[provisional- machine annotated only] Gene Symbol: cpeb1 [Predicted: Source is Human Entrez Gene] Gene Name: cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 [Predicted: Source is Human Entrez Gene] Synonyms: CPEB Add Xenopus synonyms Gene Function: Predicted RNA-binding protein (RRM superfamily) Interactants: ccnb1(19) , tacc3(19) , mos(18) , eif4e(12) , cdk1(9) , papd4(9) , aurka(8) View All

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Molecules		tropicalis	laevis a		laevis b
Gene		JGI XT Genome 7.1 JGI XT Genome 4.1 Ensembl 4.1	JGI XL Genome 6.0
		Entrez Gene	Entrez Gene		Entrez Gene
mRNA		Refseq >NM_001017330|Xenopus (Silurana) tropicalis cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 (cpeb1), mRNA GGGGAAAAAGTCACTGCATGCAAGTCCAATTTGGATTTAAGTTTTAATTACCCAACCCTGACCAGGATCCTGTGCCATGGCCTTCCCACTGAAAGATGATTTAGGGAGAGCCAAGGATTGCTGGGGCTGCCCATCTGAAACCCCAGCCCTTTCTACCTGCAGCAATGCCGATATATTCAGACGAATAAACGCAATGCTAGACAACTCTCTGGATTTCACTGGTGTGTGCACCACCCCAAACACCAAGGGCAAATGTGAACACCTTCAAGACTACCCAGACTCTGAGGGAGCTGCAGCTAGCAGAATGCTGTTTTCCACTTCACATGAACCTCTTCCTCGCGGCCTTCCAGATACCAATGACTTGTGCCTTGGCCTTCAGTCTCTCAGTCTTACAGGGTGGGACAGACCTTGGAGCACTCAGGACTCAGAAGCTGCCGGACAGACAAGTACTCCAACAGCTGCTCAGTCTGTCTTTAGTATGCTGAACAGCCCCATGGGGAAGCCAAGCCCCCTGGGCTTTCTGCCATTGGATCCAATTGGTTCGGACCTAGTGGAGAAGTATCCCACTCCTTTGCTTCGTGGCTCTCGATTGGACAGTCGCTCCATTTTGGATTCTCGCTCCAGCAGCCCTTCAGACTCTGACACTAGTGGATTCAGCTCTGGATCAGACCACCTTTCAGACCTAATTTCAAGTCTTCGTATCTCTCCTCCACTGCCATTCCTCCCACTGGGAGGTGGAGTGTCAAGGGACCCTTTAAAACTTGGGGTTGGCTCAAGGCTAGACCAGGACCATGCAGCCTTAGCAGCAGCAACTGCCTCTCCACTTGGGATATCAAAGAGATGGCCTGGCACTTCAGTCTGGCCTTCTTGGGATCTTCTGGATTCTGCAGAGGACCCATTTAGCATTGAGAGGGAGGCACGCCTACACAGACAGGCTGCAGCTGTGAATGAAGCAACCTGCACCTGGAGTGGGCAGCTACCCCCTAGAAACTACAAAAATCCTGTGTATTCCTGCAAAGTCTTTCTTGGTGGTGTCCCCTGGGACATAACGGAAACTGGACTTATCAACACGTTCCGTGTATTTGGAGCACTTAGTGTTGAGTGGCCTGGTAAGGATGGCAAGCATCCCCGCTGCCCTCCCAAAGGTAATATGCCCAAAGGTTATGTCTATCTGGTATTTGAATCGGAGAAGTCTGTTCGTGCTTTGCTTCAAGCGTGCACCCAGGACCTACTAAGCCAAGATGGGCTTAGTGAACACTACTTCAAAATGTCCAGTCGCAGGATGCGCTGCAAGGAGGTGCAAGTTATTCCTTGGGTGCTTGCAGACAGCAACTTTGTGCGTAGCCCGTCACAGCGGCTGGATCCCAGTAAGACTGTATTTGTGGGGGCTCTACATGGCATGCTAAATGCTGAAGCACTGGCCTCTATTATGAATGATCTATTTGGTGGAGTAGTCTATGCTGGCATCGATACTGATAAGCACAAGTATCCAATTGGGTCAGGTCGGGTGACCTTCAATAACCAGCGCAGTTATCTTAAAGCTGTCAGTGCTGCATTTGTCGAAATTAAAACTGCCAAGTTTACAAAAAAGGTTCAAATTGACCCATATTTGGAAGACTCTGTTTGCCAGGTGTGCAATGCTCAGCCTGGGCCATTCTTCTGCAGAGACCAGGTTTGCTTTAAGTATTTCTGCCGCTCTTGCTGGCATTGGCAGCACTCTATGGAAATCCTGCGCCACCACCGCCCTCTTATGCGCAATCAGAAGAGTCGTGACTCAAGCTAAAGACGTCGGCCCTTGGAGCAACATTGACCTGAAGATCTGACATAGCTGGATATGTTGAGCTAAAATGAGTGTTCAGAATTTCCTCCCTCCAGCACTGGAAGCACTTGTGTTTTTTTGTTTTTTTTCCAGAGATAGATCAGAAATCAGTGGATTGTGAGGGGTAATGTCACTTTTTTGCACTTGCTGTACCTTGTGGTAGTTTTCTCACTAGTGCACACTGAAATTTGCCAGGTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTTAAAAAAAGAGGGGATATTTCTTCTCAGGACTTGCAGTTCCCAGACTGGGCCTACATAACCGTTGCTGAAAGTAAGCAATGTTCAGGGCCTCGTTTTCTTAAGGTTTATGGCTAGTGATGCCTCTGCTTTTGGTTAACTTTTTTTTTTTTATTACAAGCGCTTCTTTTACATTCCTTGCAATACTGCTGGTGATGATGCAAATTACATTAATCCTCCCATGTTTTGCTGTTGCCATACAGTGCCTTCCAATTTATTTGATGTCCCATCTGAACTACATAAACTAGTTGTTCAGCTGACATTTTTACTGTAACAACAATAGCAGAATTTGCTCTTTAAACAAATCATATTTCATATTTTTACCCCAGTGGGATTTTTACCAGTTCCTTTTTACACTCTTAAAGACGTTTTTTAAGTCCATTATATTTTTTTTTTTTTTCTTTTCCTGGCAGCTTTTAACATTACTGCAATTTTTTTTTTCTGTTTCTGGGAGCTGCTGGTTAAGAAAATAAATCTACATAAAATCTTTGTACAACAGAGTTTATAACCAAAAGGACAGACTTAAAGCCTTGACTGAAGCAGATAATGAGAGAGTGTGTATATAGTTTTAAGGAAGTTTGTTGCACTTTTTTTAATTTGCACTTAAGGGGATGGTAGTTTTTAATCACTTTCTGTTTGTATTTGGCTGGACAAAAAGGGCTGTGATATGTCTTGAGAATGGGGTAGAGGCAAGAGATGGCGTGACACCTTTCTCCTGGAGGGAATAAGTGCCCATGCTCTGTTTTACTGTCGGTTTTTTGAAAATAACTGACTTATGCAAACTGTTGCAGGCCTTTAAGATTGTGTCCTTAATTTTTATTTCTACCCCCCCCTTAAAATTGTAAGCTCTGTGCCAAAGACTCCATTTTTCTGTATATCCCCCCTTATCCAGTACATGCTGAGCTAAATCTACTTCCTAGCTGCCCTAAGCAGGGTATATCTGTGAAGCTGTGTGTAAAGTCTCTACCTCATTGTAGTTATGCAAGCAGAAGATGCACTTAATCTACGGATGTGGTGTAGTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTTTGGCACAAAATAAACACGTTGAAGCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	Refseq 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>NM_001095951|Xenopus laevis cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 (cpeb1-b), mRNA 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Protein		Refseq >NP_001017330|cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 [Xenopus (Silurana) tropicalis] MAFPLKDDLGRAKDCWGCPSETPALSTCSNADIFRRINAMLDNSLDFTGVCTTPNTKGKCEHLQDYPDSEGAAASRMLFSTSHEPLPRGLPDTNDLCLGLQSLSLTGWDRPWSTQDSEAAGQTSTPTAAQSVFSMLNSPMGKPSPLGFLPLDPIGSDLVEKYPTPLLRGSRLDSRSILDSRSSSPSDSDTSGFSSGSDHLSDLISSLRISPPLPFLPLGGGVSRDPLKLGVGSRLDQDHAALAAATASPLGISKRWPGTSVWPSWDLLDSAEDPFSIEREARLHRQAAAVNEATCTWSGQLPPRNYKNPVYSCKVFLGGVPWDITETGLINTFRVFGALSVEWPGKDGKHPRCPPKGNMPKGYVYLVFESEKSVRALLQACTQDLLSQDGLSEHYFKMSSRRMRCKEVQVIPWVLADSNFVRSPSQRLDPSKTVFVGALHGMLNAEALASIMNDLFGGVVYAGIDTDKHKYPIGSGRVTFNNQRSYLKAVSAAFVEIKTAKFTKKVQIDPYLEDSVCQVCNAQPGPFFCRDQVCFKYFCRSCWHWQHSMEILRHHRPLMRNQKSRDSS	Refseq >NP_001084072|cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1-A [Xenopus laevis] MAFPLKDDLGRAKDCWGCPSDTPALSTCSNADIFRRINAMLDNSLDFTGVCTTPNTKGKCEHLQDYQDTEGPAASRMLFSTSHEPLPRGLPDTNDLCLGLQSLSLTGWDRPWSTQDSEAGGHSSTPTAAQSVFSMLNSPMGKPSPLGFLTFDPIGSDLMEKYPTPLLRSSRLDSRSILDSRSSSPSDSDTSGFSSGSDHLSDLISSLRISPPLHFLPLGGGVSRDPLKLGIGSRLDQDHAALAAATVSPLGITKGWPSTSVWPSWDLLDSAEDPFSIEREARLHRQAAAVNEATCTWSGQLPPRNYKNPVYSCKVFLGGVPWDITETGLINTFRVFGALSVEWPGKDGKHPRCPPKGNMPKGYVYLVFESEKSVRALLQACSQDLLSQDGLSEHYFKMSSRRMACKEVQVIPWVLADSNFVRSPSQRLDPSKTVFVGALHGMLNAEALASIMNDLFGGVVYAGIDTDKHKYPIGSGRVTFNNQRSYLKAVSAAFVEIKTAKFTKKVQIDPYLEDSVCQVCNAQPGPFFCRDQVCFKYFCRSCWHWQHSMEILRHHRPLMRNQKSRDSS UniProtKB		Refseq >NP_001089420|cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1-B [Xenopus laevis] MAFPLKDDLGRAKDCWGCSSDTPALSTCSNADIFRRINAMLDNSLDFTGVCTTPNTKGKCEHLQDYPDTEGAAASRMLFSTSHEPLPRGLPDTNDLCLGLQSLSLTGWDRPWSTQDSEAGGQSSTPTAAQSVFSMLNSPMGKPSPLGFLPLDPIGSDLVEKYPTHLLRSSRFDSRSILDSRSSSPSDSDTSGFSSGSDHLSDLISSLRISPPLPFLPLGSGISRDPLRLGVGSRLDQDHAALAAATASPLGITKRWPGTSVWPSWDLLDSADDPFSIEREARLHRQAAAVNEATCTWSGQLPPRNYKNPVYSCKVFLGGVPWDITETGLINTFRVFGALSVEWPGKDGKHPRCPPKGNMPKGYVYLVFESEKSVRALLQACTQDLLSQDGLSEHYFKMSSRRMRCKEVQVIPWVLADSNFVRSPSQRLDPSKTVFVGALHGMLNAEALASIMNDLFGGVVYAGIDTDKHKYPIGSGRVTFNNQRSYLKAVSAAFVEIKTAKFTKKVQIDPYLEDSVCQVCNAQPGPFFCRDQVCFKYFCRSCWHWQHSMEILRHHRPLMRNQKSRDSS UniProtKB

