spdef Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

Gene Literature (0)

XB-GENEPAGE-491204

Gene Symbol:

spdef

Gene Name:

SAM pointed domain containing ETS transcription factor

Synonyms:

pdef ( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

transcription factor

Protein Function Downloaded from UniProtKB

InterPro

Pointed dom , WH DNA-bd sf , WH-like DNA-bd sf , Ets dom [+]

Interactants:

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Diseases:

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

Xenbase Gene ID

XB-GENE-491205

XB-GENE-17333285

XB-GENE-6488422

Gene Symbol

spdef

spdef.L

spdef.S

Chromosome

Chr02

chr2S

Molecules

tropicalis

laevis.L

laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>spdef 9.1 
							TTGCAAGTAATAAAGTGTATGGGAATGTTTAGTTGCTTATGTGTTACTTAAGGGTTAAGCGGGCAGGTCCTGCACCTGTTAGATTTGAGCACACACAGGTTGTGTTTACACAGGTACGGGACATTACTATATAAACTATGATGGTTCGACGAGAGAGCGAAAGGAACAGAGGCAGCCAGGTGAGAGTGTATAGAGACATCTGACAGAAATAATAGTGGTGGACAGTGTGAAGATGGGagtctgattttaaaaaaagaaaagaagaaagaaaagggcaGAACATAGGTGAATAAAATAGTAGTGATAGAAAAAGAGAACAAAAGAGTAAAGAAAATAGGTAAAGGGGGAATTTGTAAAAAATGCCAAGTTAGATAGAtaaaaagtaaaggaaaagtaaacctaaaggaaaggtaaaacatgTGTATGATAGAAAGAAATTAAACATAGAGTGAAGTTAGAAGGAGGAAGAAAGACGAAGACATCACTTACTGGACACGTGTCTCTTCCAGGATTTAAAGCATCGTCAGCGAGAGACAGAGGGAGGAGAGTGGAGTTAGAGGAAAAGAGGAGGGAGAGCAAAGGAAAGAGAGGGAGGTAGAAAGTAGAGAGAGGTAGAAAGTAGAGAGAGGTGACAGTGGCAGTAACAGTGGTGTCATAGAGCTGCCACATATGTCCAAGTAACATCCTACAAGTGAAACTTCTCATAACAGACAGGTAATGTTTAAACATTCTGTAAGATTTAAGTCATGTTATTTGTTTTGTGCTATACTAACAAAGTTGCTGGACTTATAGGTTTTGTGCTGTGAAATAATGTTCATGTCCTATAGCAAATTATGTTTTGCATTTAAGAGGTTTTATATTGCATGTTTATGTCAAATATGGGTAATTTTCTGGGTATTAGAGGATAAAAGGTGGAGATGTATTTTGGGATTTTTGTGAAGGTCCTTATCAGTTTATTTCTGCAGGGTTGGTCCCATTAACTTAGATCCCATAATCTGAGGTAAATTGTTTTAGGTTTCTGTGTGTGGTAAACCTTCTTCAAGAAACAGAGTTATGTATTAGACTGACACAGTCAAAATAGCAACAACATGCACTTTTAATTGTACTACTTTTAATTGTATGAGTATCAAAATTACAGTTTTATATATGATGGTGTGTGAAATTACCTTATTACAAATTCATCTTTATATCTATGtacaaaacacaaaagaaaaacctttttaaaaaccTCAAACTTTGATGAGCCTTGTAAACTATGGAAACTTGGGCTGCCATAATAAAAGTCAGTATGGTGCTGTAGCTTTAAAGTCTGTAAGGCTAACCTAAAGTTGCAAAATAGTTTATAGAACATAGCAGTGGTGGCATTTCTTTATAATCAATTGCATGGAGTTCAAATACTTATTTCTAACTATAAAAGCTTAAAAGAAAGGATGCTATAAAACAGCCTCAGCATTAACATTAGAGggacaataaaacaaaaaggggTCTATAGATGAAGCAGCAACTTAGGCAGGTGACTCTGTCAATGTGTGTCCCTGCTTGTGATTCTCTGTGTCACCATGTCCTTGTGGAAAGAACACTCTGCTCTGGGCTCATTCGCATTTGAATGTGTTCCAAGgaattctttttgtatttttattgtgtttttacaaAACAAATCCTGTCCATAAGAATGCAAAGGTATAGCTAGTCTGTTCATACATCATTGTATTTGTTAATTTGATTTTCTTGTTTGTcataaataacttttatttttctctgtcagTTCTTCCCCTTTCATTGCTATGTTCCCCTTTCATAAGCTATGTTCATATACTCTTGGTACCATAAATATTAAAGCTTTTATAGAttaactttatatattttatatttaatctgCACCTATTTGTCATGTTACAATTACTTGCCTTAAAATATCATGCATTCTGATTGCAAGGGGTTATATCTATCACAAAGTTACAAGAGAGTTCTTTAAAGTATTGACATTTTCATACACATTGGATATAAAGTAGTCCAGCTAACACTCTGTGGGGATAAACCATCTGACCTTAGAACAGTCAAGGGAATCATTTGTCTTGGCTTCCCCATTCTCCACAGTTTCATCTCTTTGAGAGAGTGGTCCCTTTAACAGGCTTAGATGTTCCTTTATCTCTGCTCAGCCACTGGAATATATGGGATTTAAAAATTTTAATCACCACTTAGCAACATATATAGGatttaaaacacaaaaagcaCTCACCATGTAGTGTTTTATTCTCTCGGTTTTTGCAACATTGCCTAGGTTGTAAAGATGATTAAAAACGTAAATAAAAGTGAATCCATTTTGTGCAGTGTTTAAGAACTGAGCCACTGAAGCTAAGTGAAGTACAGACACTGTAAAATGTAGGATGAATGTTATAcgtggttaaaggaaaactaaagctgaaCAAAGATTTAGGCTACAAAATGCTACACCTTATGTTTTGGTATTTCATACCAGCCAAAAGCCCAGCACAACCCTTatcaatgaagatctgtgcctctgaatatgCCTCTTTCCATCTTCTTTTTTTGCTGAATCACAGAATATgccctgggctgctgtcagtcagCTTAGGGAGCTTAGGGACGTAGTCATaatatacagcaggggtccccatcctttcttacttgtgagccacagtcaaatgtaaaaacacttggagagcacaagcatcataaaagttcatggaggtgccaaataagggctaagattggctattaggtagcctctatgcacactatcagcttacaggaggctttatttggtagtagtttttatttaaccaaaacttgccaccaagtcaggaattcaaaaataattaactgttttggggttggtgagcaacatgttgcccacaagtcactggttgggaaacacttatatacagtatatgtacagagTAGCTTCATAGATAATGGAAGAAAATTTTGAAAGTAATactaataattcagaattaaaaGACAGCAAATGAACTAGTGCACTAGTGAACTAGCGTAATActgatacaggcatgggacctgttaaccagtaTGCTTGGGACaaggggttttctgaataaggtatttttccatagtttgcttcttaacagctgctcagagcacactttAGCAAACCCCTGTGCGCAAACACAAGGGGGCAAGAGTGTGCCCCTTTGTGCTCATCTGTGAAGCACTTACTTCCAGGGATGTGTTGATCTCTGCATGGAGTGCCAGATCAAAAATGGTGCAGCCCTCTCTTTACCACCAGTCTCAGGGCTGTACCTTGGGCCTCTGACTGTTGCATataaatggtccctaaagtgtgtgCAGTGCCATTGGCACTTAAAAGAATGTCCTAACAATCTAAAATGTGGAGAACTTTGATGGTATGCATCATTTCTGTTATTGGATTCCCTAACCAATGAACTTGTATAGAAAGTTTAGTATTTAAAATACAGCGTGtgtttaagctttagttctcctttacactAAGACATTTAGGACCAAACATAAGGTAATGTGAAAGAGAAAGAGGGTTGTTTAGAATTTGAGCTATATTATAAGCAAAGGTTAAATATTTTTCTATCCATCCCACAGATATTGCCACCTCTGAAATGGGCAGTAATAGTGCAAGCCTTCCTCCTGTTACTCACTCTAGACTGGCCCTACAGGATTCAACCCTCACTAGTTTGGACAAAGCATCCGAGGAGGGTGCACAAGGGTACTTCCTGCCATTCTGTGACATGCTTTATGCAGGTGAGGGGGGGAGCTGGGCACCCAAAGGGCTGATGCCAGTTGTTCACAGAGGAGAAGGCACAAAGGAACCAGAGCAATGCCCTGTAATAGACAGTCAGGGACTCCATCATGAATTGGAGTATCAAACCTCACTACACCTTGAAGACCACTCCCTGGAGCAAATGCAGACCATGGTAGTAGGAGAAGTGCTGAAAGATATTGAGACTGCCTGCAAACTCCTTAACATTTCTGCAGGTTAGTTACTGCTTTGAAACTTGATAATCTTTactgttttacttttataaatatatgtacctgtatatagaattttgctttatctttatatattatataaatatatacccacATGCGGTCTCATTTTCcctcaaagcaaaatgggacagatttgctcatcgctgaTCACTATAAGTCAGTAAATGTTTTTACCTGTGTATGAAACACTAGATTAATTACAGACTATTAAAAACAATTGTCTTCCAAATTATAGATTCCATAGCGGTATATAGTGTAGAGAATTGATCACCATTTAATTTCTCTgagtgtaaaaatatatatatcaacaatCTCAGTTTTAGCAGCTTTATAAATTATAATGTATGCTATtaatctatatttttattaaatgcacTATTGGGAAGGTATTTAAGAACATTTTGGAGAAAAACTGCATTTttctaaacacaaaaaaaatcagttaccCCCTAAGGTATAAACAGCTAGAACTCTTAATCATAACATTCGCCACCCCTCCAGACACAGAATATTCAAAGCAGTGAAGTAGGAAAGCGAGTTTGGTTGGGCAGGGGGGTGAAAGCAAGCGTCAGTGCATATGTAATTTGTGTGCATGTGTTATTCTGTACATGTGACTTTATGTGAACTTGCATACTAAAAGTGTTTATTTGATGCTGTGCTATATGGAAAAGACAGGCAATAAAATCATTAAATTAAGATGCATAATAtgtatgcataataaataaaatgtttctttttgtgaACATTTTTTGTGCATGTTAGTATTTACTCAATATAGCTTGTATAGTAATTTACTACCCATAACCTTATTATATATGGTTTGCTGCAGTTCACAGTGTAcaatattgtatataaagaagTCTAAGGGGGCGATTTATCAacagtcaagtttgatttttttctcaattctaggttttttgtgcttaaagaacatgaatttgagtttttttttgttattaaaaaactCGATTTCAAGTTATTGTTt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Version 9.2

