTGAATGGTGCTGATTTTCACAGCAAATAAAAAAGACCTTGTCCTTTTTATTGCCTTTGGAAGACTAATCTGACTTTTACGACCTAGCTCCATAATGAAGCCTGGTCTTATTTTTCCACTTTAAAGGCATAggtatattttaaaaatccaCTCGACTTCTCGCGTGTATGGAATGTCTGGAATGACTATTTATGTAAATTCAGCATAAAACATAataggatatttttttaatttatgcttTGACCGGGCTTTAACCATGGTCAACCACTTATTGATCGCCACTAAAAGCAATTGGCAAGGTAATAAAGTTGGGGGCTTGACATGAGTAGCAGTGACTTATAATGCATTGGATCTGTTCCACAATGGACATTGTTCCCAAGAATAATTTACAAAGACACCAGGGTTTATGGAAGTGATACAAAGGATTTAAGACTAAATACCATGAGCAACATTGGGAAGGTGccataaataaacacaaagcCATTGACCGACTGTGGGGGGAAATTCCCCAGCATGAAAGTAATTATTGGACTGAGCAGTAGGAAGTAAATCATGGTGAAGGGTTCAGCAATCTGTTGGGTATGATAATATTTGTGGCTACCCGTGTCTACAGTATAACATATGGAACGTTACATAGCATGCACTGTAGATACTTCTACCGCTGACCTTTTTCCATTTTCCAGATTATGCACTAAGCACACTCATATATGCACACATGCCTACAGCCTTGCAGAAAAGATTAAGCTTTCCATTGCTACAGCATTCTATGGGAAAACTGTTTGTGGGAATTATATTGCTTACAGCAGAAAGAGGCCCGAATTGCAAAATTCTTCATTTTGATCACTCCGGTGTTGCAGACGtttgggggaaaatgctgcattatggttAAATAAACAGGGTATATTAGGTTTATTTTCCCATTTAACAGCTAACTAATAGCCTTCAAAACAGTAATAACCCCCATGGGTGACTTTTCTTTGATTACAGTGTGGGAAGATACTCATGGCACATTGAATGGGAAGCAATCCCTGTCTTTTTGATCACTGCTGCAAAAAAACACGTATGTGCCATACAGTagaaaaattattgttttagaatttaccaataaaaaatataaacctggTGTTTCTTTCTGAATCATAGAGATACAGGTAGGAAGAGCAATAACGCCATGCTCAATACATTCTGATAGAAACTGGATGACAATTGAAAAACAGcccttgaaaaacaaaaactgccAGTACTTTCTCTGAGATGAAAGAGTCTGGGCAGTAGAGTACTTTACAGCTCCAGCTCGTTGAAGACGTTCATTGATAAGATCACCTTGTAGCTCATTGTCTTCTCCTGGCTTCAGAATTAGCACCTCAATAGAATCTGGAGGGCTCATTTAAGGAATCTTTGTTCCTCTGTATGATTCCAAACTCACATCAAAGAGAATTAGGAAGGATCAAAGGGAGATGGAACATCTGATTAAGCAATACAAGAAAGTAGAATTGTGTTTGTTTGTTATCCTCACAGTTGTGTTGtgatttctttgcttttcttggACATCCTGTCTCAGTAGAGCACCGTTTCACCTGCTGCACCCGGGACAAATAAGTGCCTAACTTATGTATAAGGCATTTTGTCTTATTGGATTCATGTTTTTAAGTCTACGAATATGACATGTGCATACAAATACTCTGAGTCATGTTGTCTCAGCTTTATGGATACaaaattaatattaatgttttttatttttttaacatcccACTTCTAAATAAATCACAATGTTTAAGGGCTAGTACTCAGCATACATAGTTGCACATTTCTGCTCTACAATTAATCACAACATGGAAAACTggaattaaattgaaaaaattaagttTCATGGCTCTTTATGAGTTTGTTTACACAAGTGCCCGTAATTAAAGCTGAAGAAACTGCAAATGGCATATGTTGAGCATATTAACAAGTATCCTTATGTGCTCTCTCTCTATCTAGATATATATCTAGACGTAAAAACACTAGATCAAAACTGGTTAAACTGCTTCCATATTTCTATAGAACATATACAGTAAGCTATGGATAACTTGTAAAGTAAATCCTTATTTAGTGACATCATGAACTGTAAAATATGtagataaatatgtatattttagacATTATACCTGGCTTCTTAAGAACATTCCAAAGCAAAATCCAGCACTCTAAACAAACTGTACTCTTCTTCTCATAGGCAAGACGAGGACCAAGGAAAAATACCGTGTGGTTTACACTGACCATCAGAGGCTGGAACTGGAAAAAGAATTTCATTACAGCAGATATATCACTATCAGGCGGAAGACAGAACTGGCTGCAAACTTAAGACTATCTGAAAGACAGGTATGGTACTTTTCAGTTGTAGCAAATAACCACGGAAATGCATATATAGTCAGGcatataacattttgcaatacAATGGTAGAACAATGTAAATCCAAATAGTGCTGAAAAGGGGAGTCAATATGTAAATTAGTGCAATAACTAAATTGTGATGTCAAAACATAATTCAAGTGTTTTGAACCAAATGTGTTAATCTATAAACTATTACAAAGCTGCTTTGATTTTACCTGCTTCCGCCTAAACAGCGCTGACATCATTCAAAGCTAATCATtctcatcattttttatttttctgcaggtAAAAATCTGGTTCCAAAACCGC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Version 9.2

>cdx4.S 9.2 
							TCAGCCTGGGCTTTAGTAAGCTGTGTCTGCAGGCACCTGGCCACAGCATTGTTAGTAATGTGTAGGATACAAGCACCGGTACAACACAGGTCATTAATATAGCCAATCTTAGAGAGAACTAATAGGGCAAAGATGACCACCGGGGATCTAGCATAGAGATGAACATCACATGTGGGAGACATACTAAGCACAAGGGCGTCACCATGTATCCACTTTCAGTAACATCAACCAGCAACAACCACACAGCGCAGAACTACATCTCTAATCAACCTTATTTCAACTATGTGGCGTATCATCATGTTCCACCAATGGATGACCAAGGGCAGCCCTGTGGAGTTTGGGGACCTCAGTATGGATCACCAAGGGAGGAATGGAACTCTTATGGAGCTGGAACTTCCAACACAAATATGGCACAATCATCTGACTTATCACCTAACCAGTTTGCTTATAATTCTTCTGGCTATAGCTCTCCTCATCCATCGGGGACTGGGATTTTACACCCTGTAGATTTGACTCATGCAGCTGCCAACTCACCCAGCGGTCTGAGTCAGAATTCTTATGAATGGATGGGAAAAACTGTGCAATCAACTTCTACAGGTATGGAATGCTATCCCATGATTTGAGCGTTATTTCACTCACAAAGACTTGTTTACTTATTTAGCAAATTTTGCTTTTTGAAGCAAAAACCAAATTGATAATCCTATTATAAAAGTCCCTTTTGATAAAATGAGACAAGTACATATCCATGAAGTAGATTTACACAGATTAGCATTTTTTTTTTGTATATGTTAGTTTTTGTGGTGAAACTTACTACTATAGTATTTATTTATAAATCATCTTAAATCAACTATCCATTTTTAGAGAAATATCCATTTTTAGAGAAATATGATCAAGCTGTACATCCTACCAAAAGGCCCACTGCATGTCCATATAAATATGTGTACCAATGACAGTCCAAATGCATATAGTTTTCGATATTAATTAAGGGTAATGGCCCACAAAGCATTGGCTTAAGGTGGCCATACATGGAGAGATCCGTTCATTTGGCGACTCCGATATGCCCACCTTGAGGTGTGCAATATCGGGCTGATCCGATAGTGGGCCCTAGTGCCCAACGATCGGATCCTAACGATGCCTAACGGGCGGTCGGATCGCGGGACTGCATCAACAAATAGATGCGGCCGTAATCCGATGGGGCAAAGTGTATGGGGCACGTCGGGGGGCCCCATACACGGGCCAATAAGCTGCCGACACGGCCTGTCGGCAGCTTTTATCGGCCCGTGTATGGCCACCTTTAGTGTATGTTTTTTTTCAGGGGGATAACAGAAACACCATTTCAGGAATTTATCTTAAATTGATTCAAATTAATGTCACTGGAATCATTGTTTTTATTGCAACTATTTAAAAAATATATATTTTTGAAAAGCACAGACTTCTGTATTTTGGGCCACATATTGGTGTGCTATGCCCAGTCCCATAATCTGCTATAGGAAGCAATCTGAGGCAGATCCTGGTGTTTTGCTATGTGTTTTATATGCAGACAAAATGCTATATGTTCCACCGACCCTAATTAATTAATTCACTTTTTGTCTTTGTGTTTGGAATTGGTCTAATTTACTCACAATATCTGAATGTTGGACATGGGCTAAGCTACTGATTAGAAGTAAGGTTGGAATATGTATGGCTTCTATGGACTATTTCATCCTGAATTAAAAATATTTTAGGAAGTGACAGATGGAATAATGAATGGGAACCATTGCTTAAACATTTGGTTCATGTTATTCAAAAGAGAGAACAGACCATTTACCAAAGAAGAAATCTAGAAATCTTATACTAGTGAAGGATGGTGACCTAGTGATAAATATGTGTAGCCTTTTCACCATCCATGCTTATGGAATATACCTTATTCCAGCATTTTGTCATTGATTCCCTTGACTAAAGGGATATTCCGGTGACCTTAATTCCAATCAAAGAAATAGGATGCAAGCATACGGACTCTGTTTTTGTCATGCAAATTAAACGTTTCTTTCAGAGTGGTCAGGTTTTTTCCCCTGACCTGTGCATGATATTAAGGCCTATCAGTTCCATAGAGGTAGCAGACTTTTTCACAGTTCTTTTCCCCTGGCTTTGATATGCAGCTTTGTCTTTTTTTTTACGTACAGTCTTTTCTCCAGAGTTTATACTATTGGCAATGGTGCCGATTTTAACAGAAAATAAAAAGACATTGTCCTTTTTATTGCCTTTCGAAGACTAATCTGACTTTTACGACTGAGCTCCATAATGAAGCCTTATCTTTTTTTTCTAGTTAATGCATAGGTATATTTTAACATTTTTAAAATAAAATTTGACTTCTTTCAGGTATGGAATGTTTGGAATGACTATTTATTTATTTATTTATGCAAGATTAGAATATAAATAATAGGGCATTTTTTCATTTATGCATTGACTGGGCTTTAGCTATCTTATACCACTTATTGATCGCCATTCATCTGAAACTAAAAGCAATTGGCAAGGTCATAAAGTCGGGGGCTTGCCATGAGTAGCAATAACCTATAATGCATAGGATCTGTTCCACAATGGACATTGTTCCAAAGAGTAATTCACAAAGGGACCGTGGGTTTCTGGAAGTGATACAAAAGAGTTTTAAGACTTAATACCATGGCCAACTTTGGGAAGGTGCCATAAATAAACACAAAGGCATTGACCTGCTGGGGGAAAACTTCCCCAGCACGAAAGTAATTATTGGACTGAGCAGTAGGAATTAAATCATGGTGAAGGGTTCAGCAATCTGTTAGGTATGAGAATAACGGTGGCAAACAGTTTCTTATGCATCTACAGTATAATAAATGGAACATTCCATAGTCTGCATGCTAAACCATTGTATCGCTGATTTTTATCCATTTTCCAGTGTATGCATACATGCCTACAGCCTTGCAGAATATATAAAGATTTTCATTGCTAAAGCATTCTATGGGGAAACAGTTTTCAATGCTTGTGGGAATGATACTGCTTACAGCAGAAAAAGGCACACATAGCAAAGTTCATAATTTTGATCGCATTTGGGGGAAAATGCTGCACTATGGTGAAATAAACATGGCATATTTGGTTTCTTTTCACATAATGCAACTTCTGCACTAATAATAATGGGTGTTCTTTTAATTATTATTTAATTCATTATCATCATCAATTATGTTATTATACTTTTAGGGCTATAGCCACTAAATTGTCGTTAAAGATTAGCCTTCAATACAGCAATAATCCCCATGGGTCACTTTTCTTTGATTGTAGTGAGGGACGGTACTCGTGGCACATTCAATGGGAACAAATAGCTGCTTTTTTGATCACTTCAAAAAAAAACATGCCGTACAGTTAAAAAAAAATACTGTTTTATAATTGCCCAATAAACTGTAAACCTGGTGCTGATCATAGAGGTCTGGCCACATGAGCAGACTCATGGAGATTAGTCGTCCCAGTGACAAATCTCCTCTTCTTCAGGGCGACAATCTCCCCAAACTGCCTTCCCCCTGCCCTCTGCCAGCTAAAATGAAAATCACCTGTGCCTTCCCTCAGTCGATTTTCATTTTAGCCAGCGGAGGGCAGGGGGAAGGCAGTTCGGGGAGATTGGTGCCCCAAAGAAGAGTCGCAGGGGCAACTAATCTCCCCGAATCTGCTTGTGTGGCCAGACCCTAAGGATACAGGTACAAAGAGCAGTAACACCATAGACGCTTAAAACATTATGATAGAAACTGAATGACAATTGAAAACAGCTCTTGAAAAACAAAAACTTCCAGCACTTTCTTTAAGATGAAAGATTCTGGGCAGTACAGCCCCAGCTTGTTGAAGACGTACATTGATAAGATCACCTTGTAACTCATTGTCTTCTCCTGGCTCAGAATTAGCACCTCAATAGAATCTGGAGCGCTCATTTAAGGAATCTTTGTTCCTCTGTATGATTCCAAACATACATCAAAGAGAATTAGGAAGGATCAAAGGGAGACAGAACATCTGATTAAGCAATATAAGAAAGTAGACTTGTGTTTGTTTGTTATCCTCACAGTTGTGTTGTCATTTCATTGCTTTTATTGGACATCCTGTCTCAGTAGAGCACCATTTCACCTGCAGCCATGGACACATAGGTGCCTAACTTACATACAAGGCCTTTTGTCTTACCGTAGTCATGTTTTTAAGTTTACAAATATGACAAGTGCACACGAAAGCTCATGTTGTCTGAGATCTATGGTTACAAAATGAATATGAATATATTTGTTTTAATATCTAATTTTTAATTCAGGGTTTAGGTGCTAGTACTCAGCAGAATCAGTACTGTTTAAGTTGCCTCCATATTTCTAAAGCTATAGCTAAAGCTTCATATAAGCTATGGATAAGTTGTAAAATAAATCCTTACTTACAATGTTTAGTGGCACCATGTAGTAAAATTGGTGCTTAGAGAAGATGACTTTATATGGTCATATAGACTACAAATATTTTGATGTTTTACAAACAGAAGAGTCCCAGTTTCTCTTGCATTTCTTAACTTGTGTCAGGCAACTTTGTTACAGTATATATATTTTTATTTTCACTTATTGCAGTTTTTGTCCTCATTTGTAGTACAGTGAAACCTAAATTTTACATCCCCTGATTTTAAGTTTTTCCTCATTTTTTCAAATTGTTTTTGTGATCCCATGTTGGTAGGGTTGCCATCTTTTCTGGAAAAAAATACCAGCCTTCCTATATATTTATCTTTTTTTCCTATTAATAACATTGGGATCAACTAGGGTTGCCACCTTTAATGAAAAAAATAACCGGCCGGTGGGGGGCGGGTACAAAAAGGAGGTGGACCATGACGCAAAAAGGGGTGGGGCTACGCAGCGCCCTGCAAAAAGGGGTGGAGCAACATCGCGGCGATGCGAAGAAGACTACAAAAAAGGTAAGTTCTGTAAGTTCTGGGAGCAGGCCGAGGGCTTTTTTTAAAGGATATTACAAATTACCGGCAACTGCATTGCCGGTAAATTTGTAATACAGGCCCCGGCCTTGGCAGGTGTCAACCATCATTTTTACCGGCCAGGCCGGTAAAAGACCAGCCAGGTGGCAACCCTACATGTTGGGCAAACTACATCACCCTGATTTTAAATTTTCCAAGATTTTCCACCATTTTTTCCGGTCCTTTAAAAAATATCTACAATTTTTTTATTGTAATCCATTTACAGAGCTGTGTATATGTTTAAAATATATGCATACATATGCACATACATACAAAAGTGGCAAATTATATTTTCAGAATTACTGTTCTTTTAAGAACATTCCAAAGTTAATTTCCATGGCGATTCAGCATTCTAAATCTCTTCTTCTTCTCAGGCAAGACAAGGACCAAGGAAAAATACCGTGTGGTATACACTGACCATCAGAGGCTGGAACTGGAAAAAGAATTTCATTACAGCAGATATATCACTATCAGGCGGAAGACAGAACTGGCTGCAAGCTTAAGACTCTCTGAAAGACAGGTATGGTTATTTTCAGTTGTAGTAATTAACCATGGAAATGCATACATGGTCAAGCATATGCCATTTTGCAAGTAAATACATATAGTGAAAGGAAGTTGATATGTAAAAATAGTGCAATAACAAAACAGTGTCAGCAAAACATGACTTTACTGTTTTGAACCAAATGCATTAAATTATAAGGTTAAGTACAATTTTTGTTGATAAAACTATTTACAACTGTTTAAATAGCTGCTTTGATTTTACCTGCTTATACCTAAACAACACTGACCTCATTCAAAGTTGATCAATCTCCTTGGCTTTTTATTTTTCTGCAGGTAAAAATCTGGTTCCAAAACCGCAGAGCCAAAGAAAGGAAGGTATTCAAGAAGAAAATTAACCAGTTTGATGGCATGTGTTCTGTGCAGAGCGATTCCAGTTCAGCCAGTCCAAACCCACTTTGTGACTCTGTGGTACATACGGATATGTTAGGCTCCTTATACCAGCCGCCCTCAATTGCACTCAGTGGCCTATAGCAATAAAGAAAGTGTCTGCAAGCATGTCACTCTGTCCCAAAAAACTGCAAGCTTTGGAAGTATTACATGAACACCTTATGTCACTCAGATATGAGACCTGCAAGTCATCACCATAGTGCGACAAAGAAAATACGCAAATTTGTTATTTGTTCCACTGGATCCACTGCTTTGTGATTCATTAAGCCCTTGACTATGGGAGGGGGTTGTTTGCAATCACCTGGACGCTATTATACAGTTGAAGCTATTTCTGGGAAATGCACCACAAATGTGGAAATTTGGAGCCATGTATGATAAAAAAATCAGTAATAACTATGGACCCGGAGAACGAAACCAAACTGTTCTGTTCTTTGATTTCTCTTTCCCAAGTATGACTGTACAAAACTGGAACGTAAACCAAACTTTAGGTCTTCCTATCGTCTTTCTTTATTATATAAGAATTTTTGGGCAAAAGTTTAATTTATTGCTCCATGTGATCAGTGGCTGCATCCCGGGTTGGAAAAGGCCGCAGTCAAACTAAGGCTATTTTGGCAGACTATTGAGACATGCACATTGGTATAATTTGTACAGTGTTTAATAGAATATAATTTTACTTATTGGTTATTGGGGGCCTGTAAAAGGACAAAGGAAACTTCACACTATATGGACTACAAATATCACATCTATATCAGAGCTTTTCAACTGGTTTCATGTTCAGGGACCAGAATATAATAAAATGATCATACAAATAAATTACTTGAGCATTTGGACAGGCTTAGGGTAATATAGATGTCTGATTACCTCCAGCTGGCAGGCCCCAAGCTATACAGCTCATATGAATGGCATTGCCAAGGTATTAGAAAATGTACTCATCTGTGAACATGAACTGTCCATAGTATCCTGCAGTAGTGAAATCTATTGGTGGCTTAGTTTTGCTTAAATAAGCTTGCAATCAAAATTAAAGAATATTATCCTAATATTGACCAAATATAGACACTTCCAGAGTGTGAATCCTTATGTTTGGAGCAGTTCACAAATCTGTACTAGTGGGAACCAGTATAATATATAGAGGCTGATTCACTAAAGGTCAATATTCCTTAACGCATAGTTGTGTGCGTTATTTAAGACGCGTTATTTAAGGAATGATTTATTTAAGACGCGTTATTTAAGGAATGATTCATTGGTATTTTCGCATGCGTTAATAGACATAGCGCAAGTGTTAATTCTAAATTTCTGCACAGTGAGGAGCTGTAGGGCAGCAATTAAAGACCTTTATGAGGAACTGGAGCCTTACCTACCGCCACTAACACATTTTCATGATACCTTGGGCAGATCCAGAATGCACTACGTTCTGTGTCATGGAATTATATTAAGTTTCCCAGGGAAAGGAATGACTAGAACACTGTAAAAAGAGACTTCTACTCTGCCAGTGGCATCCCGAATATCTTAGGTGCTATAAATTGCACTAATGAAGTGTGAAAATATCAAATGCCCTAAAATATCACACAAAATAACGCATGCTATAAAATACCGAACACAGTTCAGCTAAAAATATCACTTCTTAAGTTAGATAAGTGAACTTTTAGTGAATCGATCGCTAAAAAACACTCACTTTTTCGACCGTTAGTGAATCGGCCCCATAGAGTATACAGTACTTGGCCCATACACTGGACATAGACAGTTCATTCATGTCACGAAAGGTGAAACAATTATGTTTTTACTGACTGCACTTGGTTAGGGTTTCCATGTCATTCAATTTAATTATTTAATAAAGAATAAATAAGACTGAT

