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XB-GENEPAGE-
484552
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Gene Symbol: sox2
Gene Name: SRY-box 2 Synonyms: XLSOX-2 , Sox-2 , XSox2 , Xsox-2 , anop3 , mcops3 Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: HMG-box transcription factor Protein Function  :
Transcriptional activator. Functions as a switch in neuronal development, participating in the differentiation of embryonic neuroectodermal cells into neural tissues by making the ectodermal cells resp...[+]
Interactants: chrd.1 (104) , t (102) , snai2 (97) , otx2 (94) , myc (87) , bmp4 (79) , tubb2b (79) View all: 
OMIM Disease Associations: MICROPHTHALMIA, SYNDROMIC 3; MCOPS3 |
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1/6 | Xenbase Gene ID | XB-GENE-484553 | XB-GENE-17341038 | XB-GENE-865099 | ||||||||||||||||
| Gene Symbol | sox2 | sox2.L | sox2.S | ||||||||||||||||
| Chromosome | Chr05 | Scaffold33547 | |||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 8.0 JBrowse 8.0 GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 6.0 | |||||||||||||||||
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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| mRNA |
Refseq
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Refseq
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| Protein
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Refseq
Swiss-Prot
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Refseq
Swiss-Prot
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||
| UniGene | Str.6201 [+] | Xl.188 | |||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 375 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| XenMine | sox2 | sox2.L | sox2.S | ||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||
| First: |
Neural crest formation in Xenopus laevis: mechanisms of Xslug induction. [Dev Biol 1996]
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| Most recent: | The African clawed frog Xenopus laevis: A model organism to study regeneration of the central nervous system. [Neurosci Lett 2017] | ||||||||||||||||||
| View All Papers 138 paper(s) referencing morpholinos 1 paper(s) referencing OMIMs | |||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| GO | 16 terms | 0 term | 7 terms | ||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||
| PANTHER | sox2 | ||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K16796 | K16796 | |||||||||||||||||
| KOG |
[K] HMG-box transcription factor
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||
| Clones | EXRC - 2 clone(s) | EXRC - 1 clone(s) | |||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||
| Antibody | Sox2 Ab1 , Sox2 Ab2 , Sox2 Ab3 , Sox2 Ab5 | Sox2 Ab5 , Sox2 Ab1 , Sox2 Ab3 | Sox2 Ab1 , Sox2 Ab3 , Sox2 Ab5 | ||||||||||||||||
| Morpholino | sox2 MO1 , sox2 MO2 , sox2 MO3 , sox2 MO4 , sox2 MO5 | sox2 MO1 , sox2 MO2 , sox2 MO3 , sox2 MO4 , sox2 MO5 | sox2 MO1 , sox2 MO2 , sox2 MO3 , sox2 MO4 , sox2 MO5 | ||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.43967.1.A1_at [+] | Xl.188.1.S1_at [+] | |||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.188.1.S1_a_at [+] | ||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
