vangl1 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

Gene Literature (15)

XB-GENEPAGE-5940712

Gene Symbol:

vangl1

Gene Name:

VANGL planar cell polarity protein 1

Synonyms:

stb2 , van gogh ( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

Signaling protein van gogh/strabismus

Protein Function Downloaded from UniProtKB

Interactants:

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Diseases:

OMIM:

SACRAL DEFECT WITH ANTERIOR MENINGOCELE [+]

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

Xenbase Gene ID

XB-GENE-5940713

XB-GENE-5940715

XB-GENE-17334710

Gene Symbol

vangl1

vangl1.L

vangl1.S

Chromosome

scaffold_4168

chr2L

chr2S

Molecules

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genomic Sequence

Version 4.1

Version 9.2

>vangl1.L 9.2 
							GAGGTGCGGCCGGGCGAGTTAGGTGAGTTGCAGGGAGTCTTTGCTCAGCACAGAGGGATCATCATTGAGGCTGCAGGATAGGGGGGTGACTAGTAACCAGGTAAGGGTTAGGGAGACCCCTGTAGAGCAGTGCTGAGTATCTCCACGCAGTATATATAGTATTTGTGCTGTACAATATGATACAATGAGTGTGTGTGGGGGCTGCTCTGCATTTACCTATATGGGGGAGGGGGGGCACCTGCATTCCTGAATCAGACATTCCTTATTGTACTGGGGTGGGGGTTACCTGTACATTACTGGCTACTGAGAGGGAATCCTTACTACTGGATTAGGGCTCATACTGACCAGCATTTCACTCTGCGTTCCCTGCACATCATGTTCTCTTGCACCTGCATTACATGCCACTGACTCAGTGAGTGTGAGTATGTGTGTATGTGAGTGTGAGTGAGTGCAGGCTCTTAGCAAGAATACATTGTGTTACTCCCTGTGCTGCAATACTTTATAACTGACCGCATGACAATATGCTCGTCAGTACAAGCCCTTAGACTCCTTACTATATTAGGGTGGGGGTTATTCATAGGTTTGATTAAGTTTTGTTTTAGAAGAATTCATTTGTATTTTGGTTTGTGCCGGACACTGGGGGGAATTCCTTATAGGGGAGGTTCACCTTTAAGTTAACTTGTAGTATGTTATAGAACGGCTAATTCTAAACAACTTTTCTCTTAGTCTTCATTATTTGTGAAGACCAATTCATTATCATTTTTGAATAATTTACCTTCTTCTTCTGACTCTTTCCAGCCTTCAAACGGGGGTCACTGACCCCATTAAAAAAAACAAATGCTCTGTAAGGCTACAAATATATTGTTATTGTTACTTTTTATTCCTCATCTTTCTATTCAGACTCTCCCCTATTCATATTCCAGTCTCTTATTCAAATCAATGCATGGTTGCTAGGGGAATCTGTTACCCTAGCAACCAGATGGCTGAAATTACAAACTGGAGAGCTGCTGAATAAAAAGCTAAATAAGTCAAAAACCACAAATAATAAAAAATGAAAACCAAATTGTCTCAGAATATCCCTCTCTACATCCTACTAACAGTTAATTTAAAGGTGAACAACCCCTTTATTATATTGGGATGGGGGTTACCTATGTGTCAGATTGGACTGTACCAGGTATTGGGAAGAATTCCTTATTATGTTTCCTTGGGGGTATTAGAAGGTTCTCCTTATTACAACAGGGCTGCTAGGGATTTCTTGTTATACTGGTGTTAGAGTGGGATCCTCTTCATTATACTGACAATCCATATGCTAATGACCCCCTGCTCTCTCTATGATACTGATCTCCCCGCTCTGTATAACAGTACTGAGTATCTCTCCCCCAATACCAATCTTCCCTCTCTGTATAATGGTACTGTGTATCTCTCCCTACATAGCGATATCCCCACTCTATATATAATGGTATAATAGACGAGCCACAAATATCCAGTGAGATATATAGTAAATAAAGTACCCCCTATTGTAAAACATAAGGATATTATAAGTCGCAGAGGAGTTCAATGACTCACTGAAACTTGTGTATTATAATAAATAAAGTTTCCCCTGCTATAAAATATGAGGATATTAGAAGTTACCTCTGAGTTTCATGACCTGTATAAAAACACTGGCCTTTTAGATGATCATGAAACTCCTCTGTGACTTATAATATCCTTATATTTTACAAGAGGGGGTTTATTCACTATATAAACAGTGATGTTCAGTTATAATCGGGTTTAGTGATGTCATTTCTGTCACATGACTTATGATTATCATGTGCCTCACCTGCTGCTTGTCCTGTTATTTCCCTACAGATATGGACACGGAATCCAACCACTCGGGATATTCACATCACTCTCGGGGTCGCCAGCAGAGGTACCAGAGTACTAACATTAGAGCACCCATTTGGGAGCTATAGTTCAGCAGGGTGCTCAAGCTGAGGGTCCCACGTGTGAAGCAAGATGAAGAGTCAGCCTGGTGGTTATACCTCAGAATAGTTACAGAGACCTTGGGATTGATCTTGCAGGATCCTGTAGAAAGTGGAATTCCATGGAAGGGGCAGACGCAAATGCAGAGATGTTATGGGGGAGACAGATGGTTTATGGGGTGAAGATGTTGAATTACCTGGAGATGAGGGGTGTTTGGCCTGAGGAGGGAAGTTGATGATGTCCAATATCATACTTATTAATAGAAATTGGGAATATTGTGTTGTAGAATAAATATGGGGAAAATGGATCTAGGGGGTGGAATTCTATGGGAAAGCTGCTTTCCAAGACAAGGTTTGTGGGTCGTATTGAGAAGATGTTATGAGACCTCTAGGAGGCCATTGCTGTAGAGTGGAGGCTTTGGTTGAGGCTGTACAGAAATTTGCAGGTCATTGATAGTGGGAGCCAGTGAAGGGACCAGCATCCTGGGATTGGTTGGTTTGTACTTGGGCTGTTACTGGTATTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGTACTAGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGATCTGGGGCTGGTACTAGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGTACTGGTACTGGTTGGTTTGTAGTGGGGCTGGTACTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGTACTAGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGAACTGGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGAACTGGTATTAGTTGGTTTTTACTGGGGCTGGTACTAGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGTACTGGTTGGTTTTTACTGGGACTAGTACTAGGGCTGGTACTGGTTGGTTTGTACTGGGGCTGGTACTGGTATTGGTTGGTTTGTATTGGGGCTGGTACTAGGGTTGGTACTGATATTGGTTGGTTTGTATTGGGGCTGGTACTAGGGTTGGTACTAGTATTGGTTGGTTTGTACTAGGGCTGGTACTGGGGCTGGATGGCAAAAGGTTTCAGCAGTCAGAGTAAGAGATGATGAGGTTTCATGGAAAATATTAGGGGTCATTTCTGACCACAATCGCATTTACTTCTCAGCAGTCAGTTGCGCAGAAAAGTCTATTCATTTTTTGTTTCAAAATGTGATCTTTGCACTTCCCTATAGTTGTACTCGGCACCACTCACACCTGCCTCCCATCCCAAATCAAATGCACTTGTACTTATAGACTCAGGGGAACCTTGGAGCTACTTCCACCTCTGGACCAAGCAGTATCTCCAGGGTTCACCCAGGCTTTGTGTCAATAGTCACATCACACAACTCTAACAACAAATACTGCAAATGACCACACTCGTGAGCAGTGTTGGACTGGGACACCCGGGGCCCACCCAATAACCTTAGACCAGGGACCCACCAATTAATCTTAGACAAGGGGCCCACTCTCAGTACTATTATTCTTCCTCCCCTCACTCAACCTCTATTTTCCTAGTCTCTTTACAGACTATAATTTATTATTCCATCTATTTAGTCTCTTTGTTCTCATAGAAATAGGGAATGTCCATGAAATAGGCCAAATGTTTAGTAGCCTGAGGGGCCACTGACACCTGCTCGGGAGGGTTTCAGTGCAATTGTGTCTGATGAACGTCTAGGTGTGAGCTTCATTTTACAGGAATTTTGCCAAATTGCCTGCAATTGCTTTATTAACAGTGGGGCCTCGGTGGTTGATATAAACAGCAGGGATATGGTCAATAGAGGAGAAAGGTGGAAACTATGACAATAACAGTGAAGGGGGTTAAGGAACTACAATTGATTGGGCTACAAGGGGTCCTACAGTAGGTTTTGGTCAAGCGATTGTGGTGGAGACAAATTGATCTGGAATTTGGCTGTACTTTCCAAGAGCCTCTTTTACCTAAAGATCCCTTTTAAGGACTGACCCCTTTTTACTCAACCAACAGACTGACCCTTTTTAACTTGCAGAGAGAGACGTCACGATGGACAAAAATCAGTTAATGTTACGGTTGGACAGCCCCTGCTGGGTGAGGATTCGGGGCGCGGAGAGGAGGATGAGGAGGGACAGGTGAGACAAAGGTGCAAATGGCGCCTTCTCTGGTGTCCAAAGAACAATCACCTTTCCTATAACTCCACCTATTCTCCAAATAACCTTCCACCTATTGGTCTGTCATCCCTAAAATGTCTTACACATTCCTCTCTAATTTGCCCTATTTTATAACTTTGACATTCACTGAGAAATAACTTTCCACCTACAAACCCTTTTTGTAGGATGATCGTTGGGGTGAGACCACCACAGCGGTCACATCAGAGCGTAGTGCATCATTCGAGGACTTGGCCCCAGTTGGAACCTCTAGGATCCCGGACACTGTTAAGCCTAATACCTGGATTATGATTGGATTTTACTTGAGCTGTGCTCTTGGACTTTTTGCTATCCTTACCCCACCAGCTTTTATTGTGCTCCCCCAAGTTTTTTGGGGGTCTCAGCTGGAACCCTGTGGTGTAGTCTGTGAGGGGCTTTATATTTCTTTGGCCTTTAAGCTGCTTCTTCTTTTTTTGGCTAGCTGGGCTGTTTTTCTCCGTCCTCCACGTTGTGATCTTCCTCGACTAGTTGAATTCCATGCTCTTCTAATAGTCTTGCTCTTCTTCTTCCTCTCCTCTTACTGGCTCTTCTATGGTGTGAGGGTCCTGGGCCCACAGGAGAAGAATCTCCTTGGAGTGGTGGAATATGCAGTCTCATTGGTGGATGCTCTTATTTTCATTCATTACCTTGCTCTCATTTTGCTTGAGCTCCGCCAGTTGCAACCCTTCTTCTACCTGAAGGTCATGCGGAGCAGTGATGGAGAGATGCGATTTTACAGCCTTGGAACCCTCAGGTATGTGTAGGAAGGACCAAGGTGAGAAACTAGGTGAGAAAAGGTTTGAGTTGCCTGGCTGATCTGTACTCACATGAGATT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GTGATCCCCAACCAGTAGCTCGTGAGTAACATGTTG