CDS

Gene model

Entrez Gene

395056

380412

108700082

mRNA

RefSeq

>NM_204086|Xenopus tropicalis caudal type homeobox 4 (cdx4), mRNA
								gtagcatcaaggcaccggcctaacagaggtcatttgtatcgcaacactcatattgaactactgggcaccatagttgcagaagtattcttaacagggttgaggataaagatgaccaccaaggatctcgcctaggaatgaacatcacatgtgggagacaggctatgcacaaggacgttaccatgtatccactttctgtaagatccgccagcaataaccactcagcgcagaattacgcctctaaccaaccttatttcaactatgttacatatcatcatgttccacctatggatgaacaagggcagccctgtggagtttggggacctcagtatggctcaccaagggagcaatggaactcttatggagctggaccttccaacacaaatatggcacaatcatctgacttatcacctaaccaatttgcctataattcttctggctatagctccccgcatccatccggcactgggattttacactctgtagatttgtctcacacagctgccaactcacccagcgatcttagccagaattcttatgaatggatggggaaaaccgtgcaatcgacttctacaggcaagacgagaaccaaagaaaaataccgggtggtgtacactgaccatcagaggctggagctggaaaaagaatttcattacagcagatatatcactatcaggcggaagacagagctggcagcaagcttaagactctctgaaagacaggtaaaaatctggttccaaaaccgcagagccaaagaaaggaaactgttcaagaagaaaatgaatcagtttgacggcatatgttctgtgcagagtgattccagttcagccagtccaaacccactttgtgactctgtggtacatacggatatgtcaggttccttataccagccgccaccaattgcactcaatggtctctagcagagaaggatgtgtctgcaagaatgtcactccgttccaaagaactgcaagctttggcagtattaagtgaacactgattgttacacaggcataagacctacaagtcatcaccacagtgtgataaatactatacatccatttatcctttgttccactggatccaatgcaaccattgggtttgtgattcatgaagcctttgactacagaagatacgtgagaaggggtttgcttttattgacctggaagcccttatgcagttgaagctattcctgggaaatgcaccacaaatgtgtaatagaaatctgaagccgtgtatcgaaaaaaattcagtgatcaattacagactcggaataggaaaccaaactgttgtgttaagttttctttacatagcaagattgtacaaagccttaatggaaactgaactctaggtcttcctatcgtctttattttatataaaaatttttgggcaaaagattaatttattgctccatgtgaccagtggctgcccctctagttggaagcagctgcagtcaaactaaggctactttgtcagattgagacatgcacattggtatcatttgtttacagttttatagaatatagttttacttcttggttattgggggttctgtaagagattaaaggaaacttcacacaatatgaactaaaaatgtaaatattatatctagagcagagatgtccaacttcttttatgcagtgggcaaattatccacaataatgcctaggggtcagatcataataaaatgatgtcattaattatgccaggcccagactgggattcaaaataggccctgacattttgagtacacaaagacctaaacagcacccccataggcccaataaatagtgaccacgcatcactagtgcctgtcaatggcattttacagcagcccctttaccagaacctacagattgccagtccagacctgcctcaagcggagaggcaacaagctctacagctctactcagggacactcatgtgcatacatgtatatgtgtaaacaaaaagaaagctcatcaacaatgtcatttcttacgggtgtatatacattatataatgtaggtaaaaaaaagcatacctgcttatctgttaacatgaagtgtccgtagcatcctgcagcagtgaaatctatgcgtggcttggttttgccgcctaaaagacaaaccaagtataaacaagtatgaaccaaatatagacactttaagagtgtaaatccttatgtctggggcactgcaccaaatctgtacttgtaggtgctgtattataaatatagtatatttgatccatacactgaaatataggctgttcattcgttcccaaaaagcaagacatttgtgtttttactcactgcacttgattagggtttccatgtctttcaatgtaattatttaataaagaataaagaagtttgaaaaaaaatttttttaaaaaaaaaaaa

