fam102a Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis] - Xenbase Gene Catalog

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Interactants (0)

XB-GENEPAGE-5892602

[provisional- machine annotated only] Gene Symbol: fam102a [Predicted: Source is Human Entrez Gene] Gene Name: family with sequence similarity 102, member A [Predicted: Source is Human Entrez Gene] Add Xenopus synonyms Gene Function: Interactants:

XB-GENE-5892603

XB-GENE-5892622

Molecules		tropicalis	laevis
Gene		JGI XT Genome 7.1 JGI XT Genome 4.1 Ensembl 4.1	JGI XL Genome 6.0
		Entrez Gene	Entrez Gene
mRNA		Refseq >NM_001097168\|Xenopus (Silurana) tropicalis family with sequence similarity 102, member A (fam102a), mRNA CACTGGCTGAGCTACAGCAGCTACAGGAAGGAGAGGCAAGAGAACGTTCTCCCCAAAGGCTCTATATATGTCCCCCTGGCACACAGATTGGCTAGTGTGAGCACATTGGCTGGCAACATACGCTGCACCACAGGCCTGCTCTGGACTTATACAAGAGGACTTATCCCTTGACTGAGGGAGACGACAAACAAGAGTGAGTTTTGAAGACCCCCAATCTCTGCTGGTTTGGAGCGTGCGGGTCCACTCCTCCTACCCCTGGAGATGCTCCAAAGATTCTACCTCTCCTCAGTGAAATCGTGTGGCATCCGTTCCCGAGGGAGGGCCGGCCATCCCAGGCACAGATACATAGAAGTTGACGGACGATAAAAGAAGATCAGAAAAATTCCATAGCTTTTGACTTTCCTTTTCTCCCTTCTCCTAGAGAAACATTCCTCCCCAACCCCCAGTCTTCTCCTTTCCATCTGCTTTCTCTTAAGCCAACAACACCTTGAGAATTTCTTTCACTTGGTGGGGGGGTCACTCATGGCTTTTCTGACCAAGAAGAAGAAATTTAAATTCCAGACCAGCTTTAACCTGGAGGAGCTGACGGCTGTCCCATTTGTGAATGGGGTCTTGTTCTGCAAAGTCAGACTGCTGGATGGAGGAGACTTTGTCAGTCAGTCCAGTAGGGAGGAGGTGCAGGAAAACTGCGTACACTGGAGGAAGAAGTTCAACTTTGTGTGCAAGATGAGTGCTAACCCTGCCACTGGTGTGCTGGACCCCTGCGTCTGCAGAGTCTCTGTGCGAAAGGAACTGAAGGGAGGAAAAACATATTCAAAGCTGGGCTTTGCTGATCTCAATCTGGCTGAGTTTGCTGGTTCTGGTTCCACAGCCCGCTGCTGCCTGCTGGAAGGTTATGATACCAGGAACACAAGGCAGGACAACTCCATTCTAAAGGTAATTATTGGGATGTCGCTGCTCTCTGGTGACCCGTGCTTTAAGACACCTCTATCTACAGCCAAAACAGTTTCCCCTCCAGGACAAGACTCCTCATTACAGATGACATGTAAAGGGGAAGGGACTGTGAGATCAGCGGGTGGCACCGTACGGCAGAACCGAAGCCGGCAGGCTATGCTGAGCTCAGGTGGATTTGACGAAACCGAGCAAAACCTATCGAGCCCAGAGGAAACGTCCCATTCAGGGCATTCCCGGAACTCTAGCCAGGCCAGTCAGCAATCAAAAGTGTCAGGTCACAGTTCTGAACATTCTCGCTGCTCCAGCATGTCCGACCTGACTCACAGGCGTAACACGTCCACCAGCAGTAGCGTCTCAGGGTGTCTCAGCCTCACAGCCGACGGGACTGAACCCGAACGAGATGTTAAGCTGGAAAAGCCTCCACGGCCTATTCGGCCTCCCCTCCACTCAGACAGACACTCCAGGAGGAAGAAAGACTCTGTAGAGAGTCGGCCCACGTGGGTAGATGACACCAGGATTGATGCTGATGACATTGTGGAGAAGATCATGCAGAGTCAAGACTTCACAGACGTCAGCAACAACGAAGATAGTCACCTAAGACTGTTTGTCAGTAGAGATGGATCAACCACTCTGAGCGGGATCCAGCTTGCTAACAGGGTCTCGGCTGGAGTGTTCGAGCCTGTGGTGATTGAAATCCGCTAAATGGAAGAGAGACAAAGGAACTGTCCGCACTCCCAGGCTCTTTCCAGTTCTAGAGTACAAAGCTGGAATCTTTCACACCAGAGGAGAGACGGGACTTCGCATATTTTCTAAGGCTTGACAGTTCCAGTCAGCCACTGTGGTTCCTCCCCTCATCTTGGCCCCTGTCCCAGTAGCTGTGCATGACTCCCCATGTGTTTCTTTTATCCACTTTGTGACAGCGTTCCTGCCTGCTTCTAATCACTGTGAGTTTAACCAGGCATCTGGAGAAAGAGGCCACAAATCCAGATGCTCAGCATTCCACACTCTGGCTGCTTCTCACATTGCAGCGGCCTCTGTTTTGCTTGCCTAGCAGAAGATAGAGCAGTGATCCCCAACCAGTGTCTCGTGAGCAACATGTTCACCGACCCCTTGGATGTTGCTCTCAGTGCCCCCAAACCAGGTAGTTATTTTTTAATTCCTGACTTGGTGGCAAGTTTAGGTTGAATAAATACTACCAAATAAAACCCCCTGTAAGCTAATAGTGAGCATAGCGGCTGCCTAATAGCCAATCTTAGCCCTTATTTAGCACCTCCATAAACTTTTATGGTGCTTGTGTTGCTCGCCAAGTCTTTTTAAATTTGACTGTGGCTCACGAGTAAGAAAGGTTGGGGACCCCTGAGATAGAAGAAAACTAAGCATGATTCCAGTGCTTGCAACCCACAATAATACAGTGGACTCTCTGACTGTCCCTTTAATACTTTCAGGGCCAGTAGGCCAGCTGTGCTGTACAAGTCCTTTTGGTCTTGGAGATGTTAAAGGGACCTTTTACTTCCTATAATGTTGCAGTCTCAGAATCACTGGCACAGTGACCTGCTGACTACAGACAATAAATGTGAGAATACCTTGGAGCAGATTGAATAGAATCAATCTGTTTCCAAATTGTACTGCACAGGGCAGCATTAAGGGAGTGGTTTAAGAACCCCCTTCTGTTCCTGGATATGCAGCTTCACATATTTTGCCACAGACAACTGCTCAGAGAGATCCCAATGAGCCCATTAGCTTACAGTCCCTGCTTCCCCCTTACTAAACGGTACCACTGCTTTCCGCTTTTTCAGGTTAGGCGGCATGACTTTGTCCTGAGTCCTGTATCCACCCCCTCCACCCTAAATAAAAAAGACGAGAGTTGTCAGTACAGAACAGCAAAAGTTCCCTAAAATAGGCCACATTACACAGCTGGACTGTTTAAGCATTAAGAGTCCCCTCGGGCAGGGGTACATGATGCAGCTGGTCTGCGGGCACCCTCGGGTAGGGGCCATGTAAGGCAGCTGGTCTGCATTTAAACCTTAAGGCCTCCTCGGGTAGGAGAGATGAAACACAGCTGAGCTGTGAGAATCCTTTAAGGGAGCATACCTATTAAATGGAATGACTGTTGGGGGGAGACATTGCTGGTCGACGAGTCCCCCACTTCAGATATGGACCTCCAGAATCTCCGGTTAGATATGGAGGGCTCAGCTATTCTGTACTGCTACTTTCTCAAACACATTCCAGTGCATGAAAGGCCTAAGAGAAAGCCATCGGTAGGGGGTTAGCTGTGCAGGTCACAGCGGCTGCCTCCCAGGACTCAGTCATGCCTGATATTCCCTGGCCATTCCCCTTCTAACTTGGTGAGGACTGCACAGCTCTTCCAAGAACCAGCAGGCTGGTGTTATCATTTCACTTATGTGTCTTACCTACATTTTCAATGTGAACCTCCTTCTCCTTGACTTGGGTTTAATCCTTCTGCGGAGCCATCTGGGATTTTGGGGTTTTTGTGTGTGTGTTTTGTTTCTTTTCTGTAGTTGCTTTTGTTGTTGTTAATGGGTGAAACTAGGAGCCTTGGAAATACCGCCACTGTTTCTGGTTTATTGCGGCCTACTGCAGCTGCCCAAGGTGAATGTATGTGATGCTCCCGCCACTACTTCCCCTTGATTTTGAGACACGGCATATGCCTTTTTGGTTTAGAGTTGAAAATGAAACCCATACATGGGGCCGACAGCCAGGCCGCCCTCCCGCGTTACTTTTGTTGTTCTAAATGGAAACCACTCTTATGTTCTGGGCACTTTAATGATTGTTGGACACGGTGCAGGGATTTTAATGAAACGTTCTTGTTCAGAGCTTGATTTAAGACTACAGAAGAAGTCTTTAAGGATTATTTTTATTTTCATTTGTTTTTATCTTTTTTCTCCCTCCACTGCAATCATGGCTTTAATTGAATTTGGGTGACATAGCACTTACGGAGCTCCCTAACCTCACTGCTATACCTACTGTGCTCTTTGGGAAGTGTTAATGCTCAGGGTATGTTTATGGTGATGTGCAGAGATGACGAGTCTGTTTTATTTGGGTGTGGCTCACAGCCTGCATCATTTACCAGCTTATTACAGAACTGGGCGACATAGCAGTTTTGTATTGACTGTACAGTCACAGAGGTAATTTTGTCTGACGAGAGGCCATAACCACGGCACAGCCCTTCTGCACATTGGCAAAAGTAGGGCATAAAAGGTTTGTTATGTTAAACTAAGCTAAAAAAAATACCGTATTTTTTTCTATTTTGTTTGCACAACCCCCTCAGGAGTCTTAACAGCTAGAGAGGTCAGAGCAACCCTCTTGGACCTACTGAAGCCCACAGCATGGCTGCTGAGCTATTCTAGTTGAGTATAATCGCTGCTCACAGGTGTCTGCAGGCAGATCTGGACTATGGCATTAACCAAGCTATCTAAATATTCATGGCAGACTTAGCCATTCTAAAACTAACGTTTCTAACTAGGGGCCAATCTTATGAGACAGAGATAGTGCCAAATGGTCTAGAGGTTAAAAAGGTTTATAGTGGAAAAAAAAAAAAAAA	Refseq >NM_001092420\|Xenopus laevis family with sequence similarity 102, member A (fam102a), mRNA 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Protein		Refseq >NP_001090637\|uncharacterized protein LOC100036602 [Xenopus (Silurana) tropicalis] MAFLTKKKKFKFQTSFNLEELTAVPFVNGVLFCKVRLLDGGDFVSQSSREEVQENCVHWRKKFNFVCKMSANPATGVLDPCVCRVSVRKELKGGKTYSKLGFADLNLAEFAGSGSTARCCLLEGYDTRNTRQDNSILKVIIGMSLLSGDPCFKTPLSTAKTVSPPGQDSSLQMTCKGEGTVRSAGGTVRQNRSRQAMLSSGGFDETEQNLSSPEETSHSGHSRNSSQASQQSKVSGHSSEHSRCSSMSDLTHRRNTSTSSSVSGCLSLTADGTEPERDVKLEKPPRPIRPPLHSDRHSRRKKDSVESRPTWVDDTRIDADDIVEKIMQSQDFTDVSNNEDSHLRLFVSRDGSTTLSGIQLANRVSAGVFEPVVIEIR	Refseq >NP_001085889\|protein FAM102A [Xenopus laevis] MAFLTKKKKFKFQTSFNLEELTAVPFVNGVLFCKVRLLDGGDFVSQSSREEVQENCVRWKKKFNFVCKMSANSATGVLDPCVCRVSVRKELKGGKTYSKLGFADLNLAEFAGSGSAARCCLLEGYDTRNTRQDNSILKVNIGMSLLSGDPCFKTPLSTVKTVSPPGQDSSLQMTCKGEGTVRSAGGTVRQNRSRQAMLSSGVFDETEQNLSSPEETPHSGHSRNSSQASQQSKISGHSSEHSRCSSMSDLTHRRNTSTSSSVSGGLSLTAEGTEPERDVKPEKPPRPIRPPLHPDRHSRRKKDSVESQPTWVDDTRIDADDIVEKIMQSQDFSDVSNNEDSHLRLFVSRDGSTTLSGIQLANRISAGVFEPVMIEIR UniProtKB

