actr6 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

Gene Literature (2)

XB-GENEPAGE-5860963

Gene Symbol:

actr6

Gene Name:

ARP6 actin related protein 6 homolog

Synonyms:

ARP6 ( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

Actin-related protein.

Protein Function Downloaded from UniProtKB

InterPro

Arp6 , Actin , Znf RING , Filamin/ABP280 rpt [+]

Interactants:

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Diseases:

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

Xenbase Gene ID

XB-GENE-5860964

XB-GENE-5861033

XB-GENE-17346597

Gene Symbol

actr6

actr6.L

actr6.S

Chromosome

Chr03

chr3L

Molecules

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>actr6 9.1 
							CTTGTCTCCCTTCCCTGTTACCTTCTATTCCGCGCCTACTCTGTTCGGATATTTTTGGcacaaaactacaaaaatacGCAACTACGAAAGTCCTCCCacatcccacaatgcactgttctGCGGTATTGGCAGGTTCTTGCCGGATATCCGCTTGTTCCCGTACAGTGATATGTGATTGTTAGTTCAAGCTTTGTGAGTGGCGGGCAAGATGACCACACTTGTTCTGGACAACGGGGCTTATAATGCAAAGATTGGTTACAGCCACGGACAAGTGAGGTGCGCTTAACATCGCCATGGCCTCTTGAAGTGTTAGCCGTGCTATTTTGTGTCGTACTTCTGCACTGACATATACACAGATCCCCAGCAAGCAGAATTCCCATGCTAAATGGGTTTCTCCGGCTACTAAAGGGTGGCATTTGTTAGATTCTACTGATTCCTGATGTGATTGTAATAGTAAAATAGAATCCACATTTAAATGGCCTAAAAGCCAGATGTATTGTAGCGCTGAAGAGTTTATAAAGCTTTTAAACCTTTTAAtcttacatttcttttcttcaaaTGTAGGAAGAAATCTTGGAGACTGACTGTAACTAGCATAGGGCTGCTGCACATTCCCTGTTACTGAAACcagggtgtaactatagagattgtaagctcttttgggcagggctctcttcacctcttgtattggttattaattgctttatatgttactctgtccaatgtatgaaacccacttattgtacagcgctgcggaatatgttggcgctttataaataaatgttaataataatagagaaAGCACACCCTAAGACTGCTGGGTGCTAGGGCACAGTGTGTATGGGGCCCAGTGAGACAATGACAGTTAAGCaatttgttttatgaaaaatgttattgttaaagtTTAGAAAAAGGGCACTTACCCTTGCGGTGCACAGCAGTGCATTACATGTTCCTACAGTAAACACTCCACCACATTTACCAGTACAGCAAGGGTGAGAGTTTTTATATGTATGCCAATTGCAATACCCGTTTTATAGTATACTGGTTGACTGACCTGTTCAGCTTGTAATATTCAATATGTGGGCTGCACCATTCGtcctttaaaatgcagaatgcgGGAATATATTGGACAAATTGTGTCTAAGAGTGGCAACTGTCCAGtttcaaaacattttatacagtgttGCAATGGCGATGTGTCCCATTTACAGATACAGGTGATCGATAGAGTGTTGCCAGATGAAAGAAGTAGAGATAGATTCACTAGGTTGCTACGTTTGGAGGGTAAATGGATTTTTAAGTTAGGTACACGTCAGCCAAAAGGATTAAATTCTGTTTTTGACATCAGTTGTTATATTGCCTCCAGCTGAGTTAAACCTTTTAATAAAGTTAATATTTGATATGGTTAAGTTTACAGTAGGTCCTCCTTATTCACATTGTTTAATTGCAGTttcatttattgctttatttattttatttacagagatGTATATTAGTGCTGAATGTTATTTGGTTACAAATAATACGTTTTGTCATTTGATGTATTGTATAATGctataagaaaaagaaagaaacaaaaatttGTGTGCCTCTGCACGAAACTAGTTaggctttgttcttttaaatgagcgaataaaattggattttaattgaCTCCTGTGGATGGTCCTGGTGTATGAGCACAGCTGTTTTTTCATGTGAAGTTTAGAAAAGCActtaaatgattttgctgtgtcGCCTTCAAACTTTTAGGTATGCTAGTGAGCACATAATGCTAAAGATAATCATACAAGCAAAGATTGGTAGAAGGCAAGAATGGCAAAAGATACTCATCGCTAGAAAAAATATCCCTGCTTGCATACTTCATTATTACTTGGAAAATGGGTTTATGTGTCAAGATATGGAGTATTGTACATAGAAAGCATTTAAATGCAACACAATAACACAATAAGCTGTTGAAAATATTCCAGTAGTGCTTGCAGTTTTCCTTACATGCGTTTCTTTTTATTGCAGTGTAATTCCCAACTGTCAGTTCAGAACCAAAACAGCACGTTTAAAAACATTTACAGCTAATCAGATTGATGAAATAAAGGATCCATCAGGCTTATTTTATATTCTCCCATATCAAAAGGTAACATGTTGGTGTTTTTTAACAGGACCGTGTGCATATATGTCTTCTTATGTGCAGTTTTTGAcagaataaacatttatacacaatGGAAATTAATGTTATAGCAGCTAACTAATTACTATTAATATTCTTATAATAATGCAATAGGAACTTCATAGACTGTTTCACCATAATAAGGACCTAAAAATTAATGGGCTagtgaaaataaaaatcttgacagTGGCTGCAACAATAGGCACCTCCATTTATATCTATGCAGTGGTATAGTTCTGTAATATATGTAATTTAGTACTAATGCTACGCTGGGTGAGTACTCAGAGATGAGTAAAAAAAATCAGGGAAAGTCACCCAGAATATAACTGATTTTCTTCTAACAGAGCAAGGCATATGCTTGTCGGCAGTTCTCCATAATGccttgtgtatatagtttatctATATTGTGCTATTTGTATATGCAActttatgcatttttatattgccaACAGACTTATGTATGTTTTCATATTTATGTCAGAGATGCCATATTGTTTACTGATCTCCATAAACTGCTAGAGTAGTGCAGAGAGAGCTCTTCTGTTTAGGATAAGCATATGGCAGCTCTACTCACCTATACACATGCTCTactcaaataaaaatgtaaatatggaaGAACCTTCCTACAGATAAGTTATATTTCTTGCAAAATTTGCTGTGTTTATAAGCACAGCAAGACAGGAGGGAtcatcattatgaaaaaaacgcattcggatgcttttcggacgttcgtggattagtaaatgtgcccctaagtatcttaataaaaaagttggcccgcgacttagcctgcgttttagatttcggccgccttatatgattgagtttgacacccctgtagTAGACATTTTAAAGCTGCTAAGTATAAAACTGGGTCATACATAATGCAAAGAACCTGCAGTGTCTAACTGGCATTTTTTCATATGGATAGAAGTTACTGTAGACAACAAAAACAATACCATCTGTATATGACTACCAGAGTCCTGGCTTACCATTATGGAGAATATACGAGCAGAGGCAAGCGCCACAGCAGCTCCTTGATGTGAAGGAGAGAGTAATGCTCTCACACTTTAAGATATActcaacaaaatatatattcccTGATAAGTGGCACATTTCTCTTGACAGATTAATTTTTACTCTTTGCTTACCAGCATTTAAATCAGCATATGAATCAAATTCCCAGCATGAGTCATTTACTAAGTCCTTTTAATTTTTACTTGGCTCCTTGTGAtgtaaggaattctgggaagggaATCACAATGTTATTTACATGGTTTTCACAATTCAGACGTTGGGCTGCAATTTATTTTGTCTGTTTCAAAATGTCTACTAATGTGTCTTACTCCAACACGATAGGGTTATTTGGTCAACTGGGATGTCCAGAGACAAGTTTGGGACTACCTTTTTGGGAAGGAAATGTTTCAGGTATTGTACTTGCCAGTTTATCTTATCAAATTGTGTATGtaattttaaaaggaaaactgtgTCACATTTACAGATTAGGCTTTCACTTCCATATATTTTCTCTTATGTGTATGTCATGTCAGGCAGTGTTTCTGAGGAAACTACACTTTGAAGGAAGTTGTATCTGCTCTGTCCCATTGTTAGTCTGGTGCAACATCAGCCTTAAATAGACTATATAAAGGCATAAATTATGTTGTGTACAGGACACTCATTCTGACTCTTTTGGTTTTTTAATGTACTTAGGTGGGTACTGATGAACAGCTTACCTCACCCAAACAAAAAGATTCTCCACAAACCACAGCTAAAGTGTGGCGTTCGGTGGGATGTGTATATCTGCCCTTGCAGCATTGTGCATGTGTTTAATACTGTTGTGAGTCTTTTCCTTACCTAGTtactaagactaaggggctgatttactaatccacgaatccaaatcccgaatgggaaaaaatcagattggaaacgaacattttgtgactttttcgtatttttttgcgattttttcgtagccgttacgacttgcacgaattgtcacgactttttcatagccattatgactttgtgaattgtcgcgacttttgcatagccattatgacttcgtgaattgtcgcgacttttgcatagccattatgactttcgtgaattgtcgcaacttttgcatagccattatgactttcgtgaattgtcgcgacttttgcatagccattatgacttcgtgaattcttgttgcgacttttgcatagccattacgactttcgcgaattgtcgtgattttttcatattgagcgctctaAAAATTTGCGATaattctcaaaaaagttgcaaaataccgatcattatgaaaaaaacgcattcggatgcttttcggacgttcgtggattagtaaatgtgcccctaagtatcttaataaaaaagttggcccgcgacttagcctgcgttttagatttcggccgccttatatgattgagtttgacacccctgtagTAGACATTTTAAAGCTGCTAAGTATAAAACTGggtcatacatatatataggcaAAATTGTAGGCCGATTGCTAAGTTGCTTAAGCTTGGAAATCGGCAGTTGGAGTTATTATTTCATGTTACAAATCTGGGCTTATATTAGTGTTGATAATCAGAATATTTTACTGTCTCTATGCAGGTGGACTTTCCTGATTCTAATATAATTATTACAGAACCTTATTTTAACTTCAGTTCTATTCAAGAATCCATGAATGAAATTTTGTTTGAAGAATATCAGTTCCAGGCAGCTCTCAGAATTAATGGTGAGTGCCTCTTGATATTGGAAATTCTTAGAAGTTTTCAGTGAGTGAGTGATTCAGTCATCATACCCAGTGAA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Version 9.2

