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XB-GENEPAGE-
483208
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Gene Symbol: nodal
Gene Name: nodal growth differentiation factor Synonyms: Xnr-4 , Xnr4 , nr4 , nodal4 , Nodal homolog 4 Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: transforming growth factor beta and bone morphogenetic protein related protein Protein Function  :
Cooperation and regulatory loops of multiple nodals are essential for mesendoderm patterning in early embryos. Plays a role in mesoderm formation and may be required for neural development.
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: NODAL, MOUSE, HOMOLOG OF; NODAL |
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| Xenbase Gene ID | XB-GENE-483209 | XB-GENE-864954 | XB-GENE-17339551 | ||||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | nodal | nodal.L | nodal.S | ||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | Chr07 | chr7L | chr7S | ||||||||||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 8.0 JBrowse 8.0 GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | GBrowse 9.1 JBrowse 9.1 | ||||||||||||||||||||||||
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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| mRNA |
NCBI Nucleotide
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Refseq
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| Protein
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NCBI Protein
TrEMBL
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Refseq
Swiss-Prot
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Swiss-Prot TrEMBL | ||||||||||||||||||||||||
| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Str.7735 | Xl.378 | |||||||||||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 3 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| XenMine | nodal | nodal.L | nodal.S | ||||||||||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | tgas097d22 | ||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||||||||||
| First: | Effects of ionic concentration on permeability properties of nodal membrane in myelinated nerve fibres of Xenopus laevis. Potential clamp experiments. [Acta Physiol Scand 1973] | ||||||||||||||||||||||||||
| Most recent: |
Lineage commitment of embryonic cells involves MEK1-dependent clearance of pluripotency regulator Ventx2. [Elife 2017]
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| View All Papers 90 paper(s) referencing morpholinos | |||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| GO | 3 terms | 4 terms | 2 terms | ||||||||||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | nodal | ||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K04666 | K04666 | |||||||||||||||||||||||||
| KOG |
[T] Transforming growth factor beta, bone morphogenetic protein and related proteins
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||||||||||
| Clones | EXRC - 1 clone(s) | EXRC - 1 clone(s) | |||||||||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | StrEns.4645.1.S1_at | Xl.378.1.S1_at | |||||||||||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.378.1.S1_at | ||||||||||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
