efcab1 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

XB-GENEPAGE-5727528

Gene Symbol:

efcab1

Gene Name:

EF-hand calcium binding domain 1

Synonyms:

( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

calcium ion sensor

Protein Function Downloaded from UniProtKB

InterPro

EF hand dom , EF Hand 1 Ca BS , EF-hand-dom pair , Recoverin [+]

Interactants:

Loading ...

Diseases:

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

Xenbase Gene ID

XB-GENE-5727529

XB-GENE-17334551

XB-GENE-5727581

Gene Symbol

efcab1

efcab1.L

efcab1.S

Chromosome

Chr06

chr6S

Molecules

tropicalis

laevis.L

laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>efcab1 9.1 
							GTAAGGCTGTTTGTAAGCACCGCTCGCAGCTTATGAAATGTAAGTGAAACACTTCTGAGCATAATGCATGTCATGTAGAGCTGATCCGAGCCACGGAGATCAAACCGGAAGTGCCGCTGATTGGTTGTTGTTGTTGCCATGGTGATTGTGTATACAAGCTCCGAACAGTTTCACTCAGAGTTGAGAGGAAAAAGTAACCAGCAATTGCAATGTCCCAACAAGTGTCTTCCATGAATAGAAAAAACCTACAGAAGCAGGCGGACGCCCTGAGCCGACTCATCAAGCACTGTAAGTGTGAGACCAAACCCACAGATGCCCACTCTTTAGCCTGTTTCATGAGTGTAGAATAAAACATTTTTTTCAACATATATCGACAATCATGGGCCCCATATCTCCTAGGCCCTAACCCCCTTACTAGTCTTACAGCCTGCGTCTTCTATTATATTATTATTATACCTGGTGTTAAGATACTTTCAGACAGTAAATACATGGTAGATGTCCAACCTGTAGTAATCCAGCAATAGTAGTTGAACTACAGCTCCCAGAACCTTACTAAAAGTTGTTGGCTGGGGTGTTGAGAGTTGTGATTCCTCCACAGTTACAGGTTAGACATCCCTGATTTATGTATATTGTGCCCTGGGGGAATCCTCCATACACCCAGCGCTGTACATTACATCAGACTGGAAAGGACCTGGGTTAATTATCGCAAGCAACTGTGGTTCAGAAACAGTCGCAGGAAAATAAGATGGGCATCCTTGGCATAAATATTTATTCATCATCACTAATATAGTGCAATGATACTGGGACTTATAGTTTGTCCTGGTTTTCTTTTTTTAACTTTTTCATGTACAAAAAATGCACAACAGTAGGAAACACAAGATAGAAGTTGTTTTAGATCGATTTATACATTTTCAAACTAGGCAAAGCAATACATGTGCACTATGGGAGGTATTGTGGATCAGGGTTGTGTATAGGAGGTGTATCGGTCGGCTGTCTTTCACCCTGGGGAGGTGGTCGAGCCTACTCTGGATCAGCTGCTGTTTCTGGCTTGTCCTGGTTTTCTTAGCAAAACCTTTTTCTAGAGGGTCAGAAATGGTTGCCTTTAAGTGGTGCCCTTGTTCATTTGCATGCATGATGTGATACCACAGTGCACTTGTTACATGCACAGAAAATCTTGCATGCACTGGAATGTGCAGTGTGTTTTCAGTGCCATCTGAGTTTCACACCTCATGTATTAAATGCCAGATGATGTTGAACATTTTGTGCTCTTTTTTTAGTTTACTTAGGAAAACTATATGGGTCATTTACTAAATGGAAGGCAGTTTTGCAAAGTGCAAAAAAAAACACTGCAGTCTTTCATTAGTTTTGCACTTTGCACAACACCTTTTTTGCTACTTGAATGGCTGCAGGGCTCTGCAAATGTCCTTGCAGCAAGTTGCCTGTAAAACAATATTCATTAAATGTACAGGATCCGTTATCCGTAAACCCATTATGCTGAAAGTTCCGAGTTAGGGAAAGGCCGTCTCCCATAGACTCCGTTATAAGCAAATAATTCTAATTTTTTAAAATGATTTCCTTTTTTCCTGTAATAATAAAACACTACCTTTTACTCGATCCCAACTATGATATAAGCAATCCTTATTGGAGGCAAAATGATTCTATTGGGTTTCTTCAATATTTCAATGATATTTTTAGCAGACTTAAGGTATGGAGATACAAATTATGGAAAGATCCCTTATCCAGAAAACCTCAGGTCCCAAGCATTCTGGATAATAGGTCCCATACCTGTACTTGCATCCAGGTGTTAGCTCCTGGGTTCCTTCAGGGCCCTGAGTCAACAGATGCAGCAAACTTGGGGTTAAAGAAATGCTTAGACAGCATTCACAGGCTGAATATCAGAACTGATGCCAGGCAGTCTGCAAATATATATTGGCGTAACTGTGGCAAAGTACACACGCAGTTGCATCCATTTTGATAATTGGGGCGCATTTGTGCCGGATACAGTGCAAATGATGTGAAGTTGCATCTAATTCAAAGCCCACATTAGGCTTGCAGGATTCTTGGAAAAAGCAGTACATTGTGGGAAAACATGGCTATTGCATTCAAAGTATGGTTGAATTTTGACATGATCTGCTCAACTAAAATTTTGTTTCAGTATTACACTATATATCTTTAATTTGCAGTTAGTAAGAATGAAGTGGAGAGCCTCATCCGCCTTTATCATACTTTGGTGGGACGACCCATTGATCCTAATACAAGGCGTGGCATTGACCGAAACACTTTCAGAAATATCCTGCACAATACATTTGGCATGACAGATGATATGATCATGGACAGAGGTGGGAGACTTTTATCTGAGTGAATTTCAAAGAATCAGTTGTTGAATCTTTTGACATGGCCTTAACTTCTTTATCTTCTAGTGTTTCGAGGATTTGACAAAGATAATGACAGCTACATCAGTGTTACAGAATGGGTGGAAGGCCTGTCCGTATTTTTACGTGGGACTCTAGAAGAAAGGATAAAATGTAAGAAGTTTTTATATGATACATGGATACACAAGCTCATATATTGATACAGTATTTGCAGTATTGATCAAAATGTATTATCAGCATTTTACCTTTGTAACCAGCAGCACTGTGGGAAATATATCTCCTATTTTTCTTATTTACGGAACAGATTATTATAAACAATGGAGGCATATTAAGGCGGCTTCAGAGATCTTGGACATGCTGGAGGGTAAAAAGCCAGAGAGCCACATGTGACTCATTGGGCCCCCAATGGGACAGTCCTGTTTTAAACATATAAAAAATAAATACCATTACAAATCTCCCATTTAGAGATCTAAAGCCACAAACTTGTGTTAACCTGGATATAGCTAGTCTTATGCCCAACCCAACCCTTGATGGTATCTTCATACCCATGATCTGCGCCCCCCCCCCACAGGACATCTTTTTTTTGCGAGCAGCTGGAGGGCCCTGAGGGGGTGTGCACCCTCCACACCCCTGGTTGTTCCTCCACTGGCTATAGGCTAATCCACAAACACATTGTTACAGAGAAGCAATGGAAACACTGGAGAAGTGGATCTGAAGCGCATATACGCACTGTGTGCCCTCACCCTTGGAGACTGTGCCTTAAAAATCTTTGCCTTTACAATAATATGCAAAGTTTTTCCCTACACATCAAGCTGATTAGCTAGCTTTACTTAAAATAAACTGTGTATTTGCAGGGTGGCAAGTGAAAATATTTTACATTTTTTTGCTGTATTAAATTACTAAACTAAGAGTTGGGCAAAGCTTTTTCTAATATCTTCCTTTTACAAAATCGTGATCCCTTTTCATAGATTGTTTTGGTGTTTATGACCTGAATGGTGATGGCTATATCTCCAGAGAAGAGATGTTCCACATGTTAAAGAACAGCCTACTGAAGCAGCCAAGTGAGGAAGATCCTGATGAAGGTGTAAAGGACTTGGTTGAAATAGCATTAAAAAAGATGGTAAATGTCATTTCTAATATTCCAGCATATAAGCAACAGTCTGTGGATTCACTGACCAGTAGTTTCAGAGTGACTACTGACCACATAATTTAGTTTTTTTTTGTAACATATGCAATTAGTCAGTCCATTTTGTAAAATCCAGCTGCACATGCATAATACAACTTAAATGATTCACAGCCAATCAGCCCTTTGAATCTCTTCTGAAATGATTCCCCATCCAAGGACTGCATGCCCTATAAATTCTGATGGCAACCTGCAAAATAGGTTTTGTGTGATAAGTTCACAGTAAGTGTCCTGTATATGTAGCTTTTTTTTTTCCTTGTACTCTGCAACAGGCGAGAAAAAGAAGACTATTGTAATAACATCTATGGTTATGTTCATGTCTGGACTCACCCTGGCTTTTCAACTAAAGTGATGCCCAAACAGCCCCCACAGGCCCAATAAATAGTGGATGTCTATGGCAGTATATAGCATCTGCACTGACATATGTCAAGTTATACAGATTGTCAGTCTGGGCCTTTATTATCAGCAGACAGGCATTCAGGTAATCATTTAACCTGTGACTGATAAATTGCATTAAGTTGTGTGCTTAAATGCTTTGGAACCCTTAAACTACCAGCAGTCTGGGCCTGGCAGGAATTCCAGGGATCACCAAGTGCTGCCTGTCTATGGATCTTTATTAAAAGAAAAATGTAGTTCTTTAGCACAGAAAGCTAAAATTGTGTCTGATAATTTATCTCTCTATAAAGAATAAGGGTATAGCATATTCTGTGTGCACAACATGGGTTAGCTGCATTTATGGGGGAAGCTGCCATACTTATTACAATGCTGTGTAGGAAATATTACAGGAAGTAGGGCAAAAATTCTCCTCTTATATATGGAAATAAATGCTATTGCAATAAGGCATGTTGGAAAAGCAGTAATCCATCAGTTTTTTTTATAGGATTATGACCACGACAGCAAATTGTCCTATATGGATTTTGAAAAGGCTGTACAAGAAGAAAATCTTCTGCTAGAAGCATTTGGGCCTTGTCTTCCAGATAGCAAAGTAAGAAAATTCTCTGAACTCCTTATTTGTTTTATAGGGATAGACATATAGACATATGGACATATGTATAGACATATAGACATATGTATAGACAGCTAGGACAACCAATAAAGGAATAACCACATAAAAGAATATAACAGACAATTGGACACCTGTGTGATCAGCACAATGGACTTAACTTGTGTACTAGTGCAGTTTGACCTTTTAATGTGTGGCCAAATCTATGTGTCCAGTTTGACCCTTTTTTGCCAAGAAAGTTAAACCTACGTGCTGGTAGAAAAAGGCTCAAACTGCCATAAATGTATGTTTTAACAGCACTGACTTTTTTTTTAAAAGGTTGTCCCTAAGAGATCTTATGCCCTCCAGTTGTCTTAAATTATTAGAAAGTGTTAGTGATTTAGAATAAACAACCACTTTATAAAACCATGTGCAGTCTATTGCAGGATATATGGT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Version 9.2