>actr6.L 9.2 
							GGCGATTCGCTGAATGGCGTACCACATAACCACTTGCGTACCACGACTGTGCTAGTCTGTTCGGTGCTTGCCCTGTTCGGAGATTTTTGGTAGCAAACTACTAAAACGTTGCGATATGAAAGTCCTCCTGcatcccacaatgcactgttcTGCTCGCCGGATATCCGCCGCTGAAAGTGCGCTAGTTCCCGTACAATGATGTGTGATTGTTAGCAGTTcaagctgtgtgtgtgtctggcgGGCGAGATGGCTACACTTGTTCTGGATAACGGGGCTTACACGGCAAAGATTGGCTACAGCCACGGACAAGTGAGGTGCGCATAATGTCGGCAGTGCAGTGTTTGCCGTGTTATTCTTTCTCATACTTATGTTTTAATCCCCTGCAAGCGCCCTCTCCATGCTAGTGTTGTTCGCTGGGCACTAAAGCCTTTGTCAGCTGCTGATCCCTCAtgtgtttgtatatgtaaatCAGAACCCACGTTTTATTGGCCACGAATAGTCCAGCCAGCTGTAGTGAAGCAGATGAGATCCCATAACCTCATACATGATGTTTAAACTGCTTGGTTGCTACGGTATACTGGACACTAGCAACTAGATATTTGGCAAAATACCATACTGCagagctgttaaaggagaagtaaacccttgctactaaaatcccctaccctatgtagacccacctccctgctcccccccagcctaggtggtacaattgctaaatgcccctaactctttactaacccctcggtgcagattctgtccagtggagttcgcgggcgccatcttcacccgcttcggtaatcttctgatCTTctttccctttggcaatttccgtgacttttgtcGCATGCATAGTTGTCgcgaaatagaaaattgcttcaactgcacatgcgccgatacagcactttccgaagattaccgaagaaaagaTGGCGCctatgaactccgctggacagaatctgcaccgagctGTAAGTAAAGAGATAGGGGcctttagcaaaggtaccacctaggctgggtggggggagcagggaaggggtctatgtagggtaggagattttagtagcaaggctttgtttctcctttaaacaaaaagataaataaaaagcttaaaaaaagatTACCGATTGGAAATAATCTTATAATATGAATGCctaaatcatacaaaaattttaattaaagttgAACCACTGCTTTAACCTGTTTTCGAGGGGACCAAAATTAAGTTGAGGAATCGGTTTCAGGATTAAAGGTAGTAATAGAGACTGACCATAAACATCACATAGGCACAGTGTGTACAGGGCACAGTGAGAACACCAACACCGATTGGAGCAGTTTGTTTTATGAAAACTGTTAGTGTCCAAGTTAAGAAggccctaaaataattttgctgtggtgCCTCATACCTTTTCCAGTGAGCACACAATACTTAAGATCATCTAAAGAAAACATTAGTAAAAGGCAAGACTGAGCAAAGATACTGATTACTAGAACAAATATCACTTCTTACATACTTCATTACTTAGAAAAATGAGTGATGTGTCAAGGTGAACTGAGCATTGCACACTAGAAAGCATTTCAATGGGAGTGCAGTGAgctactgaaatgaaaaaagttgcaatttgccttacatgcttttctttttattgcagtGTAATTCCTAACTGTCAGTTCAGAACCAAGACTGCAcgtttaaaaacatttacagctAATCAGATTGATGAAATAAAGGATCCATCTGGCTTATTTTATATTCTTCCATTTCAAAAGGTAACACAGTGGCTTTTTTTCAACAGTATTGGGTACATTTTGGGCAgaataaatgtttattacagtaaaaaaaaaattaaatatgatgtAAAAGCAGCCAGCTGATTACTAATAATATTATAATGATGTAATAGATACTTCATAGACTGAGCATAATAAAgacctaaaaataaatacagtggtTAGCACAACTGCTTTGCtggtaataaaaaggaaaaaaatacagtttgtatatttatatgtatgctgTGGTATAGTTCATATTATTCTCCATTAACTGCTAAAGTGCATTTCATTCAAGAAAGAGCTGATAGAGAGTTCTTCTGTTTAGGATCTTCTGTTTAGGATAAGTGTATTGGCAGCTCTACTCATGTATACATATCTATTCAAAAATGtctactaataaaaaaatgtgtttcttaatgTATCACATTAGGGTTATTTGGTCAACTGGGATGTCCAAAGACAAGTCTGGGACTACCTTTTTGGGAAGGAAATGTTTCAGGTATTGTATTTGCCAATTTACCCTTATCAAATTGTGTGTgtaatattaaaaaggaaaattgtgtGAGATATAGATTAGGCTTTAGCTTTCGTATCATTTTTTACTTGCACTAGGCAAGAAAACTGGTTAACAATTGAAACAGAATATTGAAATAGCCATTTTTTAAAGCTGCCAAGTTTAAAATTGCACTATATGAATCCTTATAGTGTCATAAATCGCCCTCTTTCATCACCCTGCTCAGCTATGTTCCCAGCTGTCTACAATTGAATgctattttgtgcaaaaaataaccACTTTAGAGAAAGATCTATCAAAGTAGGCTTTCagtgttgcttaaaggggttgttcaccatccaaacacttttttttcaattcagttgtttttagagtgttccccagaaataaagactttttttcagttactttccattattttatttttttttactgtctttccaaaatctaagtttaaagtttaatgtgtctctggtgtttaagtctggcagctcagtaattctaatgcagactctaaactgttacaattttgcaacatttagttgatacatttgatacatttctcagcagcatctctggagtattagtaagtattgtatcaattctaacagctgcctgtaaggaAACTCAGAGATttttctcagcagggacaaagataagaaatttatcaactaaatgtatccatttagaacagtttacagggtcggcgacccacccCCTCcaagggctgcttcagaaggtgaaaaagacacttgacacttcaatattagaaaaactgtcacacatagaaaatagcaagtcattgggaaaagtcattatttctggtgatctatctgaaaacaactagttgtttgaaggtgaactgcccctttaaatctaGGAAGCAGCAGCAGTAGGAGTTGTTATTCTATATCATAGAGCTGTACTTGTATAAGTGTTGATACTGGGGGATCTTAACATTTTCCCTTCTCTATGTAGGTGGATTTTGCGGATTGTAATATAATTATTACAGAACCTTATTTTAACTTCAGTTCTATACAAGAATCCATGAATGAAATCTTGTTTGAAGAATATCAGTTCCAAGCAGCTCTCAGAATTGATGGTAAGTGTCTCATGATATTGTGAATTCACAGAATACTCTAAATTGTGAGATTTTCATTAGGGAAAGCTTTCATTTGCCTCCTATTTTCAGTACTGTTTTTTACCTATCCTGTGCATTCCCATGTATACAGACATAGATCAACAAGTTGGCCAGAAACACACAAGAAACAATTGGCAGATAATTCAAACATGATTAATACCGGTtaattctttaatatttttagcAGGAGCTTTGAGTGCACACAGGTATTTTCGAGATAACCCATCGGAATTGTGCTGCATCATTGTAGACAGTGGTTATTCTTTTACACATGTTGTACCGTTCTGCAGaagtaagaagaaaaaagaaggcaTTATAAGGTAGGCTTCTTCTACACAAATGTGTCCTGCAGCTCTGTGGCAGCAAGTCATTTTATCTCCTTTGCTTGCATAAACACTATGGGATTGGCAGACTGTTGGCAGACGTCAAGTAGCATTCTTGTGGTGTAAGCAAGTGTTTAGCTTGGGAGCCAATAATAATAATCGCCCATAATTTATTTTGTCTTGCTTTTTGTCTGAAACCTACTCATTTTGAGTTGGCCTTATAGATTGAAGTTCCATAGTATGTCCCCCCTCAATAAGAAGTTGAACAGCTCTCTACCTGACCAGCATTTTAAAACTAGTGTACGTTGTtggattcatttttttgtttttcttgtttgtttgttatagGATTAATGTCGGAGGAAAAGTAATGACAAATCATCTTAAAGAAATCATTTCATACAGGTATGTAGACTAATAATTATCACAAAGTATTTTTGCTTTGTATTTCATGGTAACATGATCTCATTTGAGCATTATCATAATATAATCATTTGGTATTATTTGCCTCTCTCCTTTGTGCATTCTATAccctattatattattataccctACTATATTACCCTTTATTAGTCTGCCTCCAGTTTCATTCTTATGATgcataggttgaaaaaaaatatttttcttttataaagtttAGCTGATTACATGATATATGTAGTATATGTAGATTAATAACATTTACAGTTTGTTTCCACTTCTTTTGATCTATGCAAATTATGTTTtccaggcagctgcaggttaTGGATGAAACACATGTAATTAACCAAGTCAAAGAAGATGTTTGTTATGTATCTACGGATTTTTATAAAGATATGGAAATTGCAAAGTATGTATGTGCAAATAGAAAAGTATTTGAAGCCACAAACCATGTGTTAAAGTGTTTGCTCCTCGATCAAACAGTGATCTGTTTTTGCCAAATCCAGAGAGAAagtttgatgtagagaatgaAGGTCCACTGGAGAGCAGATGTGTTCAATTTCTTAAATGATTTATTGAAGTtgcatagcactacatgtttaGGACCACTTAGGTCCTGATGCAGTTGAAGAAGGACCCAagtggtctgaaacatgtagcACTATGCAACtccaataaatcatttaaaaaaagtatgtatGTGCTTGACTGAAAGATGCTTTGTGTAATTACATAGAATACATCTAATCCCATATATTCttttagacttaaaggagaagagaaCTCTGTGATGGTGGACTATGTTCTGCCTGACTTTAG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CDS

