gal.2 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

Gene Literature (311)

XB-GENEPAGE-5910074

Gene Symbol:

gal.2

Gene Name:

galanin prepropeptide, gene 2

Synonyms:

galanin , gal.2-a , gal.2-b ( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

Protein Function Downloaded from UniProtKB

InterPro

Glyco trans 29 , GT29-like sf , Galanin , GMAP [+]

Interactants:

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Diseases:

OMIM:

EPILEPSY, FAMILIAL TEMPORAL LOBE, 8; ETL8

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

Xenbase Gene ID

XB-GENE-5910075

XB-GENE-6251943

XB-GENE-6079239

Gene Symbol

gal.2

gal.2.L

gal.2.S

Chromosome

Chr07

chr7L

chr7S

Molecules

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>gal.2 9.1 
							ACTTGCTACAGGGTCTAGGTGGAAGAGTAACGCCAATCTGCCTGGAATATATCCCATTATTTCAGCCATCAAGTCTGTtgctaaattaaataaaaacagggggaaaataagccatttttattatttttttcctcaaAGTGACAACTAATTGGCTCCCATAGAAAAACAGCAAAGGTAAGAATTTCCTCTAGTTGTGCTTTGCTCGGGGCAAGTTAGAGCCATGGTTGAGCTCTTTGCATTCTAGTGTTGGTTTTCATGCTTTCCAGCACCtgtatgttctgcctgtgtgtatacTGGGAGGTACTGGGAGTGTATGGGACTGTTGGCTGCGCCGGGGTATGGAACAGGCATGACCTACCTGCCCAGTTGTCTCTTGTTATGGTGCCTGGTGTTGACTCTCTGCAGTTTTATCAATCATTATCAGGTCAGGAATCAGTTATCTGGATCTACTATGGAAAGAGCTACTATGGTAGTTGTAGTTATGCGACACATGGAAGGCTGCTGGCCAGACTCTCTTGACTTACTGGGGCTCAATTATGAATGGtagaaaatttgcacctgggcagtcacccatgacaaccaatcaaatacTTTCATTCTACCTTCAGCTGGTTAAAAAAAGAGGCTAATcgctggttgctatgtgttactgtccaggtgcaaatttgcccagtgtttataaataagcccctctgTATTAAATATGCTTAGCTAGGTCTCATACCcagatttataaaactgtgtaataAAAGATAATGTAATAAGTAACTCCATCCTgctgttctagtaacccatagaaaccagtcaGCAGATGGCATTTTGCATCTCAGCAAAGTGTAGTTCACTCTTACATTGTCTATTTGTCTGTTACATAatgtcctgttcttagcaacttttcaattggtcaccttgtagtttttgaattatttgccttcttcttctctatcttttaagcttttaaatggggggtcactgacccgtaGACAGAAACTATGGCTCTGCGaggcatttttttgttattattacttttattgtttatcttcctgttcagcccctctcctatttttCTTTCAGACTCTCTACTAAACAGGGAGACAAAATCAGCTCCATGATTGGTCCTTGCAATGTAGATAATTAAATTCCCAATGCAAATATAAACCCCTGCAAAATAGACTCCTACTAACAAAAACCTCAACAAAGACTGAAGGGAGGGGGGTTGTATaatgggaatctaattatctaccttgcaggGACCAAATATGGAGTCGCTTCAGTTTCCCTATTTGCCCTATTGCTCAAGAAAACAACAGGCAAAGATTGTGTTtagcacaagccttattcattgcaCTAGTGTGGCACAAGGGATTATACTGCCCCTTTACTAGTTACTATGTTATACActggcctgttcttagcaacatTTCCATTGGTTATTAATGAATTTCTTCCTATTCTGTCTCCTTCCAGATTGCAATGTTAAATGCTATAAGGGTCACTGATAAGCATGTTTTTGTATTGCTTATGGAGGTCTTCTATCATATTCTTTTCTGATTTCCAGGCCACTGACTGGTTACTAGAGTAAGagggtccctagcaaccagaaagctactgaaataaactggagagctacagaacaaaaatgttgaccaaatgaaaacaaaaaaaaaaccaagaccaattgcaaattgtctacccATTTAAACcaagcaaataatataaatacatttgaacaATTCTTTTGGTATAGGGGTTCTGAGTCATCAGCTCCCATTTATACAAATGTGTGTGTCAGCATGGTTCTATGTGTtatatgttccttcaaaaagtctgaaatccagctgcaaaacagttcttctctttctgcatcatttgaaattctggcaggggaggagggactaaaacattgatgttacaaattgtaacaacttctccacagcttacagacagcatgcaggaactacataacccacaatgcattgcactgtgatgttcctttccttattgatatcccagtgcagggaattgtgggattgggaggatgcggggcttagggaactgttccaaaccatattattacattaaaaatcatgaaaaggctgcacattttttaatagatgtataatgtaaagttgcttgaaattattttttattttcaaaaatcttgtgtttgggtgtagttcccctttaaatgcataaCTGGGTCTGTTACTGGGtcacacagcaaaatcattttattctAGAGCTTACAATAAACTTTGGGACTGAGAAAGCCCTCCTGGcacccccagcagtcacagggtctcaTACATTATAGTAAATACCTAGTATTTccagaaaaactatatataataaaatacataatatgACAGTATAAACATTCTGCCATCCATTCCCAAATCTGCAAGTAAAATCTCAGTATGTCGTGGCCCTTGGTGTAATGGGTTGTGCTGGAATCTGCTTATATCTGGTTTATAAGGGACTCAGCTGGTAGAGAGTCAAGAATCTACAGCTAAAGGGAGTCAAAAGAATTCGAGAACTGTTAAACTGCGGGGCCGTAGCTGTAGATTTTGGGGAGTTGTTGTTGATGGGCTGATAAGTATGGGCCTCAGCTGACTCACATACAGCAGACTAAGCAGCCTCTCTATGAATATAGACACGTAACCCACACTGTTCATTATCTTTCCTAGATGAGGAGTTATCAGTTCCTATTATGTATCTCTCTTCTTCTCTGTGGGATGGTGGCTGAAAGCTTTAGCTTTGCCCTATTGGTAAGAAACCACTGCTTCTTCTTTATAATATACACCGACCTGTGATACTTGTTCTGGCCCTGTGTGGATtgattttttattaaaggagaaggaaaggtaaatacaaaggaagcttcatcagaaaggtctatgtaaatacagccataagcacttacagtaatgctgcactgagtcctctatcacaagaaacacaggatttcttgtctctttttttgtaaacatgatgttccagtgtctgacttcctgtctcagaaacatccttaattcccagggccagagtctgcacagttctctcctctctctcctctcctgctccccccccccactagaatgctaaaactccctcccccctcccttaggaatgtgtgatctcagctataagggctagactgcaggaaagaagctaattaaaatggcagctgctgtcttaagcaaacggagaaagcttttAAAGCTGTATACTcgggtatgttaatggtttctgcagaataaatatagtgttctaggtggcactaatgtggcaaatctattggcagtaaaatgccaaaatgactttccttctcctttaagttgaaTTGATCTCAAACTCAACCacgttttttttacatgtttatacaaaacaaaatgcCCAATCAGTGACGGAATATAACTAGTTGCAATGTGTTCAGTTGACCGTACAGCACAAGAGTACCTGCAGATGCATCTGAACAAGTTATAAAATACACTGCATTTCAGTGCTTCATTGCTGGGAAGGGAATTGTGAATATGCATTTGCATTGCCACCCTGGCTATTCCTCTTGGGAGGGGTGAATGCTACCTTGTCTGTCTGACAGCACAATTTGAACTTGGTGGGGTAAATAAACAATACTCTGTTTATCAGAACACTATGGGTAAGGGGTGGCCAACACTGTCTCGCTGACACCATTATTACTCCATGGTTTGGTCTATGTAAGCTCACTATTCTCCTATGTGGATTACAACACTATTCTCCTTGATGCCTTACAGGTTACCCTTTCTCGCTTACAACAGTAATTCTCCATCTTGGGTTGCATAGTACCGTGTCTATTTGACACAATTATTTATTAGCATTGgggtgcttgtcaccctatctatCTGGCactactaaggggcagatttatcaaaacatgagttggaatcccgaatgggaaaaatttggattggaaacggaaatttctaaagatcgcaaatatcacgaaaatgcttacgaaaaaatcgtattagtcacaataatatcgtattggcaatccgaaagtcacaaaattttcgtacagaacaattgtaaacagcagcagagcctttccgaatctTTCGCCCTAATCTCCCCCCATGGCAGGAACCAGCTAAGGTTTGATCTAACGTTTAGTTGCCTTACAGCAAGTACAGCCATAACTTTAATTAGTAGTCGGTAACCTGTATCCTCCATTTAAAAACTAAGCCTCTGATTATAGTCTTGTGCACCAGGTCTTTTGGCATCCTGGAAAATAGCATTTTTCCTTAGGGGGTGATTTGGGGAGGGTGGGGATGATAGAAAGCATCAAACACCTCACAAtcactttaaagggcacctatagccagtgttggactggggagccaagggcccaccagaaaaccttagaactCAGGCCCAATCTCAAGACCATCCTTCCTTCTCTGTTTACCCTCTTTAATCTCTTACTTACTTCATTTTACATACTATCATCTATCCTTTTCTCCACGTCTTCTGTATTTTTCTCATATTGAactgagtaatggccatggtataggcatacaaggcaaatggttgggtgaccAGGAGGGTCTGCAGAAGCCTGGACTGGCtcaccgggataccaggaaaactcccagtgggccagtccgacactgcctataACATAGAAAATGTTTCCCCCACCGAAGGTGTAGGCTAAAAGAATCCACAATCCAGATAAGGGAAACAATGATATTATTTAAAGTAAAGCACCCTAGAGGGCACTGCGCCCCCTTTACTGGGAGTGAGCAATGTTGGGGGATGAAATAATAATACACAGTTTCCTTTCACTTATGATTAAAACAAATATTCAGTTTTCTGTTAGGTTTTGCATTcttaagttttttctttttttttccatttctgatCTGCTTTTTTCAACTCTTACTTATATACTGTGTTTTTTAGCCTAAAGATAAAAGGGGATGGACATTAAACAGCGCTGGATACTTACTTG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Version 9.2

