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XB-GENEPAGE-
920764
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Gene Symbol: itpr1
Gene Name: inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 Synonyms: ip3r , xip3r Add Xenopus synonyms , Nomenclature history Gene Function: calcium-release channel activity Protein Function  :
Interactants: YYY OMIM Disease Associations: SPINOCEREBELLAR ATAXIA 15; SCA15 SPINOCEREBELLAR ATAXIA 16, ... |
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| Xenbase Gene ID | XB-GENE-920765 | XB-GENE-17341555 | XB-GENE-920773 | ||||||||||||||||
| Gene Symbol | itpr1 | itpr1.L | itpr1.S | ||||||||||||||||
| Chromosome | Chr04 | Scaffold155038 | |||||||||||||||||
| Molecules | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Gene | GBrowse 8.0 JBrowse 8.0 GBrowse 7.1 JBrowse 7.1 GBrowse 4.1 JGI Genome 4.1 Ensembl 4.1 | GBrowse 7.2 JBrowse 7.2 GBrowse 6.0 | |||||||||||||||||
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Entrez Gene
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Entrez Gene
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| mRNA |
NCBI Nucleotide
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Refseq
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| Protein
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NCBI Protein
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Refseq
TrEMBL
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| Genomic | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Genome Browser |
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| Links |
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| Genomic Synteny | Genomicus Metazome | ||||||||||||||||||
| Expression | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Ensembl | Ensembl | ||||||||||||||||||
| UniGene | Str.9352 | Xl.101 | |||||||||||||||||
| RNA-Seq profile | Stage profile: |
Stage profile:
Tissue heatmap:
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| Images | 1 expression image(s) for tropicalis and laevis | ||||||||||||||||||
| Data Mining | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| XenMine | itpr1 | itpr1.L | itpr1.S | ||||||||||||||||
| Phenotype | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| Smith Morpholino Screen | |||||||||||||||||||
| Orthology |
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| human |
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| mouse |
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| zebrafish |
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| chicken |
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| fruit fly |
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| worm |
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| Publications | |||||||||||||||||||
| First: |
The Xenopus IP3 receptor: structure, function, and localization in oocytes and eggs. [Cell 1993]
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| Most recent: | Comparison of gating dynamics of different IP3R channels with immune algorithm searching for channel parameter distributions. [Phys Biol 2016] | ||||||||||||||||||
| View All Papers | |||||||||||||||||||
| Functional Ontologies | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| GO | 0 term | 0 term | 4 terms | ||||||||||||||||
| EC | |||||||||||||||||||
| PANTHER | itpr1 | ||||||||||||||||||
| KEGG Pathways | K04958 | ||||||||||||||||||
| KOG |
[T] Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor
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| Reagents | tropicalis | laevis.L | laevis.S | ||||||||||||||||
| CRISPR / TALEN | CRISPR tools | CRISPR tools | CRISPR tools | ||||||||||||||||
| Clones | |||||||||||||||||||
| GE Dharmacon | GE Dharmacon | GE Dharmacon | |||||||||||||||||
| Source BioScience | Source BioScience | ||||||||||||||||||
| Antibody | Itpr1 Ab1 , Itpr1 Ab2 | Itpr1 Ab1 , Itpr1 Ab2 | Itpr1 Ab1 , Itpr1 Ab2 | ||||||||||||||||
| Affymetrix 1.0 | Str.9352.1.S1_at [+] | Xl.101.1.S1_at | |||||||||||||||||
| Affymetrix 2.0 | Xl2.101.1.S1_at [+] | ||||||||||||||||||
Symbol legend[+]
