lin54 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

XB-GENEPAGE-5752558

Gene Symbol:

lin54

Gene Name:

lin-54 DREAM MuvB core complex component

Synonyms:

( Add synonyms , Nomenclature history )

Gene Function:

Metallothionein-like protein

Protein Function Downloaded from UniProtKB

Component of the DREAM complex, a multiprotein complex that can both act as a transcription activator or repressor depending on the context. Specifically recognizes the consensus motif 5'-TTYRAA-3' in ...[+]

InterPro

CRC , Tesmin/TSO1-like CXC , Lin-54 fam

Interactants:

Loading ...

Diseases:

External Links:

ClinVar, ClinGen, MalaCards, KEGG Disease, DECIPHER, COSMIC, MARRVEL, GTR, DisGeNET, dbVAR, GHR, gnomAD

Xenbase Gene ID

XB-GENE-5752559

XB-GENE-6486664

XB-GENE-17338623

Gene Symbol

lin54

lin54.L

lin54.S

Chromosome

Chr01

Molecules

tropicalis

laevis.L

laevis.S

Genomic Sequence

Version 9.1

>lin54 9.1 
							ctcctccctccctCCTAAATGAGTGCTACCTTCTTCTTCCGGTGTGTGGGGAGCTTGGTCTAGCTTCTCTTTTGCTGCACAGCCTGTCAGAGTGTTGGGGGTGGAGGCTTATCAGGATGACGAGGTGAAAATGGCGGATCTTTCGAAACACAATCCCGGCCCCTGACATTCCGGGAGAGTCTACACAAATACCCGAGGAACGGATAGTCGAACAATAACAATCGTTCCGGCTTCACGCTTTCGCTGGATCAAATTTGGGTTTTCCTCCTGGCTTTATAGGAGACGGACCGGCGCCTGATTCCCCGCCTTGCAGACTCTCTACATAAGCACAAATAAAGAGTTGCGGCGGGCAACCCCGTTCTGTGGATCTACAGACTGGAGGAAACCCAGAGGTAAAGCATAGCATGTACGGTACAGAGTAGTCTCTTAGTGTCATACTTAGGGTATGATATGCAGAGTCTCTTGGAGTCACTGTTCCAATAGGGCCACCAATCGCTTTTGAAGTGTTCATTTGGGCTTTGCAGGCTTAGAGTTGTGTTATTTAACCACCTGTCAGAGGTCGTTGAGTTTAATTTGGAGCTTGTGTTTATGGCTCAAATGTGTTATTTAAGAGGACACTTACAGATAACTGGGTAGCTGTTGATTTATTGGGCGGGTACCATCTTTGTAGTTTTATTTCATGGGAAGGAGTGTGATTTTCCCACAGTGATTTCATGTTTGtattttaatcaattttattAGGGCATATGTGGGGCTGCGAATGTCACAGATAAACTGTTCAgcgcctttaaaggagaaggaaaggttaaatcactgggtgtgccaaaatgttacgcACCCCCTTAGTGAtcgtaatcgcttacctgaaacccccttccggtgctcctgttaagagaaaagtGCACCGGCTGGGATGTATGCAAGCTAGCGATCCTTCTTCCCGCTTCGGTCTTTGCGCATAAGCTGTAGAGTGAACTGTGCATGCGTCGGCCCTGGGATTCTGAAAAAaggagacaggaggaagaggaacacTTACTCgcatataccccaggctggtgcagttttctcctaacaggagcagaGCACCAGCCAATGGTATCAGGTACGCAACTACAATCGCTGGGGGGTGCTTAACAGACatccatccatcaagttcaaccttaatgcctatatataacctgcctaactgctagttgatccagatgaaggcaaaaaaccccatctgacgCCTCTCTAATtggagggggaaaaattccttcctgacttcaaaatggcaatcagaccagtccctggaccaacttgtaataagggctatctcccatagccctgtattctctctcttgctaaaaagccacccaaccccttattgaagctatataatgtatcattagattcagggagagaattccacaacttcacagattagagagattattatatgattcccttatatatttatacatagttattatatcacCCATttagtgcctcttctccagtgtaaacaatacTAACTTGGACAGACCTTCCATACCTTTTAccagttgcccttctctgtactgtctctaattcagtaatgtcccatttgagcactggagaccaaaactgaatggcatattatagatggggccttaccagtgctctgtaaagtggaagaataaccccatTCTcttgtgaatctatgccccttttaatacagctcaaaaccttgtttgcctttgcagctgctgcctggcattgcttactacagccaagtttattatctacaaggactccaaggtccttctatatggatttgccaagtgcagtccctttagggcagtgacacacggggagatttgtcgccactggctagaatgtaaatcgccagtaaaATGGCATACGCAGTTCCGTGATTTGcctaagttgccttgagaggaaacgttGGGTGACTTTGGCTATTcgcagtgccgcgtatgccatcccaccggcagcccgtgggatggcattgcaacaatgaagatttgtcacgctGTGATTAATCTCCCCCAGtgccttgcatatttttacatcccagattaaatctcatctgccacttagctgcccacattgccagtttgtcaagatcctgctgcaaggatgccacatcctggatacaattgactgggctgcagagttttgtgtcatctgcaaacactgatacattgcttataatacccacccctaagtcattaatgaacatgTTAAACAAAACAGatccctgagggaccccactgagaaccttacttcaagtagagaatgtaccattaacaaccactctgtgtacccgatcctgtagctagtttcctatccatgtgcaaacggcttaaCTTAGACCAACAGACCTTcatttagaaagcagtcatttgtgggcaTGGTATCAGATGCTTTGGCAAATTCCAAATAGATTGCATCTACtgcatttgtctgacatgacctgtccttcataaagccatgctgattactgctcataatgccattctccagaacataatatatgtgatcccttaacaagcctttaaaccatattgttaccataattcagtAGGGCCACGCTCTCAACcttcatctttttactattaatatgctTAACCTTTTTGGGGTGAGTATTAGCCTCTGCCAAAAATGCACTTCTGATTTTCTATATTTCCCTTCTGGATTgatgttttacaacacttgttacagtgtttattaaATGCAGCTTATGTCCCCTTTGACTTatgttttttaaatgctttccttttttttcctatttcccTTTACCTTTGAAtgaagccacatagggtgattcttaacacttctacatttactacttaatggaataaattgagaacagtaatgacttaatatgattttaaatgacaaccatttctgttctgtgtttttagaagaaaacataatgccccaatcaaTGCTCTGAAGCACTGtcctttaaggagctaaaatttgcttttctaaaattcagagtCTTTGTTGCCCCTGTGTATTTTGCACCAAATATCAAATGAAAGATTATTTTGGTCACTGTTACCTAGAGATAACTGATGTATGTTTCAgggaatttttgttttgttcctcCACCCCTACactaggcccggactggcaatctgcccATTTgggctcttttttattttaaagtgggcCATTCAGTTGGATCTTAAAATCTAATTAGATGCAAGAGCATCGCCACACTTGCCTAAACCTTTACCACTAGGGCCACAGGTGCCAGTCCTCTCTTGTAAATTTCCTACTACCATGAACTATTTGCGTTACTTTTTGCAGTAAATCGTAGGACTTGTTCATTCCTCCTTCTTCATTCGCCTCTCTGAATATTGTCTCCTGCTCTGCTTTCcgcttttaaagtgatactgaaactaaaaaatgactcttcaaaatatgaatgtacattaagaGTTtcttataggtcatgttaatcattttttgctacttgaagttcctaaacctgactgttttgccaacctgactgtctcttctcaacCTGTccgttacagcttctaatgctaatggactcctgctgcacaaagcATTTGGCAAATatgataaagctcatgcaaagacaatgttatgatagatgcaAAACAAGGTTTAAGTTTtggtgtcggtatctctttaagaaTACCTCCCCCTTCCTTCTCAATGGATGGTCTGCCTCATCCCTCCACAACATAATATATGAGCCACCCCCCCTACTTTGCCTGCACTGAAACAAGCCTTCCCCTGCTTCTGCTCTGCTGCATTTACTTGTCTGTGCTTAACCCTTAGTTATTTAACTTGCCTAAACCCTGCAAATTTTCCCTCGCTCAGCCAACATCTGATCTCTCTGTTCATGTATCTTAAGCCCTATTCACTATTTCTGGCTTAAATCCATTTCAAATCAACACCTCTTCTATCCAATGTTTCATCAGATTTTGAATTTTTCTTACTGGCATTTCAAGGTTTAATGACGATTACTTATTTTCTGATGTGGTTACTAGCATTTTTGGTGTTAATGCTGATATTTCATTCTTACAGTGACTACTAGCATTTGATTAGCAGTGACTCAGTATTTAAAGTGCAAATGGAAGGGGTGTTGCTGAATAATGTTGTTGGTAATAAACATGGAAATAGCAAAATGGTGTTGCTTTAAAATGGTCCAAACTAGAAAGTGTTGCGAGGCTTATTATAACTGTGGGTGGGGCATTGCACATTgcgtcgatttttttttttttttttttttttttgctagagcTCCTTTTTACTCCCAGTCCAGTCCTGCCCAATACTGATGTGCAGAAACACTTTATCATAGCATGCAGGGAGTTACACAAAGAAACAGCAGCACAGCTGTTGTTTTGGGATTGGAGAAGTAAATGTCAAGCTCTGGAGAAGTTAATGCCAAGCTCTCCAATCCAATATCAACATGCACTACACACTGCACTATGTCATTGggtgataaaagaaaaaaacacagctaCTATTGTTGGGGAACTTGATACTGATGTGGGATGTAAGTGAAAAACCAGCATCGTGACAATTTTCTCTATACAgcacaatatttattttctttgtctaTTGAAGCcgttttttgcagcaaaacctggtgaaaattttttgctcatcactagctgctgCTTCTCTAATTGAACGATTTCACACATACTTGTCAGATTgctaatagatttttttttttttactctgtgcTAGTGCTAAACTTCATGATTTTGTAGTTTCTGTGTACAccatgcctgaagcagggacctaaATAGTCCAGaaagcaagcattttttttttttaatctgcttaGTTAGCTTAAAAAAGGTATCACCTTCTCAATTTTTTCTGGTTTTGTTCACAGGCATGTTTAAGCCActgattcgagtcctttagaccaatgcTGTCTAACTGGCAGCCTGGAACTTGGGCTGCTGTTGCAGAGTTCTGTTTATTACTTGATGACATCACTAGAATATGCTAA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Gene model