Gene model

Entrez Gene

549226

100037212

mRNA

RefSeq

Protein

NCBI Protein

RefSeq

More..

NCBI Protein

RefSeq

More..

Genomic

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

More Information

Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Ensembl

Proteomics

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Embryonic Protein Expression

Stage profile:

Data Mining

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

XenMine

actr6

actr6.L

actr6.S

Phenotype

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

Smith Morpholino Screen

tegg077g12

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR,

ACTR6

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Actr6

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

rat

RGD, AGR

Actr6

Ensembl

zebrafish

ZFIN, AGR

actr6

ZFIN

Ensembl

chicken

GEISHA

ACTR6

Ensembl

fruit fly

worm

Publications

First

Defining synphenotype groups in Xenopus tropicalis by use of antisense morpholino oligonucleotides., PLoS Genet 2006

Most Recent

Left-right patterning in Xenopus conjoined twin embryos requires serotonin signaling and gap junctions., Int J Dev Biol 2014

All

View All Papers 1 paper(s) referencing morpholinos

Functional Ontologies

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

10 terms

2 terms

0 term

PANTHER

actr6

KEGG Pathways

K11662

KOG

[Z] Actin-related protein - Arp6p

Reagents

X. tropicalis

X. laevis.L

X. laevis.S

CRISPRscan Tracks

actr6

Morpholinos

actr6 MO1

ORFs

actr6.L ORF1

Clones

Horizon Source BioScience

Plasmids

Addgene

Symbol legend:

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