rac1 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

Gene Literature (170)

XB-GENEPAGE-489007

Gene Symbol:

rac1

Gene Name:

Rac family small GTPase 1

Synonyms:

rac , mig5 , tc-25 , p21-rac1 , Xrac ( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

small GTPase, Rho type

Protein Function Downloaded from UniProtKB

InterPro

Small GTPase Rho , Small GTPase , P-loop NTPase , Small GTP-bd dom

Interactants:

Loading ...

Diseases:

Disease Ontology:

autosomal dominant mental retardation 48

OMIM:

MENTAL RETARDATION, AUTOSOMAL DOMINANT 48; MRD48

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

1/4

Xenbase Gene ID

XB-GENE-489008

XB-GENE-489012

XB-GENE-17333383

Gene Symbol

rac1

rac1.L

rac1.S

Chromosome

Chr9

chr9_10L

Molecules

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>rac1 9.1 
							CGGAAGTGACGCAGGCGGGGAAGCTTCCTGTTATCTCGCCGAAGAGTTGATTTTGTCGGGCGCTGGCTGCTCTAGGTTTTTCCTTCATAGACGCTGAAGGGAGAGCAAAGGAGAAGGAGTcgtgagtgagagagagagggtgTGTTCTGAGCTACTGAAGCCCTTTCGCGGCCTAGCTTGCTTGGGCCATACGTACAGCCTTCATCTGTATCCGCTTTTGCGCCCGGGCTGCAGGGAGATCCGCTGCCAGCGCAGCCATGCAGGCCATTAAATGTGTGGTCGTGGGAGACGGGTAAGTGACGGGCTTCTATCGCTTATTTTTAATGGGGTTAGACGCTGAATCGCAGTGTGTCGCGTCTGGCCTGGGGCTCTGGGGATCTACGCGTTCTTCTGCGGTGGAATTTTCACCTTCCTCGGCTGGAACTGTGGCACGTCAGCCTCATAGCGGCCCAGCTGCTGGGGACTACAAGACCCGCAGAGGATGTCGGATACTGTAGTTCATAACAGCTGGTTGGACTCATTTCGTTCTTCATTGGGTTTCTTAGATAAATCTTTCTGCAGGTCTCTGATTACTAGATATTTATTTGGGGTTTCATTTTTactgctgccctccagctgttccCTGGGTGCTGGGGGCACACTTGGCATAAGGGTCCATgtttgtaatatattgtaaatgtGTCAGCAAATTATAGTgctaatattatataaaatggatAACGTTTGGGCCAAGGTGCCTTCGTCCGCAGTGATGAGTCTTAAATCCtgtagtgtaaaaaaaataataaaaatatatatatatatattagatgtcCGGTTACTAACTGATACTCATCAATATCCAGCAATCAACCCAGGAGCGAATGGAAAGATACGTCAGGAGGGACTATACAGTTATACGGCCACCCTCCCATTGTTACGATTGGAGCACCAGGAAGTAAAGCGCCGTTTCATCTCCCCTTCACTTCCTCATGTGCTGATGCGCTGTGCCCCCCAGTATATGTATACAGAATATAGAGCAAAACCCTCTCAGTTCATATGGGCTGCTTTACATTCTTGGATTTCAGTGCCCTAAGGCTATAGCTGCAGCATGGAACATGTTCTAGATTGATGCTTCCTGCTGCAAGGGAAGAAGAGTCCTCCTATGCCAGAGGCAGTGTGTGTTCTCCCAGTAATCACCGTTGCTAGAGCCTATTTCCCTTGAAAAATGGTAGGAAAAACACTGTTAGATGCATACGTATGATTATGGTCAATATTATAGACCAGATCGGCTCATGTTCCTCACTCCATGGTTAGATATATTGAAACTTCACTGGGTAATGTACTTTAAATCTTTCCTTTGCTATTTAAGCTGTTATATTTTCTACTTACTATGGTTTCTCTCTTTGTCCTGGGCTTTGATTTAATAGACTGTAAATTTGTCCATTCAAAATGTTATTGTATAGTTCCAGCATCAAGTggacatgtatgtataactttatttataaagcgccacaagggtacgcagcgctgtacaatctcacagaatacaagggaggacaagtgatataataaataaatacaattaatatatatatatatatatatatataagtgccatgagacacagtaggaaggaggtccctgccccgtagagcttacaatttaagtacacagtaggaaggaggtccctgccccgacaTGTAAACAAGACATTAATTTAGACAATATTCCTTTCTAGTATATGAGGGTATTTTTAAATGTCTTCTCGTCAGTTTAAATGCAGGGTACATGTGCCACAAATGCCTCGGTCACATGAATTGTATTTGGCTGCATCCATAATGCCGCATTATGTGTTTCATAGGGTACCACTAGTGGCAGGCAGGCATGGGATGGTGCCCCCGAGAGCTAGGATAAATAAGGTTATTAGAACAATTGAAAATCAGGACCAGTAATAGGAAACCCAACTTGTGGGGCAGCACTGATGGCATTTCCTAGCACTTTAGTAACTTGCCAATCAGTTCAGCTCTGCTAGTTGGGTATTTTGTATGTTTCCTGATTTTTCAGATCATTTGATAATCTTAAGGTAAATTTTGTATGGTGTTTGTGCAGTGTAACTGTATTGCtgtcaaaaatattatttatgtgcCAGTCAATGGAGTGCTGATTGTTCTTACACAGAGGTTGTCCATCTCTTTAGGCAAACTTGGCTAAATTACTACATCTATatgctagagcagggatccccaaccttttatactagtgagccacattcaaatggaaaaagtgttggggagcagcacaaccatgaaaaaaggttcctggtggtgcaaataagagcaataattgtctatttaatagcccctatgtggactggcagcctacagaaggctctgtttggcattatacttggtttttatgcaaccaaaacttgccccaagccagaaattcagaaatgagcaccagctttgaggccactgggagcaacatccaaggggttggtgagcaacatgttgctatgagccattggttggggatcactgtcctagagtTTCTTTAGCATCATTCCCTTATACTTTTTGGGTGTTACCATGTTGTAGCTATGGTGCCCTCTGTCCTCACTGTTCCCCAGTTCAGTTATTGCTCTCCCAATCACAAATCTTCTTCATTTTCAGTAAACAGCAGCTTAACACCCAGTACCGATTTGCTTATGGCTGCATTGTGTATATTCTCTTTCCTCATTAAGACTATCAATCAGACAATTATTTTTTCCTGTGGACATGGCGACTTGTTCAGCATATTATTAGGCAACTTGGTGGCCAAGCTTAACTTGTGTATCATTTTGTCTAAAAGACGCACAAGAAAAAGGCacacaaaatagaaaaacaattgtttttttgttcGTACAGAGACTAAATGTTTCAGGGTGCCCCAACCCCTCCATCAGTAGTACAGCTCTTATCATTTTCTGTGCTATGTCTTACATGCTAACAGGCTGCAGCTGTATTAAATAGAAAAGATTTTTACCGTCACTCACTGGTGTGACTAATGTTAAAGTCCATTGCTTTCATTTTACTGGGAAAGTCCCCCTATGAGACCCAGTGTGTGTTGCAATGTTTAATTGTGTCACATTCACCTAACACCTTTAATGATTGCTGTTTTACACTGACTCTTTAAAAAGGTACACTGAAGGGCAGCATTCACTCATTGATTACCACCGCGCCACAAAGAATTATTCAGGATTATAAGAATGACTCCATCTTCAAATCCTGCCAAGCTTATTGCATGGGCAGCATCACTCAGCACTTTGTATGTTCCACTTGGCACCATAGCGCTGCTGTAGGGTCACCATTCCATGTATTGAATTGAAGGTGGCAGAGTGTTAGAAAGCAAGCGTGTGAAGCACTATGTAATGCTTGGCTAATCACAGTATGGTCTTGTTCATACTTGCATTTAAATGTGCACTATCAGTGATgtgagtgttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatcggataCAAGTGTCCGTTTGGCTTCTTTACGTTTGCTCTGCTCCCCTGTGATTTTTATATGTGAGCGATTGGAATGTCTATCGCGTATATAATGCAAGTATGCACAAGTCTAAGGCAGCCCTGATAAGAATTTGCTTTTTGCAATCCTGATATGTGGCTGTAAGTAGTGCAGCACGTTACTGTAGAAGCTGTCCCATGTTAAATGCTCGCAGACAAATTCATTTGTTGAAAgggacagcatccctttaataaCGTACAGGCATGGACATACAGGCTTTTGGATGACCAAAATACCTTGTCTTTTACCATACACTGTACTTGCAGTAGGTAAAAGTAGGAATGTTTAACATGACTTAACTAAACTGTACCCTTGTAGCACACAGGaacacagcataaaaaaaaaaaaagtttgtgagaCCCAAAGGGAGGTATGAAACCTTTAGCTGGAGACAAATATACCTGTTGTAGCTTTATGACCGATGGATATCCGAGGGGTTGCTGCCCATACAAGTAAcaatcattgtaaaaaaaataatatcctaCATATTTGTATTAGAGGGTTCTGTATGATTATGCATATCTAGATTTCAATATATATGTCAgtcttatttattttaccttattGTGATTAGTGCAGTGGAGGCTAGGCAGGTAAATGAGAGAATGTTGTGGGTTGTGCTCGATTTCTCTGCCTGCATTCTGGCTGATTTGTTGCAGTTGGAGACATAGATGTGCTTGGAACTAGTAAGGCCTTTGCAGGAAGTAATATATCTGTGCGGTGGGAAGTCCTGTTTTCCCTTAGTCTATTTATGCTCTTTGCAGATCCCATAATGGAATTCACTCTGGAGCTGATTTGTGCAATAAGGATATtgtgtgacatatatatatatatatatatatgtatataaatatattttctaagtAAACCATTTTGTTCCACTGCTTCAACTTATCTCTGTGCATGTTTAAAATGATAGCATACTAATATATTATCTATGTTATGATAAGGATTAATGACTATTCCTTAACCCACTAAAAGCTCATTTTCCTTTCTACACTGGTAGATcattacaagatttttttttttttttaggaatcgGCCTTAGCTCAGCAGTTTTCCTCCTGTTAAATCTTCTTATTCTCAATTGCCCAGAGTATATATGCCATGCTGCAACCATTGCAGAATGCCAGAGCTTTGCTATTCACTGCTGCAGAGTTGCACCTGGATAGTGCTGCAGCAGTTTAAATGGCACTGTAGTTTTATGGTGACATATAGTTCTTTAGGCCATGTCATTTGCCTTGACGTCAGTTAAAACTCACCCTGCTTGGGCAACTAGATAAATCTATGTGATATGTATGAGTATGAATTCAACTTTGTACTTATACCTTGTACTTCTTTACCTCCTATATTATCTGAGTTTAAAGGAGTAATGTAACcagttttttttccaacaatcgagtttgacattttaaaaactgaataGAGTATAGTTATATCATTTATGTTAT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TTAGTGTTTTACATGCATGTTTGAATTAATAAATTCTTAAA