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								ATGGACTGTatCACCTGCTCTCAGAGGTTTAGAATGGATGTGGTGTCTACTGATGTTAACAATGTCCTCCCTGATGAGATTATGGAGACAGGAATTTCCTTGGTGGATGATGACAGCATTGAAGCTATCACAATATCCTCGCCTATGGTGGATGAAGCCCCCATGGAAACAGAACTGGAGCGCATTGTGGAAGTGAGCAGTAGTGGTGAATGTGTTTCTACAGCAGTAGTGAAAGAAGCAGTTGCATCAACTAGCAACAATGCTGGACACTTAGCAGTGGTTAGTGTTGCTTCAAAGCCAGAATCTGGACCTTCAGCCGCAGCCATGAAAACTGTATTACAGACGCACTTTCACAAACTGGCTACTCCTATATCTGGTCAGGTGGTACTTAATAAGGTTTCACAGGCTTCTGATCTTACAGCCGGAAGTCATGTTGTGAAGCAGGAAGGGCAGAAACTGATTGTTACAACTCTGGGAAAATCAAGCCACCCCATTGTTCTGACATTGCCACAGAGTCACATTGGAAATGCACAGACACCAGTTACTCACGTTCAACGTATAGAATCTAAAGTGACACCACAGCAGATTAAGCTTGTAACCATCGGTGGAAACAGATCTGATGGAAATCCTGTCCTTGGAATGTCTGCATTAACATCTGCACAAATCATCAGCCCCTCTACCAAGTCCCCAGTGTTACAGACCCAGCAGATCAAGACTTTACAGattgCAAAAAAAGCTCCTACATCATCTGGGCCGGTGATTACTAAGCTGATCATTGCAAAGCCTTTGAATAGTAAACCACTCACAGAGCAGACTACACAAATAGCATCTTCTTTTGCTGGAGGTCCAGCCCTCTCACAAACTAATCCTGGAACACCACCCAAAGCATTAAACATTGCTGATATTGGAGTGATTGGTACACCCTCAGCTAAAACTACAAACAAAATTGCTATATCACCACTGAAATCTCCTAGTAAGGGTGTAAAATCATCTGTTGGCGGCATCAACACACCTCAGTTTAAGACCATAATTCCTCTTGCTGCTGCCCCAAATGTTCAGCAGATCCAGGTTCCTGGAAGTAAATTTCACTATGTCCGGCTTGTCACAGCATCTACAGCCAGCAACACAACACCGTCCAGCCAGATCCAAAGCACCAGCACGCAACCTCTACAGCAAGCTAAACCAGTGGTTGTTAATGCAACGCCTGTGAGGATGTCTGTTCCCATTATTCCAGCACAGACTGTCAAACAAGTTGTTCCCAAGCCATTAAATGCAGCTTCCCAGATTGTCACAACAAGCCAGCCACAGCAGCGGCTTCTTATGCCAGCTACGCCACTTGCACAAATACAGCCCAGCCTTACGAACCTTCCAGCAGGCACTGTGTTAGCCTCTGCACCAGGGACTGGAAATGTAGGTTATGCTGTCCTACCTGCTCAGTATGTCACTCAGttgCAGCAGTCCTCGTATGTTTCTATAGCAAGCAATGCAGGGTTATCAGGAACAACAGCTGCTCAGAATCAGCCAAGAGGGCCATTGAATGGGATCATTTCTTCGGAGTCAGCAAGTCGTCCAAGGAAACCATGTAACTGTACAAAGTCTTTATGTCTAAAGCTGTACTGCGACTGTTTTGCCAATGGAGAATTCTGCAATAACTGCAACTGTACGAATTGCTACAATAATCTGGAGCATGAAAATGAACGACAAAAAGCAATCAAGgcatGCTTGGATAGAAACCCAGAAGCATTCAAGCCAAAGATTGGCAAAGGAAAAGAAGGAGAatctgacaggagacacagcaaGGGCTGCAACTGCAAACGTTCAGGCTGCCTTAAAAACTATTGTGAATGTTATGAGGCTAAAATTATGTGCTCTTCAATATGTAAGTGCATAGGCTGCAAAAACTTTGAAGAGAGTCCAGAGCGTAAAACATTGATGCATTTGGCAGATGCAGCAGAAGTGAGGGTTCAGCAGCAAACTGCGGCCAAGACAAAGCTTTCCTCACAGATATCTGATCTACTTACCAGACCAGCACCACCAATGAATAGTGGAGGTGGCAAACTCCCTTTCACGTTTGTAACGAAAGAAGTAGCAGAAGCAACATGTGAATGCCTCTTGGCCCAAGCAGAACAGGCAGAAAAGCAATTAAAATCGAAGGCAGCCACTGAACGAATGATCCTGGAGGAGTTTGGCCGCTGTTTAATGAGAGTGATTAACTCTGCAGGAAAAGCAAAAACTGACCCTTGTCCCATGAGTTGCTAA