>efcab1.S 9.2 
							ATTGTGTCTACACACAGGTCGACTTAGAGCAGTTGAGAGAAAGAAGTCGCCAACCATTGCGATGTCCCAGCAAGTTTCTTCCATGAATAGGAAAAACCTGCAGAAGCAGGCAGAAGCCCTGAGCCGACTCATCAAGCATTGTGAGTATGAGACTAAATCCGCTGAGGCCAGTCACACTGCTGTtcaataagacattttttttttaaagttaaaaatacccattggtggccagagtcccctcatcaaatttttaaaaaaaaaacaacagaaaatctTGCATGCACTGTAATGTACACGTTGTGCTTTCATTACCAGCTGAGTTTCACAACTCACATGTGTACCTGATGATTATGAtgttaaactctttttttttctttaagggcaAATTCAAGAACTTAGTTTACTTAGTAAAATTGTAGGGGTTCTTTTCCAAGTGGTTGGCAGTTTAGAATGTGGAAATCACTAGAACATTCTAccatttgttttgcactttgcccaatgCCTTCCTTGCTACTTCAGTTGCTGCAAATCTCTATGAATCTGTTCCAGAGTACAGAGGCCTGTGGTAGCCCCATTAATGTTCTACAGTTCTACAGTTCTGCCCTCTACCggtcccctaatttgcatgtcatACAGAGATGGCTTCTGCCCACTGACAATGTGCTCTTCACCTTGGAAAATTCCATGTCTCCCGAACACATCAATACCAAATTGCATAGATCAAAACCACCCTAGATGTACAATGCAAGATTTGCAAAGCACCACTCCTGAAATCAGCATGCCCATTAAAAAATTTCATTACTTTTgaatcaacacattttttttttttataactctttatttaagtagttttatgaattttacacaaataataagtaggacaaaataggaaacataagaaaacagaaaaaaaaacacataaggaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattatacagttgaGAAACTGAAGTATGCAAGGTTGTGGAATCAACACATTTTTACAACAGAAATATCACTGATGGCAGAATGTTTTGGTTTTCCACTGTTAGGTTAGTAGGATGCTGAGAATTTCCTTCACTGGTCTTTACTGCGAATAAACAATTTTGACCCAAATGCTTGCAACTAGAAGTATGTAAAGCAAAGTAAGTAAGTAACATTTATCAGCTAGTCTCCCACAGCAGAAAATTAAGATGACATTTAAATATCAGCATGGCTAAAATATAGTAATTACTACACAAAAATACTCAACTGAAACACTGAACCAAATATAGCAAGAAATGTGTATGTTGGTACATATAGCTTGTTCAATATGGTTGACTCTGactactgttttttttgtatgaacaTAATCTGCtcaattaaaatgtcatttaagTATTTTCAACACTGTATATCTTTAATCTTCAGTTAGTAAGAGTGAAGTGGAGAGCCTCATCCGGCTCTATCATACGTTGGTGGGGCGCCCTGGTGATCCTAATACAAGGCGCGGCATTGACCGGAACACTTTCAGAAACATCCTGCACAATACATTTGGCATGACTGATGATATGATCATGGACAGAGGTAGGAGAGTCAGATCTCAGTGGAATTTAAAAGAATCAGTTATTGAaccttttaacttgtttttaatttcctCATCTTTTAGTATTTCGAGGATTTGACAAAGATAATGACAGCTTCATCAGTGTTACAGAATGGGTGGAAGGATTGTCTGTATTTTTACATGGGACTCTAGAAGAAAAGATCAAATGTAAGAatttttttgtttgatatatGGATATTTGATTACAGTATTAACTTGGACTTGAAATTGTTCTATATGATCAAAATATATATCagcatttaaatttttaatatttgtgatcATTATATATCTAGCATAGCCAAAGGTAAAACTAGAGACACTTGGGTCAGGGTGCAAAATTTGGAGGAGACCCCCAATGTTTCCTCTTATTATTTATTGGCTGTGGGTACAAAAAACTTTGTGTGTGCACACTTTCTAAGCCTGTTTGTGCATCTTGGACATCTTGGTGATCATAAAAAGTTCTCGGTGAGCCTCCTGCAACTCACAGGCCTAAAACAGTcctgttttaaaagtaaaaaaaaataataataatagagatcTAAAACCCCAAACTTGTATTTACCTTCTGGATCTAGCTTGCTCTAGTCCCACCCCTTGAAGGTATCTGAATAGCAGAATCCACTTGGAGTAATGCAATAAATGTCACGAAGTTTACACCAGGTCAAGTAACCCATtttaaccaatcagatcatttgAAATCAGTAAATGTGCCTTCTACTGATTACTGAATGCTATGCATTTCTAAACCCAGTACAGATCAGACTTTGTGGCTTTAATTACTTTTGTTCTGTATTGAATTGCTAAACTAAGAGTTGGATGATgtctttccttcattttacaaaatgttggtcCCTTTTCATAGATTGTTTTGGTGTTTATGACCTGAATGGTGATGGCTATATCTCCAGAGAAGAGATGTTCCACATGTTAAAGAACAGCCTACTAAAGCAGCCAAGTGAAGAAGACCCTGATGAAGGTGTAAAGGACTTGGTTGAAATAGCATTAAAAAAGATGGTAAACATAATGTTTAATCTAATGTTCCAGTGCATGATAGACAGTCTATGACAGTATTCTCTGACCAATGGTTTCAGTGTGACTTGCTCATTGCATAATTTAGTTGTTGGCACACATGATGAGTATTAGCAAATTCAGTTAGTCAGgccattttgtacattttagcTACACaaggaaaatcaaattcaaatgattCGTAAAAAAAATAAGCCCATTGGATCTCTTCTGAAATGAGTCCCCCATAGTGATGTTTGCCTATAAATACTAATAGCAATCTGCAAAATAGATTTTGGGTGATTAGTGCAAAACAAGTGATGACCAATCAATCTGGTTAAAAATAATTTGGTATTACAGTTGTTACCTAAAACAGCATCTGATTTTTAAACAAGTCCTACAAttaagaaaacctagttaaacaaatgaaacaaaaactattatatttggtcatttattatcaggtgtgagtgagagaccctgttttatttaaagaaaagggattcagcaaagcctgatcacacatacaacaaaTTTGTGGAGGTGTATCATGGCTCGAACAAAGaaggtgtctgaggacctcaggAAAGTGTTGTTAATACCCATAAAGCTTAATAAAAGTTACTGCAaacgtttagttgcagttattgctgcacaagggggtcacaccaaatactgaacAAAAGTAAGTGAATAGCGAtccacttacttttgccacatgcataaatgttattttatcatttgttttcaataaatatatgaccaaataaaatagtttttgtttcatttgctttGCTAGGTTTTCTTCATGTACATTTAGGACTTGTCTGAAAATCAGatgttgttttatataaaaatatagagaatTTAAAAGGGTTCACAGACTTTCAAGATACTGTTCATAAATAAACACttggtttttaaaaataacagaCCTTTTGACAAAGGGACTATGAATATTCACCTCAAGATacctacatttatttatttagggcaGAAGGCTACCATGCCTTTTGTGCATGTAGGGATAATTGTACATTTATCTCTCTTTAAACAAAGGGCATAACTTATTGGGTGTGCAAAACATTTGTTATCTGTATATGGGGAAAGCTGCTATGGGGGTACATGGAGGAAAAATTATAGGAAGTAGGGCCCAATTTCTCTTATTATATATGGAAATAAATGTTAATGAAACGAGCTGTGTTGGAAAAGCAGTAATCCATCTTTTATGCTCTGGTTTTTCTATAGGATTATGACCATGACAGCAAATTGTCCTATACAGATTTTGAAAAAGCTGTACAAGAAGAAAATCTCCTGCTAGAAGCATTTGGGACTTGTCTTCCAGATAGCAAAGTAAGAAAAGTCTCTGCACCCCTCATTTGTTTTATATGGATAAAGTAAAAAAGAGCTAGCACAAAAAAAAGTAACCccacacaaaaaaatgcaacagTTGGACGCCTATGTGCTCCACCCATGGTCTTAAacgagaattcaaccattttccacaaattataatataaaaatcacgacagaatcccttgaacctatttttttttttttaacaagaacatAAAACCAATATGCTGGTAGGAAAAGGTTTATGctgcaataaataatgtttttaacagCACTTACTTTAAGAGCTATTAGATTAGTTGCCCCTAAACATTCTTATGTCTTCTAGTTGTCCTAAATGATTAGAAACTGATTCATGATCTAGAATAAAGTTTAGTTTTAACCATACTGCCCAACCATTTGGGCATGTATGACCTATTATTTGGCTCCTCAGATTAATTATCCACAATCCAGGTGGACCTGGCAATTTTGACCTGACTTGAATTGTAATTGCATGGACCATTCCAGGGCACCCACAGATCAGGCAATTATAGTTTGGAAATGTGCTAGTGCAGTTAGTTTTCTGAATGACAACCTGGACCGCAGCCTAGCAAATCCAAGTTTTCCTGCAACCAGCAAGGTGGAAATCACACAGGTGGATTTTTCTTGTGTGTCATTTGCTGTAACTATTCAAAATAGATTTAAAGAGCTTGGTAAGTTTTAACTGTTTAGTTTTTTCCCTGAAACATGAGATAATAGTTTGTTTACAAGATTTAAAAGGAttataaattaaaagtaattttgtaGTGTAATAACAGTATCATCACTTTAACTTGCCAAATCAGTGTTAATTGTAAGCAATAGCACCGTTATAAACACTTCtgcctgagtttgattctgacaTAGGCACTATCTGCATTGGTTTTTCTCTGGGTACATTGGTTTTCAcacatactccaaaaacatacaggaaggttcattggctcctaatgaaaaaatagtaaataataataatcctgtttttttttttcagtgcattaTGGCTTTTGAAAGACAAGCTTTTACAGAAATGAATGATATATAGAAATGCTATGCAATCAGTACTGCAATTTCTTCGGCCACATACGGGAATGAATGGTGCCGGTCCACTGATTGCATCAGAACTGACAATGATCTGTACAACGGGCAACACTTTTTCTGATAAAAGCATCCAACAATTTACTTGAGTCTAGTAATCTGTAATGATAGAACATGCATatccaatttgcatatgtgatTGGACAGACTTCAGATGCCTGAATATTACACAAGCTGGGGGTAGCAGGTTGGAAAACCACAGTGaacacaataaatacattataatacaaaCATTTGTGATAAAGTGTACTGTAAAATCTATAATAACCGAATACATTCATATGCAAACCTATTGTGCTCCATTAACAGCATGGCTGGTTACCGTGGAGGTAATAAAGGTCTTATTTATGGagttcaaaagtaaatataaggcATCCACTCCAAGactaatatataatttcaatatgtTTTATACTGTAAGCATACAGtactcattaaaaatgttttggtaaAAAGTGTCTGAGGTTTTGTGATAAGGCTAATGTACAGTGTAAGTTGTGTCTGAATAGCCTCACACCATGCTGTTGGTATTGTACAATATTGTTTTTCCCATAGTCTTTAATGGCTGGCtggttgatttattttattgctggcaatcaactgaaataaaatgatttctgAACAGTGTACCAGAAAGATGCCAAGAATTTCACTCACAAACTTGGTACATCCAGGAAAATCGTTTGTCCAGAATGGCTCAAACTGACCCCGGTTAGGAGATGGCTACTTTCTCATTTCTAACATAACAGGAAAGCTTATGGAGATTGGCTGCACCATCTAGTTTGACAGTGAAGTCATTGTGGTTTTGATATCCACTGCTGGACAAGGCCAGacgaatttgtgtttttttttggctgttagAGAGTGGTGCTCAAGAAAACGCCACATGCAGTATtcaataaaatgttgaattatacCCCACCCAAAATTCTGCTTGATTACCTGCCCT

CDS

Gene model

Entrez Gene

549532

734757

mRNA

RefSeq

Protein

RefSeq

Swiss-Prot

Genomic

tropicalis

laevis.L

laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

More Information

Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Ensembl

Proteomics

tropicalis

laevis.L

laevis.S

Embryonic Protein Expression

Stage profile:

Data Mining

tropicalis

laevis.L

laevis.S

XenMine

efcab1

efcab1.L

efcab1.S

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR,

EFCAB1

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Efcab1

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

rat

RGD, AGR

Efcab1

Ensembl

zebrafish

ZFIN, AGR

efcab1

ZFIN

Ensembl

chicken

GEISHA

EFCAB1

Ensembl

fruit fly

worm

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Functional Ontologies

tropicalis

laevis.L

laevis.S

3 terms

0 term

1 terms

PANTHER

efcab1

KEGG Pathways

KOG

[T] Ca2+ sensor (EF-Hand superfamily)

Reagents

tropicalis

laevis.L

laevis.S

CRISPRscan Tracks

efcab1

ORFs

efcab1.S ORF1

Clones

Horizon Source BioScience

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