|
XB-GENEPAGE-
5824738
|
Gene Symbol: st8sia1
Gene Name: ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 Synonyms: Xlgd3 , siat8 , siat8a , st8sial Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: Sialyltransferase Protein Function  :
Involved in the production of gangliosides GD3 and GT3 from GM3; gangliosides are a subfamily of complex glycosphingolipids that contain one or more residues of sialic acid. Glycosphingolipids are requ...[+]
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: |
|
| Xenbase Gene ID | XB-GENE-5824739 | XB-GENE-5824746 | XB-GENE-17345803 | ||||||||||||||||
| Gene Symbol | st8sia1 | st8sia1.L | st8sia1.S | ||||||||||||||||
| Chromosome | scaffold_1161 | chr3L | chr3S | ||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 | ||||||||||||||||
|
Entrez Gene
|
Entrez Gene
|
||||||||||||||||||
| mRNA |
Refseq
|
Refseq
|
|||||||||||||||||
| Protein
|
Refseq
Swiss-Prot
|
Refseq
Swiss-Prot
|
|||||||||||||||||
| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Genome Browser |
|
|
|
||||||||||||||||
| Links | |||||||||||||||||||
| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||
| UniGene | Str.24556 | Xl.29879 | |||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
|
|||||||||||||||||
| Images | 1 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| XenMine | st8sia1 | st8sia1.L | st8sia1.S | ||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||
| Orthology |
|
||||||||||||||||||
| human |
|
||||||||||||||||||
| mouse |
|
||||||||||||||||||
| zebrafish |
|
||||||||||||||||||
| chicken |
|
||||||||||||||||||
| fruit fly |
|
||||||||||||||||||
| worm |
|
||||||||||||||||||
| Publications | |||||||||||||||||||
| First: |
Cloning and functional characterization of two key enzymes of glycosphingolipid biosynthesis in the amphibian Xenopus laevis. [Dev Dyn 2008]
|
||||||||||||||||||
| Most recent: | |||||||||||||||||||
| View All Papers | |||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| GO | 8 terms | 10 terms | 0 term | ||||||||||||||||
| EC |
a-N-acetylneuraminate a-2,8-sialyltransferase
|
||||||||||||||||||
| PANTHER | st8sia1 | ||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K03371 | K03371 | |||||||||||||||||
| KOG |
[G] Sialyltransferase
|
||||||||||||||||||
| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.24556.1.S1_at | Xl.16346.1.A1_at | |||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.29879.1.S1_a_at [+] | ||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