Entrez Gene

780045

mRNA

RefSeq

>NM_001079122|Xenopus tropicalis lin-54 DREAM MuvB core complex component (lin54), mRNA
								CGGATCTTTCGAAACACAATCCCGGCCCCTGACATTCCGGGAGAGTCTACACAAATACCCGAGGAACGGATAGTCGAACAATAACAATCGTTCCGGCTTCACGCTTTCGCTGGATCAAATTTGGGTTTTCCTCCTGGCTTTATAGGAGACGGACCGGCGCCTGATTCCCCGCCTTGCAGACTCTCTACATAAGCACAAATAAAGAGTTGCGGCGGGCAACCCCGTTCTGTGGATCTACAGACTGGAGGAAACCCAGAGATCACCTGCTCTCAGAGGTTTAGAATGGATGTGGTGTCTACTGATGTTAACAATGTCCTCCCTGATGAGATTATGGAGACAGGAATTTCCTTGGTGGATGATGACAGCATTGAAGCTATCACAATATCCTCGCCTATGGTGGATGAAGCCCCCATGGAAACAGAACTGGAGCGCATTGTGGAAGTGAGCAGTAGTGGTGAATGTGTTTCTACAGCAGTAGTGAAAGAAGCAGTTGCATCAACTAGCAACAATGCTGGACACTTAGCAGTGGTTAGTGTTGCTTCAAAGCCAGAATCTGGACCTTCAGCCGCAGCCATGAAAACTGTATTACAGACGCACTTTCACAAACTGGCTACTCCTATATCTGGTCAGGTGGTACTTAATAAGGTTTCACAGGCTTCTGATCTTACAGCCGGAAGTCATGTTGTGAAGCAGGAAGGGCAGAAACTGATTGTTACAACTCTGGGAAAATCAAGCCACCCCATTGTTCTGACATTGCCACAGAGTCACATTGGAAATGCACAGACACCAGTTACTCACGTTCAACGTATAGAATCTAAAGTGACACCACAGCAGATTAAGCTTGTAACCATCGGTGGAAACAGATCTGATGGAAATCCTGTCCTTGGAATGTCTGCATTAACATCTGCACAAATCATCAGCCCCTCTACCAAGTCCCCAGTGTTACAGACCCAGCAGATCAAGACTTTACAGATTGCAAAAAAAGCTCCTACATCATCTGGGCCGGTGATTACTAAGCTGATCATTGCAAAGCCTTTGAATAGTAAACCACTCACAGAGCAGACTACACAAATAGCATCTTCTTTTGCTGGAGGTCCAGCCCTCTCACAAACTAATCCTGGAACACCACCCAAAGCATTAAACATTGCTGATATTGGAGTGATTGGTACACCCTCAGCTAAAACTACAAACAAAATTGCTATATCACCACTGAAATCTCCTAGTAAGGGTGTAAAATCATCTGTTGGCGGCATCAACACACCTCAGTTTAAGACCATAATTCCTCTTGCTGCTGCCCCAAATGTTCAGCAGATCCAGGTTCCTGGAAGTAAATTTCACTATGTCCGGCTTGTCACAGCATCTACAGCCAGCAACACAACACCGTCCAGCCAGATCCAAAGCACCAGCACGCAACCTCTACAGCAAGCTAAACCAGTGGTTGTTAATGCAACGCCTGTGAGGATGTCTGTTCCCATTATTCCAGCACAGACTGTCAAACAAGTTGTTCCCAAGCCATTAAATGCAGCTTCCCAGATTGTCACAACAAGCCAGCCACAGCAGCGGCTTCTTATGCCAGCTACGCCACTTGCACAAATACAGCCCAGCCTTACGAACCTTCCAGCAGGCACTGTGTTAGCCTCTGCACCAGGGACTGGAAATGTAGGTTATGCTGTCCTACCTGCTCAGTATGTCACTCAGTTGCAGCAGTCCTCGTATGTTTCTATAGCAAGCAATGCAGGGTTATCAGGAACAACAGCTGCTCAGAATCAGCCAAGAGGGCCATTGAATGGGATCATTTCTTCGGAGTCAGCAAGTCGTCCAAGGAAACCATGTAACTGTACAAAGTCTTTATGTCTAAAGCTGTACTGCGACTGTTTTGCCAATGGAGAATTCTGCAATAACTGCAACTGTACGAATTGCTACAATAATCTGGAGCATGAAAATGAACGACAAAAAGCAATCAAGGCATGCTTGGATAGAAACCCAGAAGCATTCAAGCCAAAGATTGGCAAAGGAAAAGAAGGAGAATCTGACAGGAGACACAGCAAGGGCTGCAACTGCAAACGTTCAGGCTGCCTTAAAAACTATTGTGAATGTTATGAGGCTAAAATTATGTGCTCTTCAATATGTAAGTGCATAGGCTGCAAAAACTTTGAAGAGAGTCCAGAGCGTAAAACATTGATGCATTTGGCAGATGCAGCAGAAGTGAGGGTTCAGCAGCAAACTGCGGCCAAGACAAAGCTTTCCTCACAGATATCTGATCTACTTACCAGACCAGCACCACCAATGAATAGTGGAGGTGGCAAACTCCCTTTCACGTTTGTAACGAAAGAAGTAGCAGAAGCAACATGTGAATGCCTCTTGGCCCAAGCAGAACAGGCAGAAAAGCAATTAAAATCGAAGGCAGCCACTGAACGAATGATCCTGGAGGAGTTTGGCCGCTGTTTAATGAGAGTGATTAACTCTGCAGGAAAAGCAAAAACTGACCCTTGTCCCATGAGTTGCTAAGTTTGACGAGCCTGACCCTACATTTTTTTGACATGGAAGTATTTGAACAAGGTGGAGATGCACAAATAAACACTGCCAGGGATTGCTTGAGGACTTTAGCCACTGCTTTCTTCTATCCATTGAATTTATGGGTCTATAAAATGGTGCTGGTTTTAATGGGACTTTCTTCACTGTAAATTAAGCAAGCTGAGATTTTATTATAAAGACTTCCTTTTAAATCTTACTGTTTTCTCCTTCTACAGTGTTTCAAAGATGACGACACCTTAATGGTGCAATTTTTTCCCCCTATTTTATATGTGTCACTTTTTTATTTTTTGTGTTTCCAGTTAAAGAACATTTTTTTTTTGGACCTAACCGTTTAATAGCAAAAATGCATCTTGCAATATATTAATCTTCCATAAACAAATCAAAGATATTCTGTCACGAGGTGTGTTTATCAATTAACATACAATTTGCACACTGGTTAAATGTATAAAAGGGAATAGTTAAGGCAGATGCATTAAAAGATATAAATCCAGATAGGAATTCAAAGAGTCTGATCTTTATATTAATTGTACAATTATATTTTTAAGATTGCTTATGCCTGTAACACATATCAAATGTTATACCAGCAGCTACACAGATTTTAGTTATTCTGATTTTCCCCAGTGTATAAACTGTCACATACTGCATCTACATATGCAAATATTCATGATATATTTTTATGTAATTTTCCATGTTGATTAAAAAGTGGATTTGCAGATGAATGTTAAAAAAAAAAAAAAAAA

Protein

RefSeq

Swiss-Prot

Genomic

tropicalis

laevis.L

laevis.S

Genome Browser

(Click image to open in Genome Browser)

Genomic Synteny

Genomicus PANTHER

Expression

Development Stages

Embryonic Tissues

Adult Tissues

Summary for

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Xenbase Expression Details

In situ images

Single cell data at SPRING

Ensembl

Data Mining

tropicalis

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XenMine

lin54

lin54.L

lin54.S

Orthology

Knowledgebases

Entrez Gene

Genetic Phenotypes

Gene Expression

human

HGNC AGR, OMIM:Gene, GeneCards

LIN54

OMIM

Ensembl, Allen Brain Atlas, Protein Atlas

mouse

MGI, AGR

Lin54

MGI, IMPC

Ensembl, Allen Brain Atlas, Eurexpress, MGI

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