Genomic		tropicalis
Genome Browser		Xenbase	Xenbase JGI Ensembl UCSC		Xenbase
Synteny		Metazome

Expression		tropicalis	laevis a		laevis b
UniGene		Str.5854	Xl.984		Xl.29059
Unigene EST Profile		EST Profile	EST Profile		EST Profile
GEO data			GEO		GEO
Images		4 expression image(s) for tropicalis and laevis

Orthology		MOD	Entrez Gene	Genetic Phenotypes	Morphants
human		OMIM:Gene, HGNC	CPEB1
mouse		MGI	Cpeb1	All(3) Targeted, knock Out(1) Targeted, other(2)
zebrafish

Publications
First:		CPEB is a specificity factor that mediates cytoplasmic polyadenylation during Xenopus oocyte maturation. [Cell 1994]
Most recent:		An unusual two-step control of CPEB destruction by Pin1. [Mol Cell Biol 2013]
		View All Papers 2 paper(s) referencing morpholinos

Functional Ontologies
GO: Molecular:		nucleic acid binding
Biological:
Cellular Component:
EC:
KOG:		[J] Predicted RNA-binding protein (RRM superfamily)

Reagents		tropicalis	laevis a		laevis b
Clones		open biosystems	open biosystems		open biosystems
		geneservice/RZPD imagenes	geneservice/RZPD imagenes		geneservice/RZPD imagenes
Affymetrix 1.0		Str.5854.1.S1_at	Xl.984.1.S1_a_at
Affymetrix 2.0			Xl2.984.1.S1_at		Xl2.29059.1.S1_at

Symbol legend[+]

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