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XB-GENEPAGE-
483266
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Gene Symbol: nodal5
Gene Name: nodal homolog 5 Synonyms: xnr5 , nr5 , xnr5-2 Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: transforming growth factor beta and bone morphogenetic protein related protein Protein Function  :
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: |
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1/3 | Xenbase Gene ID | XB-GENE-483267 | XB-GENE-864962 | XB-GENE-17338929 | ||||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | nodal5 | nodal5.L | nodal5.S | ||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | Chr03 | chr3L | chr3S | ||||||||||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 8.0 JBrowse 8.0 GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 | ||||||||||||||||||||||||
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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| mRNA |
NCBI Nucleotide
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Refseq
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| Protein
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NCBI Protein
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Refseq
TrEMBL
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Str.36305 | Xl.59653 | |||||||||||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 11 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| XenMine | nodal5 | nodal5.L | nodal5.S | ||||||||||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||||||||||
| First: | Two novel nodal-related genes initiate early inductive events in Xenopus Nieuwkoop center. [Development 2000] | ||||||||||||||||||||||||||
| Most recent: |
Xenopus pitx3 target genes lhx1 and xnr5 are identified using a novel three-fluor flow cytometry-based analysis of promoter activation and repression. [Dev Dyn 2017]
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| View All Papers 12 paper(s) referencing morpholinos | |||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| GO | 0 term | 3 terms | 0 term | ||||||||||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | nodal5 | ||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K04666 | ||||||||||||||||||||||||||
| KOG |
[T] Transforming growth factor beta, bone morphogenetic protein and related proteins
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.36305.1.S1_at | ||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | |||||||||||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