>gal.2.L 9.2 
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Version 9.2

>gal.2.S 9.2 
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CDS

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mRNA

NCBI Nucleotide

RefSeq

NCBI Nucleotide

>XM_018228182|PREDICTED: Xenopus laevis galanin peptides-like (LOC108697793), mRNA
								aatcatcacaaccttggcaccaggggggtccccaagagggtgttacaagtgcttggaaggtgaccaacccaggacatatagggttatatatatgatcagtgctggacagggcctgtaaggatcaccagagcctatctagggccactctgacaacaatgaaatcagttctaattataataggtgtcatcacatagacctatgctagaaataaaggcctgattgctattgtcctttactgggacttattaggttttggagccaatgaaaaatgcaatggtattatgaccggccaatcagactttgttcatgataaggcaagttcacttttgcctatgctctttaattttataagaggccattgcaccttgaggctcattttaaaatccattatactgtgactgtgattgcatttggttggttgttctcctcaaactataaagtgtgtgtcattagtactgacctgtaaccaaccacaacctttatgctcccaacaagtagtgaactggccaactggccaactggcaaatgcagcagaactagcaccacaatatacatctcggatgtctcattataggaactggaattcatctacactgagacaccttggcatggcttgaagccaagaaacaaaaatctctttgagactgacgcaagaccagccccaaaagacagaatgaggcggataactgtaatatgtattgggaggacggaggaagtgaagaggaaaatatgaggaattgtcagttcttattatgtatctctcttcttctgtgtgggatgctgacagtaagctttagcttattgcctaaagataaaatagataaaaggggatggacattaaatagtgctggatacttacttggaccacatggtcatgggactctgactgataaaggaaatatagctgggaaaagggagacagtggaagacacatttaagtctggaagagatacgtatggaattcagctccattctttggatgataacacagttacaaccatcctggaattcttgtcatatctgcgcctcaaagaactgggagctctggatcacttggcaatgatcatcgccgaagattcttcacaaccctagccaccattccctgtattttccagctttaccgaagctgtgatctctgatctaccacccagtattcaagttatatattacaaaatacatattaaccttgtacagtttcggatacaccaacttttttggttgacattacgttttctacattcgaacctgaggcatttgttaagaattgctaatgtcaatgtttttacaaccatttcctttatagtgtaagttctagagctgcaattctacagccactgccctcaatcatcataccaggtttttaatgaaaccatagataggtttatgttgttctaataccatgatgatcatttaattttagctgtgctctttttaaataatcttcttttgaagtctgatggcttttgaagacagtcattcgtttggataaccaacagatcatcctgttctacaaaacaggaatagaaaaaacacttttaatctcttcaaaacttcagaaccctaaattatgggtcaatcagcttttactcaaaaaataagaagtttatgtttccttttctgaagccattttagctaaaatagccagagttcacatgtagtgacacctgtatactgtatatataaatgtctaattatgggaacacaattgtaagaaatgtcctgataataaacagaatttatttcccatgtaatgctgagacataaagcatggtcctttatacgcttatgattagaggctactaaagactttagcctccacggtctgtgagcagggagttaagtgaacagaaatacaagtatttatccttaagtctgggagatacttagggggtgattcactaagggtcgaatatcgagggttaat

Protein

NCBI Protein

TrEMBL

NCBI Protein

RefSeq

More..

NCBI Protein

Genomic

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

More Information

Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Ensembl

Data Mining

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

XenMine

gal.2

gal.2.L

gal.2.S

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR, OMIM:Gene, GeneCards

GAL

OMIM

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Gal

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

rat

RGD, AGR

Gal

Ensembl

zebrafish

ZFIN, AGR

gal

ZFIN

Ensembl

chicken

GEISHA

GAL

Ensembl

fruit fly

FLYBASE

Gal

Ensembl

worm

Publications

First

Studies on the endogenous galactose-binding lectin during early development of the embryo of Xenopus laevis., J Cell Sci 1985

Most Recent

Symmetry breakage in the frog Xenopus: role of Rab11 and the ventral-right blastomere., Genesis 2014

All

View All Papers 121 paper(s) referencing morpholinos 3 paper(s) referencing OMIMs 6 paper(s) referencing Disease Ontology

Functional Ontologies

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

0 term

2 terms

PANTHER

gal.2

KEGG Pathways

K05244

KOG

Reagents

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

CRISPRscan Tracks

gal.2

Clones

Horizon Source BioScience

Plasmids

Addgene

Symbol legend:

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