Version 9.2

>rac1.L 9.2 
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RefSeq

>NM_001004840|Xenopus tropicalis Rac family small GTPase 1 (rac1), mRNA
								gacgctgaagggagagcaaaggagaaggagtcgtgagtgagagagagagggtgtgttctgagctactgaagccctttcgcggcctagcttgcttgggccatacgtacagccttcatctgtatccgcttttgcgcccgggctgcagggagatccgctgccagcgcagccatgcaggccattaaatgtgtggtcgtgggagacggggctgtaggtaaaacatgtttgctgatcagttacactaccaatgcttttcctggggaatatatcccaactgttttcgacaactattctgccaatgttatggtggatggaaaaccagttaatttggggttatgggatacagccggacaggaggactacgacagattacgtccattgtcttaccctcaaacggatgtgttcttaatttgcttttcactggttagcccagcctcattcgaaaatgttcgtgctaagtggtacccagaagtgcgacaccattgtcccaacactcccattatccttgtgggcaccaaacttgatctgagagatgataaagacactattgagaagctgaaagaaaagaagctcacaccaattacctaccctcagggactcgccatggctaaagagattggtgctgtaaaatacttggaatgctctgcccttacgcagcgagggttgaagactgtgtttgacgaagcaatccgagcagtgctgtgcccacctccagtcaagaagcgaaagagaaaatgcctgctgttgtaataactcccacatgccatcttctatcccagctgagtctgcaggctctgatgggatcattgactcaaatgccaattcccgaccctatttgtgataattcatttattgcctataaatataatctttgaatttctccaattcttattttcaccctcgttcctattagtgacaaacatttttcctgagcccatttaaatcctgaatagcagctcagtcctctaggccttattcacagtaaatgatcttttttgctgtaactaatcaattgttgccaaatgtttaaccaactcattaatgcgtataacatgagccatccacaaaggaacgggttttttttgggaaaaatgtaccttttagatatgaagcagtatggtgctttactgcttatattaaatcctttcttatcctttcattcactgtatcacactgtaaatcaaccaacggctcctttagagatgtttagaacacagtgtatcctcttactgcgtggggggaaatgtcatagtcggtttaagggtactaatctgctcttctggctacaatttgtattacgatggaaatgtaaccataggttttggggtttactagtggaaataagtgacagtatttaaacatgacagcgacgaagcatcagctgtagaatctcatgactgcagtaagaagggttgctataggtaagtatttgagttctgttgtcgtttggttttcctttactcatagggcatttgtttgcaccgttttgttgctgggggtgaccaaaccatcttcgataaagccatccagctttaggctaatggacacggggcgtgactgcctctgtaatttggctgaaaaccgcattggtcctatcgcctgtcactgctgtccatagggatctatgggatgtatgctgtctaaagcacatgtaggggtgacatctgcttagactgtgcttaggtctgcgtgtcactgctttaggccttgcagtttccttatttctcaatgggaagcagtaacaggcagaatgagggtgttttgggcgctgctgattacagtaatggcctgtgtgccatagatcatgatgtaggataggcagtctgtgtgccttccagctgctgcagaataaccacatccctgacagtaaatacgtaagagtttctgctgcagccagaatgccaagatttgcctttccctgtcctgggcagttactgcagagatgctaaatccaggggtatggggctggcgcctaggccaatggtcgacactgttcgtgtgtacctttgtggcaagtaactgtattgtcatacggttttgcaactttgattcccacatatcctaagatgtacaagctcttcatggtggcttctttgtagatttgataacttgtattttattatctttctgattattgtaatttgcaattttgtaaactgacaaattaaacctaatactgtttatccatgttcctttccttgccggtgtgcgagcaatggccttcttccttctattaacactaggtgtaaaaatcatgtgtcaccgggtagcaatgtgcgtgcatttactcatccatgtcaccggcggtgtgccacaaaagcaggggagaaggcacagaagtggttaactcactccagacgtatctctgtactgacagaccatgatgtaacgcgttttaactttcttttcactttttgtgaaacctttaatgcttttattaatcctgtccttaggtgtgtgagcgcctgttaatatggctgcgcactgctgaacactagcaagtacaaaactgagacaactttctgtcacttgaacaaacaagagaatttgcaattgttacgagaactcgtggacagtgtttttacattgatctttttgctaatgcaatttagtgttttacatgcatgtttgaattaataaattcttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa

RefSeq

Protein

NCBI Protein

RefSeq

More..

NCBI Protein

RefSeq

More..

Genomic

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

More Information

Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Ensembl

Data Mining

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

XenMine

rac1

rac1.L

rac1.S

Phenotype

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Smith Morpholino Screen

tegg073l16

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR, OMIM:Gene, GeneCards

RAC1

OMIM

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Rac1

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

rat

RGD, AGR

Rac1

Ensembl

zebrafish

ZFIN, AGR ZFIN, AGR

rac1a rac1b

ZFIN

Ensembl

chicken

GEISHA

RAC1

Ensembl

fruit fly

FLYBASE

Rac1

Ensembl

worm

Publications

First

An amino acid mutation in a potassium channel that prevents inhibition by protein kinase C., Science 1992

Most Recent

Non-junctional role of Cadherin3 in cell migration and contact inhibition of locomotion via domain-dependent, opposing regulation of Rac1., Sci Rep 2020

All

View All Papers 28 paper(s) referencing morpholinos 3 paper(s) referencing OMIMs 4 paper(s) referencing Disease Ontology

Functional Ontologies

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

31 terms

5 terms

0 term

PANTHER

rac1

KEGG Pathways

K04392

KOG

[R] Ras-related small GTPase, Rho type

Reagents

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

CRISPRscan Tracks

rac1

Antibodies

Rac1 Ab2 , Rac1 Ab1 , Rac1 Ab3

Rac1 Ab3

Morpholinos

rac1 MO1 , rac1 MO2 , rac1 MO3

ORFs

rac1 ORF1

rac1.L ORF1

Clones

Horizon Source BioScience

Plasmids

Addgene

Symbol legend:

Blast sequence

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