Version 9.2

>vangl1.S 9.2 
							TGTGTTTGCCAGAGAATGTGGGAGGGAGAGACGCACCCCTGGAGGGGGAGGGAGGTGCAGCCGGGCGGGTTAGGTGAGTTGCAGGGAGTCTTTGCTCTGCACAGAGAGCTCAGCATTGAGGCTGCAGGATAGGGGAGTCACTGGTAACCAGGTAAGGGTTAGGGAGACCTTTGTACAGCAGTACTGAGTATCTACATGCAGCATATGGGCTGTGCAATATGATACAAAAACTGGGACGACAATGATGCGTTACCTAGATGGGAGGGGGCACCTGCATTCCTGAATTTGCTGCTGGGCTGTATCAGCCATTCCTTATTGTATTGTGACGGGGGTTACCTGCATATGAGATTCCACAGTGGGATTTCTTACTAGGTTGGGGGTTAAGTGCATGCTCCTGGGTTAGGGCTCATACTGTGCTTCGCCCTGCATCCCCCTGCTCATCATGTTGCGTTGCCCCTGTGTTGCGCTTCCCTGCGGCATCGTCGGAGCCACCTAAATCTGACTACTGGGGAACGCAGGGTGAAATACTTATCAGCATGAGCCCTTAGGCTCCTTACTAAATTAGGGTGGGGGTTACTCACAGTTTGGATGACGCTTTGAGAGGAATTTATTTGTGGCGGTTTGTGCTGTGTTGGATACTGCCAGAAATTCCTTATTATATTGGGATGGGGGTTATCTTGTTATTGGGGGTTGTTCGGTATTGGGAGGGATTCCTTATTATGTTGCATAGGGGGTATTGGAAGATACTTCTTATTATAATGGGTCTGATAGGGATTCCATGTTATACTGGGAGGGTGGAATCAACTTTATTATATTGAGAATCCATATGCTAATGACTCCCTGCTCTAACTGTAGTACTGTCTCCCCTTCTCTCCCCTGACACTGATCGATAATGGTACCGAGTATCTCTCCCCTGATACTGATCTTGCCGCTCTGTACAACAGTGCTGAGTTTCTCTCCTCTGATACCAATATCCCGACTATTGTAAAATTGAAGTATATTATAATTcactgagaagttccatgaccatataaatgcatcaCTAAACCCTGATTATCACTGATTATATCACTAAGAGcagtttatatagtggataaagtaccccctattgtaaaatataaggatattataagataccgaggagtttcatgaccatatatacaggtcatggaactctgaggtaacttataatatccttatattttgcaactgggggtactttatttattataatacacaagtttcagtgagtaatgtgacagaaatgacataagaactcaccgtttataactgatgacatcagaactcaccgtttataaggatataatttacaagatattcatggcttttgtgtattataaggatataatacacaaaagctatgaatatcttgtaaattatatccttataaacggtgagttctgatgtcatcagttataaacggtgagttcttatgtcatttctgtcacattactcactgaaacttgtgtattataataaataaagtaccgccagttgcaaaatatgaggatattagaagttacctcggagttccatgaccttcggcctcgtgtttttatatagtcatgaaactcctcggtatattataatatccttatattttacaagagggggtactttattcactatataatttacaggttattcatggatCTTGTCTATTATAatggtataatacacaaaagccatgaatatcttgtaaattatattcttataaacggtgagtagtgatgtaatcagttataaacagtgagtagtgatgtaatttttgtcacatgactcattaaaacttgtgtattataataaataaattatgattataataaataaattaccccttgttgtaaaatatgaggatattagaagtatccttggagttccatgacctgtataaaagcactcggccttcctAAAGAGCCAcagtgtaaattatattcttataaaaagatgcttagtgatgtcattgcttATAATCAgggtttagtgatgtcatttgtcacatgactcactggcacttgtgaattataattttttaaaatataaggataaactCTTTGGTGacatataatatccttgtattttacagtagggggtactatTAAACTATTTATATTCACTGTATAATCACTGGTGTTACTAACAGTCACTGAACCCCGCAGAAAAGTATTATCAGTATTTCCCAATGCCTTGGTATAGAAACCTTTTCTATAGTAAACACCAAACCAATGCCCTGATATaagtgtatatacaggtatgggacctgttatccagaatgctcaggaccagataatggatccctctgtagtttggatattcataccttaaatctactagaaaatcatgtaaacattaaataaacccaataggctggttttgcccccaataaggataaattatatcttagttaggatcaagtataagctactgttttattattacacagaaaaaggaaatcatttttacaaatttggattatttcaaatggagtctatggaagacggcctttccataattcggagctttctggataacggattttcttataacagatcccatacctgtatagaggaAAGGAACATGTCTTACTGTGATTTTCTTAGTCCTCTGAGGCAAGGGAAGGTGGTGGAAAGTCATATCAAACCAGGGGTCAAGCAGGAAACCTCTTTATTTTATCAATGCAGTTGGTCTGACCATAGGGTTGTTAGTCATGTAGGATTATTATGTGCCTCACCTGCTGCCTGTCCTGTTATTTTCCCACAGATATGGACACCGAATCCAACCACTCGGGATATTCACATCACTCTCGGAGTCGCCACCAAAGGTACCAAAGAACTAATATTGGAGCCCCccgctgggagttatagttcagcacgGTGCTTAAGCTGAGTATCCTGCCTCCCGCTGGTTGTACCTGTGCAAATAAATCGGAATAGCAGTGAGGAATGGCTATGGATACCTTGGCTTTGTTCTACCAGGATCCTGTAGGGAATTCCATGGAAGACGCAATGCAAAGATCTTCTGGGGAAGGCAGATGGTTTGTGGGGTGTTGAgtcatttggaaataaaatggGGTGTTTAGGCTGAGGAGACCAAGACAATTATTTTTGGTATGAATTGGGAAGATTGTGTTGCAGAATAAATAAGGGGAATTGGAGCTGGGGGGGTGGAATTCCATAGGAAAGGAGCCTTCCAAGATGGGATTGAGAAGCTGCTATGAGACCAGCAGGAGGCCATGGCTGTGGACTTGAGGCCACACGTGGCAATTTCCAAATTGAGGGCAGTTGCACCTATTGGCACAGGGAAACCATGGAGCTACTGCTGCCTCTGGACCAAGTGGTACTCCCAGGGTTCCCCCAGTGCTTTGTGTCAATAGTCGCAACACACTTGTGTATAAAGATTCAGGAGCACGTGTGACTCTCACGAGAAACACTTGAAACAATGCCAACCAGACTCACAAAAGTTTTAGCGCAGTTATGTCCCATCGACATCTAGGTGTGAACCTcattttaccaccagcaattgcATTATTAACAGTGGGGCCTCAGGGGGTTGATATAAACAGCAATTATATGAGCAGCGGAGGAGAAATGGGGAGGCTGATGTGACAAGTGATTTTGACGGGTGTTTGGAAATTGGGGGCCTGCTATTGACCAGGTTGCAAGGGACCTACACTATGTGATTGTATTGATGCCACTGTACCTTCATAGCGCCTCTTTTACGTAATTATGCCTTTAAGGACTGATCCCTTTTAACTCAACCAACAGACTGACCGTTTTTAACTCTGCAGAGAGAGAAGTCATGATGGGCAGAAATCAGCGAATATTCAGCCTATGGTTGGGCAGCCCCTGCTGGGAGAGGATTCGGGGCGCggagaagaggaggaggatggaCAGGTGAGAAAAATGTGCAACTGACTCCCAACTTTCTCCAGTTATTATATATAAGCCTCCCTATATGTTCACCTATGCTCCATCCAGCCTTCCTTCTAACTCCATCTATTGGTCTGTCATCCCTTTAAATGCCTTACACATGCCTTCCTACTTTGCTACATTTTAGACCTTTCCTTTGCCTCACTGAGAATAACACCACCTACCAATCCTTTCTGTAGGATGATCATTGGGGTGAGACCACCACAGCCGTCACATCAGAGCGTAGTGCATCATTTGAGGACTTGGCCCCAGTTGGAACCTCCAGTATCCCAGACAATGCTGCACCTAAAACCTGGATTATGATTGGATTCTACTTGAGCTGTGTTCTTGGACTTTTTGCTATCCTTACCCCGCCAGCTTTTATTGTGCTCCCCCATGTTTTTTGGGGGTCCCAGCTGGAACCCTGTGGTGTAGTCTGTGAGGGGCTTTATATTTCTTTGGCCTTTAagctgcttcttctttttttggcTAGCTGGGCTGTTTTTCTCCGTCCTCCACGTTGTGCTCTTCCTCGACTAGTTGAATTCCATGCTCTTCTATTAGTCTTGCTCTTCCTCCTTCTGTCCTCCTATTGGCTCTTCTATGGTGTCAGGGTCCTGGGCCCACAAGAGAAGAACCTACGTGGAGTGGTGGAATATGCAGTCTCATTGGTGGATGCTCTCATTTTCATTCATTACCTTGCTCTCATTTTGCTTGAGCTCCGCCAGTTGCAACCCTTATTTTTTCTGAAGGTTGTGCGGAGCAGTGATGGAGAGACGCGATTTTACAGCCTTGGAACCCTCAGGTATGTGTAGGAAGGACCCAGTGGGAAGAAACTAGGTGTAGAAAGGTTTGAGTTGCCTGGCTGATCTTTACTCAGTTGAGATTGAGTATGGAGGAGCTTGTGTTATACTGGACTATACACgtgttgtactgtatattatggtaGATGGATCGGTTAATCGTGTTACTGGTGGCTCAGGTTTATCTGGGGAGAATCACTCACTGGGCAAAATAGTCATGTTCCTTTGGAACGTTGTAACAAGGAAGATATTGGTCTGTTGCAGGTaggcatttatacattaaattacacaaagaaagaaagtggagaaaagagaaaaaagaagtgGGATGGTTCATGGAGCAGAAACaagaatttgaaaagaagaaATGCAATGTTTGGTTGAGTAGAAACAAGAAGTATGAAAAGTGGAGAAGGAATGGGATGATTGTTGAAGCAGAAACAAGATGTAAAAAGGATGATGACAAATGTAATGTTAACTGGATCAGATACAATTAGTAGTAATGAAAGAGGGATGTTTTTTCTGCTTCAACATCCTTTTCTTCTCGCtgttaaagaaagagaaaaagtggGATATTTGTTGAAGTAGAAAAACAATGAGAAGAAAGCCAATTGGAAGAAAAGATGTGGGAAGTTTTGATAGAGCAGATACAAAAAGtggaatagaaagagaagtgAGATGTTTAGTTGAGTAGAAATAAGTAGTATAAAAGTTGTAGGACGGGGTGATTGTTGGAACAGAAGCAAAGTGTAGAAATAAAGGTCAAGAAGTGGCATGTTTGGTGGAGTAGAAACAAAGTGTAGGATGGGATGAGAACTTGGAGAAGAAAGGAATGTATTTGAAATCTGAAACTGAGTAGGAAAGGAATATAAGAAGTGGTATGTTGGAGTAAGAATTGAATGTTCCTTCAGGAAAATAGGAATGGAGGAGAAAAAGTGGGAGAATTGTTGGATGAGAACAAATGGAATGTTAATTGGATCAATCGATCAAAAAATAAGTGGGATGTTTGGTGGAGAAGAAACAAAGTAGAGAAGAATGAGAAGAAATGGAATGTAAGTTGCATCAGAGAATGTGGTAGGAAAAGAAGAGAATTGGCAGTTTAAGCAAAAGAAGATAAGAAGAATGAACTGCTAGTTAGATCAGGAAGTTGGATATTTTGTTGGAGCAGAAAGAATAAAGTGGAAAAGTAGGAGGCGTGAGATGTTTTTAgacagcaacgtaactagaggggggcgggccctgccgcggaacgtgcagccgggccccccgcccccctccatacgctATTTTCTGCACGGAATCCAGTGGcgtgcaagctgccggggggccctgagggggtgcgggccctggcccaatcgcaccccctgctcccccggtagttacaccactgtttttaGACACGTTGTAGGGTAGAAACAAAGACCATGAAACAAGGAGCATGAAAGGAGGAGAAGAAGTGAAATGTTTCCTGGAACATTAAGAAATAAGGAGAATCAGCAGAAACATAAATTAGGGGCAAGAGTTGTGATGTGTAGCTGTGCATCCTCATGTTTGTTGGTTTAACTGGTGCGTTCTGTGTGCAGTATACAGAGAGCTGCCCTGTTTGTATTGGAGAATTACTACAAGGACTTCCCTGTGTTTCACCCCACTCCACCTGTGGTCAGAAAGCGGTCCCGGCACGACAACCACAACGGGAAAAAAGTGTACAATGTTGATGGTGAGTGGAGGGATTAGAGGTATAAGAGGtttacacagtggggctcattaatTGAGGAAAGgagcaaaaaatatatacaataaaatatacataaatatattattggACATATAATTCTGCATCTCATATAGGCACCAACCCGCACAAATGTGTAACTGTAACGTTCTTGTTggcacttttgttatttactcCTGGACTTTGTACACAGATAATAGTGTATGTGTAAATAAAGTGCCTTAGAGTTCAGCAGAAACTGATTGGCTGGACACTTCAGTATTACAGAGTTATGAATGACTGCTGGGCCACTAGTAGCTAAGTAAAGATAATCACCTACTGGGAGCCTTTGGCAGCAACATCAAAGTCGCTGGGATGGGACCTTTAGCAAAGGAGGCCCCAGAAGACTGTGGTTTGTTTGGGAAGGGCAAGGTCATAATTTTATTGGTCTTCTTCTCTGCAGGTCCTGATAGCAGCACAGTCAGCCAATCACAGACTCTGATCTCAACATCCACCAATTACAAAGAGAGATATTATGAAGAGGCAGAACATGCACGGAAAGTCCGGAGGCGCAAAGCCAGGTGAGAAGGGTCTGTTTGGTCACTGTTGGTATAAAATCTGTCCTTTCCTTGTATAGAGGCATCATTTGCTGAACATAATCTGTCTCCAGATTCCCCTACATTAGATTAGAGTAGATGTGGGATTGGGATAACTACTGTATAAATGGTTCCCTTGTTGAGTCCTCATTGCAAGACAGTAGGGCTCCGGCTCTCAATCAAACACAGCAGCACCAATAACAAGACAGGACAGGCCTCGTGACACATAGGCACACGGACATGCCCAGACAGGCTTTGGCCTTGCTATATGTGCAGATCCCTTTGGCTACAGAAGCTGAAGAACAGGATAGAGACCCATGTGTGATTGAAAGAACAGGGCACGATGGAACAGCAGAAGGGAAAGTGCAGAAAGAGAGCGTAAGAGTGTGAGTGAGTGGGGATAAGCGAGTGCAGGTAAGAGAGAGAGTGGGTGAAAAAGAGAGAGTGGGTAAGAGAAAAAGTGTGGGTAAGAGAAAGAGAGTGGGGCAAGATAGAGAACGGGTAAGAgaaaatgggtaaaaaaagtagGTAAGACAGAAAGGGTAAAAGAGAGAGAGTGGGTAAGAGCCTGggtagtagagagagagagagagtggataAGAGAGAGcaggtgagagagagagataaagtgGGTAAGGTGGGTAATAGGGAGAGAGTGGGTAAGAGAGAGGTCAGGTAAGAGGGAGAGAGTGGGTAAGAAAGAGGTCAGGTAAGAGGGAGAGCGTGGGTAAAAGAGAgcaggtgagagagagagagaaagtgggTAAGAGAGAGAAAGTGGctaagagggagagagagggtaAGAGAGATTGGGTAGGAGAGAGTTCAGGTAAGAGGGAGAGAGTGGGTAAGAGAGAGGTCAAGTAAGAGGGAGAGAGTGGGTAAGAGACAGAGCGGGTAAGAGGGAGAGAGTGGGTAAGAGAGAGGGGGTAAGAGAGAGGTCAGGTAAGAGGGAGAGAGTGGGTATGAGGAAGAGAGTGGGTAAGAGAGAGGTCAGGTAAGAGGGAATGAGGGGGTAAGAGAGAATggattagagagagagagggaatgagggggtaagagagagagagagagagacagtgggTAAGAGCTTGGGTTAGTAGCAATGCAAACCTATTAATGACCAGTTGGTTTCCCCTGTGCCCACAGGCTAGTGATGTCGGTGCATGATGCCTTCTCTCAGCTGAAGCACCTGGTACAACAGGACGAGGAATGGAAATCAGCCAACACTTTGCATCAACAGGAGGCAGCCCAGAGCATATTCCCACTTATTGCCCAGAGCCTGCAGCGCTACCTACGCTCAACCCAGCAAGCTCACCTGCACAGCATGGAGGGGATAATCCAGCATCTCACACTGTGTTTGACCCATCAAATGTCACCCCAGGTAAAGCGCCAGGCCATCAGGGATGGGAAATTGGCCCTTACAATGGCGAGTACATACTCATATTGACCCTCTTTCTATGTTTCAGGCCTTTTTAGAACAGTATTTGCGCCCTGGCCCTCCTGTTCAATACCTCAGCAACCCCTATGGTGTCTGGACACTGGTGAGTGAAGAATCGGTCACACGTCCCCTTAGATCCAATCTGACTTTCTGCCTCCAGTGCTCCGACACTCAGCTGGTGGTGACTGTTTGTGGGATCCCGTTTCTGAAACTGAGTGAGACCTTCATCCCCCCAAACTCCCAACGTTTCATTGTGAGTAGCAAACCTGAGACCAACCTGTGAGCGGCTCTACATAGGAGGAGGGATGGAAGGACTTGATCTTTGCAAAGCAAAGTGATGGAATGATGGAATAAGTGCACTGCTATGCTTACCCCGGCAATCATTATACGCCTCATTTGTCTGCCTCCTGGCAATGGCTAAGTGGTTCATTGAAGTGTTAGCCCCTTGGCTTGTTAGTAGCTACTGTGATGGAAAGAAGATTCAACTTGGCATAAAAGGTGCCTCAAGCTTGAAGATAGTTACTGAGATGGAAGACTTTTCCACCTTGTTGTTTCAAACCTGGATGAAAAGATGTCTCCTTGGTGGAAGCCATTAGAATGGAAGATTCCCTCACCTTGGAGTTACACACAGGAATGGAAAGGTGGCACCTTGGATTTAGCAATTGAGATGGAATGATGCCTCACCTTGGTGTTAAACACTGGAATGGAAAGGTGGCACTTTGGTGGAAGCCTGTTAGGAGAAGACTTGCTGCTATACCATACTCATGACAAAGAGACATGTTAATGTATTTATACAAGCTAATTCCCTGTGCGCATGACCAGGAGGAGTCAGTATTGACCTCTGTATTACAGACATTATAATTGTTATTAAACAAAAGTTTGAGTGGTTGCACCTTGTTGAGCTCTTTACCATTACAAGGTGGATCTGGTGGTATAATGATGGTAGGTGCACATAAAGGAGTCTTCTCATTAGTTAAGGGCAGTTCCTTCACAAAGTCCAGTCAGATCTTGAATGAACAACTAATAAGAATTCCGCATATACTGTACTACACTGCAGATCTGAAGATCTGAATTTTTGCGGTCACTTTGCTGAACTATAATATGGGCCATTTACTATATAACCTTGCACATGGTGTGAGTTCCTTGGCACACTGCAGAGAAAAGACGGGTGGCACCTCTTGTATTGGGTAGAGGCAAGAGAGTCACATGGTTAACCTAAAATTTAAGGAGCAGCATCACCCAAAAAGAGCAAATAGAGGCAATTATGCATAACAACCAATCATATCTCTGCTTTTATCTTCTTGGTTGCACTAGTGTATTATGCCTCCTGATATGTGGCCATAGGACTAAGAAAAAGAGGAAAGGCCTttatcctaataaatatttttgtacttttta

