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Larger Image Fig. 2. Assignment of linkage groups to Xenopus tropicalis chromosomes via FISH-TSA using following cDNA probes. LG1: 1a.pias2 (q 0.95), 1b.cabin1 (q 0.54), 1c.dao (q 0.48), 1d.adh1b (q 0.22), 1e.camk2d (p 0.25), 1f.exoc1 (p 0.54), 1g.whsc2 (p 0.78). LG2: 2a.trit1 (q 0.28), 2b.uspl1 (q 0.75), 2c.pan3 (q 0.76). LG3: 3a.jhdm1d (p 1.00), 3b.phf15 (q 0.10), 3c.fgfr4 (q 0.26), 3d.chd3 � cluster F (q 1.00). LG4: 4a.sox6 (p 0.96), 4b.ext2 (p 0.83), 4c.acp2 (p 0.68), 4d.rasgrp2 (p 0.23), 4e.adamts18 (q 0.14), 4f.e2f4 (q 0.32), 4g.mast2 (q 0.45), 4h.pcsk9 (q 0.47), 4i.dmap1 (q 0.48), 4j.rybp (q 0.87), 4k.ppp4r2 (q 0.90), 4l.ptprg (q 0.96). LG5: 5a.tram2 � cluster A (q 0.88), 5b.ap2m1 (q 0.47), 5c.myo6 (q 0.35), 5d.cdc40 (q 0.25), 5e.crim1 (p 0.26), 5f.ttc27 (p 0.30), 5g.cyp1b1 (p 0.41), 5h.prepl (p 0.77), 5i.bre (p 0.93). LG6: 6a.atp6v1h (q 0.55), 6b.b4galt6 (q 0.54), 6c.fignl1 (p 0.24), 6d. Xt7.1-THdA017i08.3 (p 0.65), 6e.mpp7 (p 0.68), 6f.csrnp1 (p 0.85). LG7: 7a.nop2 (p 0.92), 7b.gpr123 (p 0.59), 7c.got1 (p 0.46), 7d.mfn2 (q 0.14), 7e.cbl (q 0.43), 7f.tbcel (q 0.43), 7g.fut1 (q 0.78), 7h.agmat (q 0.95). LG8: 8a.glipr2 � cluster 5B (p 0.92), 8b. ENSXETG00000000667 (p 0.83), 8c.dusp9 (q 0.04), 8d.smc1a (q 0.04), 8e.nr6a1 (q 0.09), 8f.rps6ka6 (q 0.36), 8g.f9 (q 0.40), 8h.zfp36l1 (q 0.78), 8i.mef2d (q 0.90), 8j.rhbg (q 0.92), 8k.ubqln4 (q 0.93). LG9: 9a.smarcal1 (q 1.00), 9b.znf142 (q 0.98), 9c.tbr1 (q 0.74), 9d. MGC145260 (p 0.58). LG10: 10a.map2k4 (q 1.00), 10b.src (q 0.68), 10c.nmt1 (p 0.28), 10d.hoxb3 (p 0.51), 10e.sp2 (p 0.53), 10f.taf4 (p 0.75). Image published in: Wells DE et al. (2011) © 2011 Elsevier Inc. Creative Commons Attribution license Permanent Image Page Printer Friendly View XB-IMG-83615 |