Genomic		tropicalis
Genome Browser		Xenbase	Xenbase JGI Ensembl UCSC		Xenbase

Synteny		Metazome

Expression		tropicalis	laevis
UniGene		Str.38256 [+] Str.51418	Xl.16294 [+] Xl.13834
Unigene EST Profile		EST Profile	EST Profile
GEO data			GEO
Images		0 expression image(s) for tropicalis and laevis

Orthology		MOD	Entrez Gene	Genetic Phenotypes	Morphants
human		OMIM:Gene, HGNC	FAM102A
mouse		MGI	Fam102a
zebrafish		ZFIN	fam102ab

Publications
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Functional Ontologies
GO: Molecular:
Biological:
Cellular Component:
EC:
KOG:

Reagents		tropicalis	laevis
Clones		open biosystems	open biosystems
		geneservice/RZPD imagenes	geneservice/RZPD imagenes
Affymetrix 1.0		Str.51418.2.S1_at [+] Str.51418.1.A1_at Str.38256.1.A1_at StrEns.7536.1.S1_at	Xl.16294.1.A1_at [+] Xl.13834.1.A1_at
Affymetrix 2.0			Xl2.16294.1.S1_at [+] Xl2.13834.2.S1_at Xl2.13834.1.A1_at

Symbol legend[+]