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XB-GENEPAGE-
971135
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Gene Symbol: ebf2
Gene Name: early B-cell factor 2 Synonyms: coe2 , xcoe2 , Xebf2 , Mmot1 , oe3 , ebf2-a , ebf2-b Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: HLH transcription factor EBF/Olf-1 and related DNA binding proteins Protein Function  :
May play a pivotal role in the transcriptional cascade that specifies primary neurons in embryos. Stabilizes the higher neural potential of selected progenitor cells that express neurog2/X-ngnr-1 by ma...[+]
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: |
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1/3 | Xenbase Gene ID | XB-GENE-971136 | XB-GENE-6252857 | XB-GENE-971141 | ||||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | ebf2 | ebf2.L | ebf2.S | ||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | scaffold_3 | chr3L | chr3S | ||||||||||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | ||||||||||||||||||||||||
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Entrez Gene
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| mRNA |
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| Protein
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Swiss-Prot
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Str.5050 [+] | Xl.237 | Xl.547 [+] | ||||||||||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 14 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| XenMine | ebf2 | ebf2.L | ebf2.S | ||||||||||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||||||||||
| First: |
XCoe2, a transcription factor of the Col/Olf-1/EBF family involved in the specification of primary neurons in Xenopus. [Curr Biol 1998]
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| Most recent: |
Complex domain interactions regulate stability and activity of closely related proneural transcription factors. [Biochem Biophys Res Commun 2014]
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| View All Papers 2 paper(s) referencing morpholinos | |||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| GO | 10 terms | 8 terms | 7 terms | ||||||||||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | ebf2 | ||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K09103 | K09103 | K09103 | ||||||||||||||||||||||||
| KOG |
[K] HLH transcription factor EBF/Olf-1 and related DNA binding proteins
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||||||||||
| Clones | EXRC - 1 clone(s) | ||||||||||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | Source BioScience | |||||||||||||||||||||||||
| Morpholino | ebf2 MO1 | ebf2 MO1 | ebf2 MO1 | ||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.5050.1.S1_at [+] | Xl.237.1.S1_at | Xl.547.1.S1_at | ||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.237.1.S1_at | Xl2.547.1.A1_at | |||||||||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