RefSeq

NCBI Nucleotide

>XM_018232950|PREDICTED: Xenopus laevis homeobox protein CHOX-CAD-like (LOC108700082), mRNA
								tcagcctgggctttagtaagctgtgtctgcaggcacctggccacagcattgttagtaatgtgtaggatacaagcaccggtacaacacaggtcattaatatagccaatcttagagagaactaatagggcaaagatgaccaccggggatctagcatagagatgaacatcacatgtgggagacatactaagcacaagggcgtcaccatgtatccactttcagtaacatcaaccagcaacaaccacacagcgcagaactacatctctaatcaaccttatttcaactatgtggcgtatcatcatgttccaccaatggatgaccaagggcagccctgtggagtttggggacctcagtatggatcaccaagggaggaatggaactcttatggagctggaacttccaacacaaatatggcacaatcatctgacttatcacctaaccagtttgcttataattcttctggctatagctctcctcatccatcggggactgggattttacaccctgtagatttgactcatgcagctgccaactcacccagcggtctgagtcagaattcttatgaatggatgggaaaaactgtgcaatcaacttctacaggcaagacaaggaccaaggaaaaataccgtgtggtatacactgaccatcagaggctggaactggaaaaagaatttcattacagcagatatatcactatcaggcggaagacagaactggctgcaagcttaagactctctgaaagacaggtaaaaatctggttccaaaaccgcagagccaaagaaaggaaggtattcaagaagaaaattaaccagtttgatggcatgtgttctgtgcagagcgattccagttcagccagtccaaacccactttgtgactctgtggtacatacggatatgttaggctccttataccagccgccctcaattgcactcagtggcctatagcaataaagaaagtgtctgcaagcatgtcactctgtcccaaaaaactgcaagctttggaagtattacatgaacaccttatgtcactcagatatgagacctgcaagtcatcaccatagtgcgacaaagaaaatacgcaaatttgttatttgttccactggatccactgctttgtgattcattaagcccttgactatgggagggggttgtttgcaatcacctggacgctattatacagttgaagctatttctgggaaatgcaccacaaatgtggaaatttggagccatgtatgataaaaaaatcagtaataactatggacccggagaacgaaaccaaactgttctgttctttgatttctctttcccaagtatgactgtacaaaactggaacgtaaaccaaactttaggtcttcctatcgtctttctttattatataagaatttttgggcaaaagtttaatttattgctccatgtgatcagtggctgcatcccgggttggaaaaggccgcagtcaaactaaggctattttggcagactattgagacatgcacattggtataatttgtacagtgtttaatagaatataattttacttattggttattgggggcctgtaaaaggacaaaggaaacttcacactatatggactacaaatatcacatctatatcagagcttttcaactggtttcatgttcagggaccagaatataataaaatgatcatacaaataaattacttgagcatttggacaggcttagggtaatatagatgtctgattacctccagctggcaggccccaagctatacagctcatatgaatggcattgccaaggtattagaaaatgtactcatctgtgaacatgaactgtccatagtatcctgcagtagtgaaatctattggtggcttagttttgcttaaataagcttgcaatcaaaattaaagaatattatcctaatattgaccaaatatagacacttccagagtgtgaatccttatgtttggagcagttcacaaatctgtactagtgggaaccagtataatatatagaggctgattcactaaaggtcaatattccttaacgcatagttgtgtgcgttatttaagacgcgttatttaaggaatgatttatttaagacgcgttatttaaggaatgattcattggtattttcgcatgcgttaatagacatagcgcaagtgttaattctaaatttctgcacagtgaggagctgtagggcagcaattaaagacctttatgaggaactggagccttacctaccgccactaacacattttcatgataccttgggcagatccagaatgcactacgttctgtgtcatggaattatattaagtttcccagggaaaggaatgactagaacactgtaaaaagagacttctactctgccagtggcatcccgaatatcttaggtgctataaattgcactaatgaagtgtgaaaatatcaaatgccctaaaatatcacacaaaataacgcatgctataaaataccgaacacagttcagctaaaaatatcacttcttaagttagataagtgaacttttagtgaatcgatcgctaaaaaacactcactttttcgaccgttagtgaatcggccccatagagtatacagtacttggcccatacactggacatagacagttcattcatgtcacgaaaggtgaaacaattatgtttttactgactgcacttggttagggtttccatgtcattcaatttaattatttaataaagaataaataagactgat

Protein

NCBI Protein

RefSeq

More..

NCBI Protein

RefSeq

More..

NCBI Protein

TrEMBL

Genomic

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

More Information

Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Ensembl

Proteomics

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Embryonic Protein Expression

Stage profile:

Data Mining

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

XenMine

cdx4

cdx4.L

cdx4.S

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR, OMIM:Gene, GeneCards

CDX4

OMIM

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Cdx4

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

rat

RGD, AGR

Cdx4

Ensembl

zebrafish

ZFIN, AGR

cdx4

ZFIN

Ensembl

chicken

GEISHA

CDX4

Ensembl

fruit fly

worm

Publications

First

Dorsal-ventral differences in Xcad-3 expression in response to FGF-mediated induction in Xenopus., Dev Biol 1994

Most Recent

Rspo2 antagonizes FGF signaling during vertebrate mesoderm formation and patterning., Development 2020

All

View All Papers 20 paper(s) referencing morpholinos 2 paper(s) referencing OMIMs 2 paper(s) referencing Disease Ontology

Functional Ontologies

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

18 terms

6 terms

PANTHER

cdx4

KEGG Pathways

K09312

KOG

[K] Transcription factor Caudal, contains HOX domain

Reagents

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

CRISPRscan Tracks

cdx4

Morpholinos

cdx4 MO1

ORFs

cdx4.L ORF1 , cdx4.L ORF2

Clones

Horizon Source BioScience

Horizon

Plasmids

Addgene

Symbol legend:

Blast sequence

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