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XB-GENEPAGE-
919630
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Gene Symbol: skp1
Gene Name: S-phase kinase-associated protein 1 Synonyms: skp1a Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: ubiquitin ligase component Protein Function  :
Essential component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination of proteins involved in cell cycle progression, signal transduction and transcriptio...[+]
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: |
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| Xenbase Gene ID | XB-GENE-919631 | XB-GENE-919643 | XB-GENE-17344373 | ||||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | skp1 | skp1.L | skp1.S | ||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | Chr03 | chr3L | chr3S | ||||||||||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 8.0 JBrowse 8.0 GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 | ||||||||||||||||||||||||
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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| mRNA |
Refseq
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Refseq
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| Protein
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Refseq
TrEMBL
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Refseq
Swiss-Prot
TrEMBL
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Str.50335 [+] | Xl.57174 [+] | |||||||||||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 52 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| XenMine | skp1 | skp1.L | skp1.S | ||||||||||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||||||||||
| First: | The human F box protein beta-Trcp associates with the Cul1/Skp1 complex and regulates the stability of beta-catenin. [Oncogene 1999] | ||||||||||||||||||||||||||
| Most recent: |
High variability of expression profiles of homeologous genes for Wnt, Hh, Notch, and Hippo signaling pathways in Xenopus laevis. [Dev Biol 2017]
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| View All Papers | |||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| GO | 2 terms | 4 terms | 0 term | ||||||||||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | skp1 | ||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K03094 | K03094 | |||||||||||||||||||||||||
| KOG |
[O] SCF ubiquitin ligase, Skp1 component
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.21542.1.S1_at [+] | Xl.20950.1.S2_at | |||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.20950.2.S1_a_at [+] | ||||||||||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