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CDS

Gene model

Entrez Gene

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108709449

mRNA

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NCBI Nucleotide

>XM_018249296|>XM_018249296.1 PREDICTED: Xenopus laevis SAM pointed domain-containing Ets transcription factor-like (LOC108709449), transcript variant X3, mRNA
								GTACTAACGTGTATGACAAAGAATAGGTGCTTATGTGTTATGTAAGGGTTAAGCGGGCAGGTCCTGCACCTGTTAGATTTGAGCACACACAGGGTGTGTTTACACAGGTACGGGACAGTACTATATAAACTATGATGGTTCAACGAGAGAGTGGAGGGAAGAAACAGAGGCAGTGAGAGAGTAAGAGTGTAGAGAGACATTTGACAGGAGCAATAGTAGTGAAGATATAGTATAAAGAAGGAAGCCTGATTTTTGAAAGAAAAGAAAAAAGGAAAAGGGGAATACTTAGGTGAATAAAAAAAGCAGGGAGAAAAAGGAGAGCAAAAGAGCAGAGAAAAAGGCTAAAGGGGGGATTAGTAAAAAAAATGGTGAATTAAGCAGATAAAAAAAGTAAAGGAAAAGTAAACCTGAAGGAAAAGTAAAACGTGAAGAAATAAAAAACAGAGTAAAGGTAGAAGGAGGAAGAAAGACGAAGACATCAGTTACTGGACACGTGTCTCTTCCAGGATTTAAAGCATCGTCAGCGAGAGACAGAGGGAGGAGAGAGGAGTTAGAGGAAAAGAGGAGGGAGAGCAAAGGAAAGAGAGGGAGGCAGAAAGTGGAGAGAGGTAACAGTGGCAGTAACTGTGGTGTCACAGAGTTGCCACATATGTCCAAGTAACATCCCACAAGCAACACTTCTCATATCAACAGATATTGTCACCTGCAAAATGGGCAGCAATAGTGCAAACCTTCCATCTGTTACACACTCCAGACTAGCCCTACAGGATTCAACCCTCACTAGCTTGGACAAAGCATCCGATGAGGGTGCACCAGGGTACTACCTGCCATTCTGTGACATGCTTTATGCAGGTGAGGGGGGAAGCTGGGCACCCAAAGGGCTGATGCAAGTTGTTCACAGAGGGGAAGGTACAAAGGAGCCAGAGCAATGTCCTGTTATAGACAGCCAGGGACTCCATCATGAATTGGAGTATCAAACCTCACTACACCTTGAAGACCACTCCCTGGAGCAAATGCAGACCATGGTGGTAGGAGAAGTATTGAAAGATATTGAGACTGCATGCAAACTTCTCAACATTTCTGCAGACCCAATGGAGTGGTCTGCAGGTAATGTGCAGAAGTGGATTCTTTGGACAGAACATCAATACCGCCTCCCGCAGGTTGGTCGCAGTTTTCAAGAGCTGACGGGGAAGGATCTCTGTGCTCTGAGTGAAGAAAACTTCAGAGAAAGATCACCATTGTGTGGGGATGTTCTATATGCTCACCTAGATATTTGGAAATCAGCATGGATGAAAGAAAAGACAGGACCAGGAGAACTGAGATATTGTGGTGGAAGTGGGGTTGTTGGTGAGTGCTGGGCAGACACTGAGGTAGACTCCTCAGGTTCTGGGCAGCCCATTCATCTGTGGCAATTCCTGAAAGAACTTTTGTTAAAGCCACACAGTTATGGGCGCTCAATACGTTGGCTGAACAAAGAGAAAGGTATTTTTAAGATTGAAGACTCTGCTCAGGTTGCTCGCCTCTGGGGAATACGTAAAAACCGTCCAGCAATGAACTATGACAAACTGAGCCGCTCTATTCGCCAGTACTACAAAAAGGGGATTATCCGCAAGCCAGATGTGTCCCAGCGCCTTGTCTATCAGTTTGTACACCCACTGTAATACTGAAGGAAGGAACTTGAAAGGAGAGGTGAGGAAGAGCAAAGAACTAAATAAGGAGCAGCTATATGCTGAGCAGAGCAGCTCCTTGCACCACTGAAGCAGCTTTTAAAGCTTATATGCATGCAGAGCATGGCTTGTAAAAAAGAAAAGAAAACTAACCACAGCAAACACTGCCTCCAGTGAAGATTGCCTCTAACAATGTAATCAAGGATTTTAGAGCATCAAATTCAATGACACCATATTGCTCTTCAAGACACTTATAAAAAACATTATGAAGAACATCCCATTCCCACACCCTGAATTGTCACTCTAGTTACTTTCACTTTGTGATCTGCTTTTCCTCCTTTCTTATGTAGACTCACTGATCTGAGACCTCATGTACTCGGTGACCTGAGAGGACAATAGGAGGAGGGAAAGGGCAGGACACATTGACCAAAAAGCCTTGCGAACATACCTGAAAACACCAGAGTATCAGGCATTTCAGAGGCCTGCATATCATATTTTCTTTACCTGGATTCCTTCAGTGAAGAAATAGCTTTATGATAAATATTTTCTTATAGTAAAAAGCCACTGTTCCCTTCTATCATTTACAAAATCCAAAGCCATAGCAAAGCATTTTTGCTCTTGTTTACTAATTTATTTTTTAAAAAAACACAACTTTCTTTTGCAGAGATTAATAACGCTCCTTATTTTGTATAGCTAGAACCTTATAACAGGGCTGTCGTTTTTAAAGATTTCACCCTCACTGGATTATTGTTATATTAGCTTTTTAAATGTACGTGCTGCAAGCTGCATTTTTGAATATTCTATTACTCTATAAAATTTTATCAATAAATTGGTGCATTTATTCATTGGATTCTATAGGAGGAAATAGAGACTGGAATGTCCACAATTTATGATAAAGTGCTACTGTACATGAGCATATGCTCACATGCAGCAGCTCTGTGACCCTGAAGGATATCACATCATCTAGCTTGCTTTCTTTCCCTGTTCTGATGTTGAAATCTCCCCACACCACAAGTCGGTCTGAAAAGAATAGGGCCAAATAATGATTAGGCAAAATGCTTTGAGAAGCAGGGCAGGTCATAGGGTTGTTGAACCATCTATATCCCACTATATCCTATCTATAACATAAGTAATACTGTACACATTTTGATTTTAACCTTTATTCCACTTCAATGGCATTAATTCAAAAACTGGCTACAGCTCTAACAACAAGTGAAGGACTGCTGTAATGCACAGAGGAAGTGTTACCTTAAGACATTAAAAAAATAACCACCAAAACTG

Protein

RefSeq

NCBI Protein

Genomic

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Genetic Phenotypes

Gene Expression

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