CDS

Gene model

Entrez Gene

734910

108709304

mRNA

RefSeq

>NM_001096375|Xenopus laevis VANGL planar cell polarity protein 1 L homeolog (vangl1.L), mRNA
								catcattgaggctgcaggataggggggtgactagtaaccagatatggacacggaatccaaccactcgggatattcacatcactctcggggtcgccagcagagagagagacgtcacgatggacaaaaatcagttaatgttacggttggacagcccctgctgggtgaggattcggggcgcggagaggaggatgaggagggacaggatgatcgttggggtgagaccaccacagcggtcacatcagagcgtagtgcatcattcgaggacttggccccagttggaacctctaggatcccggacactgttaagcctaatacctggattatgattggattttacttgagctgtgctcttggactttttgctatccttaccccaccagcttttattgtgctcccccaagttttttgggggtctcagctggaaccctgtggtgtagtctgtgaggggctttatatttctttggcctttaagctgcttcttctttttttggctagctgggctgtttttctccgtcctccacgttgtgatcttcctcgactagttgaattccatgctcttctaatagtcttgctcttcttcttcctctcctcttactggctcttctatggtgtgagggtcctgggcccacaggagaagaatctccttggagtggtggaatatgcagtctcattggtggatgctcttattttcattcattaccttgctctcattttgcttgagctccgccagttgcaacccttcttctacctgaaggtcatgcggagcagtgatggagagatgcgattttacagccttggaaccctcagtatacagagagccgccatgtttgtattggagaattactacaaggacttccctgtgtttcgccccgatcctcctgtggtcagaaagcgaacccggcacaacaaccacccccaagtgtacagtgtggatggtcccaatagcagcacagtcagccaatcacagactctgatctcaacatcgaccaattacaaagagagatattatgaagaggcagaacatgcacggaaagtccggaggcgcaaagccaggctggtgatgtcggtgcatgatgccttctctcagctgaagcgcttggtgcaacaggacgaagaatggaaattgcccaacactttacatccacgggaagcggcccagagcatattcccactaattgcccagagcctacagcgctacctgcgctccacccagcaagctcacctgcacagcatggaggggataatccagcatctcacactgtgtttgacccatcgaatgtcaccccaggcctttctggagcagtatttgcaccctggccctcctgttcaataccccagcaacccttatggagtctggacactggtgagtgaagaatcagtcacaagtccccttagatctgatctgactttctgcctccagtgctctgacactcagctgctggtgactgtttgtgggatcccgtttctgaaactgagtgagaccttcatctccccaaactcccatcgcctcattgtgagtagcaaacctgagaccaacctgtgagtggccgttagtaggagcagggatagagggacttgatgtttgctaggcaaagtgatggaatgaatggagggcactgctatgcttaccccagcaatcattatacgcctcattggtttgcctcctggagatggaaagatggttcattgatgtgatagctcctcagcttgttggtagctgctgtgatggaaagatgtttcaccttggtggtagccactagcatggaaggtgcctcaagcttaaagctttgaaagaatgttccaaacttggttgtttcaaacttggatggaaaaatgtcaccttggtagtagccattgggatggaaggatgcctcagcttggtgttacccactggaatagaaaggtggcaccttggtggtagccagtgggaaggctggctgatattgggagaagacttgctgctataccatactcatgacaagagacatattaatgtatttatacaagctaattccttgcatgtgtgaccaggaggaaccaatattgacctctgtattacagacattattattattgttagtattaaactaaacttcgagtggtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa

NCBI Nucleotide

>XM_018249024|>XM_018249024.1 PREDICTED: Xenopus laevis vang-like protein 1 (LOC108709304), transcript variant X3, mRNA
								GCTCAGCATTGAGGCTGCAGGATAGGGGAGTCACTGGTAACCAGATATGGACACCGAATCCAACCACTCGGGATATTCACATCACTCTCGGAGTCGCCACCAAAGACTGACCGTTTTTAACTCTGCAGAGAGAGAAGTCATGATGGGCAGAAATCAGCGAATATTCAGCCTATGGTTGGGCAGCCCCTGCTGGGAGAGGATTCGGGGCGCGGAGAAGAGGAGGAGGATGGACAGGATGATCATTGGGGTGAGACCACCACAGCCGTCACATCAGAGCGTAGTGCATCATTTGAGGACTTGGCCCCAGTTGGAACCTCCAGTATCCCAGACAATGCTGCACCTAAAACCTGGATTATGATTGGATTCTACTTGAGCTGTGTTCTTGGACTTTTTGCTATCCTTACCCCGCCAGCTTTTATTGTGCTCCCCCATGTTTTTTGGGGGTCCCAGCTGGAACCCTGTGGTGTAGTCTGTGAGGGGCTTTATATTTCTTTGGCCTTTAAGCTGCTTCTTCTTTTTTTGGCTAGCTGGGCTGTTTTTCTCCGTCCTCCACGTTGTGCTCTTCCTCGACTAGTTGAATTCCATGCTCTTCTATTAGTCTTGCTCTTCCTCCTTCTGTCCTCCTATTGGCTCTTCTATGGTGTCAGGGTCCTGGGCCCACAAGAGAAGAACCTACGTGGAGTGGTGGAATATGCAGTCTCATTGGTGGATGCTCTCATTTTCATTCATTACCTTGCTCTCATTTTGCTTGAGCTCCGCCAGTTGCAACCCTTATTTTTTCTGAAGGTTGTGCGGAGCAGTGATGGAGAGACGCGATTTTACAGCCTTGGAACCCTCAGTATACAGAGAGCTGCCCTGTTTGTATTGGAGAATTACTACAAGGACTTCCCTGTGTTTCACCCCACTCCACCTGTGGTCAGAAAGCGGTCCCGGCACGACAACCACAACGGGAAAAAAGTGTACAATGTTGATGGTCCTGATAGCAGCACAGTCAGCCAATCACAGACTCTGATCTCAACATCCACCAATTACAAAGAGAGATATTATGAAGAGGCAGAACATGCACGGAAAGTCCGGAGGCGCAAAGCCAGGCTAGTGATGTCGGTGCATGATGCCTTCTCTCAGCTGAAGCACCTGGTACAACAGGACGAGGAATGGAAATCAGCCAACACTTTGCATCAACAGGAGGCAGCCCAGAGCATATTCCCACTTATTGCCCAGAGCCTGCAGCGCTACCTACGCTCAACCCAGCAAGCTCACCTGCACAGCATGGAGGGGATAATCCAGCATCTCACACTGTGTTTGACCCATCAAATGTCACCCCAGGCCTTTTTAGAACAGTATTTGCGCCCTGGCCCTCCTGTTCAATACCTCAGCAACCCCTATGGTGTCTGGACACTGGTGAGTGAAGAATCGGTCACACGTCCCCTTAGATCCAATCTGACTTTCTGCCTCCAGTGCTCCGACACTCAGCTGGTGGTGACTGTTTGTGGGATCCCGTTTCTGAAACTGAGTGAGACCTTCATCCCCCCAAACTCCCAACGTTTCATTGTGAGTAGCAAACCTGAGACCAACCTGTGAGCGGCTCTACATAGGAGGAGGGATGGAAGGACTTGATCTTTGCAAAGCAAAGTGATGGAATGATGGAATAAGTGCACTGCTATGCTTACCCCGGCAATCATTATACGCCTCATTTGTCTGCCTCCTGGCAATGGCTAAGTGGTTCATTGAAGTGTTAGCCCCTTGGCTTGTTAGTAGCTACTGTGATGGAAAGAAGATTCAACTTGGCATAAAAGGTGCCTCAAGCTTGAAGATAGTTACTGAGATGGAAGACTTTTCCACCTTGTTGTTTCAAACCTGGATGAAAAGATGTCTCCTTGGTGGAAGCCATTAGAATGGAAGATTCCCTCACCTTGGAGTTACACACAGGAATGGAAAGGTGGCACCTTGGATTTAGCAATTGAGATGGAATGATGCCTCACCTTGGTGTTAAACACTGGAATGGAAAGGTGGCACTTTGGTGGAAGCCTGTTAGGAGAAGACTTGCTGCTATACCATACTCATGACAAAGAGACATGTTAATGTATTTATACAAGCTAATTCCCTGTGCGCATGACCAGGAGGAGTCAGTATTGACCTCTGTATTACAGACATTATAATTGTTATTAAACAAAAGTTTGAGTGGTTGCACCTTGTTGAGCTCTTTACCATTACAAGGTGGATCTGGTGGTATAATGATGGTAGGTGCACATAAAGGAGTCTTCTCATTAGTTAAGGGCAGTTCCTTCACAAAGTCCAGTCAGATCTTGAATGAACAACTAATAAGAATTCCGCATATACTGTACTACACTGCAGATCTGAAGATCTGAATTTTTGCGGTCACTTTGCTGAACTATAATATGGGCCATTTACTATATAACCTTGCACATGGTGTGAGTTCCTTGGCACACTGCAGAGAAAAGACGGGTGGCACCTCTTGTATTGGGTAGAGGCAAGAGAGTCACATGGTTAACCTAAAATTTAAGGAGCAGCATCACCCAAAAAGAGCAAATAGAGGCAATTATGCATAACAACCAATCATATCTCTGCTTTTATCTTCTTGGTTGCACTAGTGTATTATGCCTCCTGATATGTGGCCATAGGACTAAGAAAAAGAGGAAAGGCCTTTATCCTAATAAATATTTTTGTACTTTTTA

Protein

NCBI Protein

RefSeq

More..

NCBI Protein

More..

Genomic

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

More Information

Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Data Mining

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

XenMine

vangl1

vangl1.L

vangl1.S

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR, OMIM:Gene, GeneCards

VANGL1

OMIM

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Vangl1

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

rat

RGD, AGR

Vangl1

Ensembl

zebrafish

ZFIN, AGR

vangl1

ZFIN

Ensembl

chicken

GEISHA

VANGL1

Ensembl

fruit fly

worm

Publications

First

Molecular cloning and characterization of Strabismus 2 (STB2)., Int J Oncol 2002

Most Recent

Models of convergent extension during morphogenesis., Wiley Interdiscip Rev Dev Biol 2018

All

View All Papers 3 paper(s) referencing morpholinos

Functional Ontologies

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

0 term

3 terms

PANTHER

vangl1

KEGG Pathways

K04510

KOG

[T] Signaling protein van gogh/strabismus

Reagents

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

CRISPRscan Tracks

Morpholinos

vangl1 MO1 , vangl1 MO2

ORFs

vangl1.L ORF1

Clones

Source BioScience

Horizon Source BioScience

Horizon

Plasmids

Addgene

Symbol legend:

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