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XB-GENEPAGE-
6257418
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Gene Symbol: tbx6
Gene Name: T-box 6 Synonyms: dfnb67 , XTbx6 Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: transcriptional activator Protein Function  :
Transcriptional activator. Plays a role in ventral mesoderm specification and acts together with nog during muscle differentiation. Mediates posterior pattern formation of the embryo, including specifi...[+]
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: |
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1/4 | Xenbase Gene ID | XB-GENE-6257419 | XB-GENE-6254214 | XB-GENE-17335269 | ||||||||||||||||
| Gene Symbol | tbx6 | tbx6.L | tbx6.S | ||||||||||||||||
| Chromosome | scaffold_1489 | Scaffold22 | Scaffold29 | ||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 | ||||||||||||||||
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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| mRNA |
Refseq
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Refseq
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| Protein
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Refseq
Swiss-Prot
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Refseq
Swiss-Prot
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links | |||||||||||||||||||
| Genomic Synteny | Genomicus | ||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||
| UniGene | Str.1637 | [+] | |||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 22 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| XenMine | tbx6 | tbx6.L | tbx6.S | ||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | tgas124n10 | ||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||
| First: | Characterization of the zebrafish tbx16 gene and evolution of the vertebrate T-box family. [Dev Genes Evol 1998] | ||||||||||||||||||
| Most recent: | Evo-engineering and the cellular and molecular origins of the vertebrate spinal cord. [Dev Biol 2017] | ||||||||||||||||||
| View All Papers 9 paper(s) referencing morpholinos | |||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| GO | 13 terms | 13 terms | 0 term | ||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||
| PANTHER | tbx6 | ||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K10180 | K10180 | |||||||||||||||||
| KOG | |||||||||||||||||||
| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||
| Source BioScience | |||||||||||||||||||
| Morpholino | tbx6 MO1 , tbx6 MO2 , tbx6 MO3 , tbx6 MO4 , tbx6 MO5 , tbx6 MO6 | tbx6 MO1 , tbx6 MO2 , tbx6 MO3 , tbx6 MO4 , tbx6 MO5 , tbx6 MO6 | tbx6 MO1 , tbx6 MO2 , tbx6 MO3 , tbx6 MO4 , tbx6 MO5 , tbx6 MO6 | ||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.1637.1.S1_at | Xl.9564.1.A1_at | |||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.9564.1.A1_at | ||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
